以复杂多倍体植物为例的常规基因组分析流程搭建
| 目录 | 第6-8页 |
| 致谢 | 第8-10页 |
| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 1 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 全基因组测序 | 第13-21页 |
| 1.1.1 测序技术的发展 | 第13-16页 |
| 1.1.2 全基因组测序的发展和现状 | 第16-17页 |
| 1.1.3 植物基因组测序分析面临的挑战 | 第17-21页 |
| 1.2 稗草基因组 | 第21-22页 |
| 1.2.1 稗草概况 | 第21页 |
| 1.2.2 稗草全基因组测序 | 第21-22页 |
| 1.3 研究目的及意义 | 第22-23页 |
| 2 基因组拼接结果评估 | 第23-31页 |
| 2.1 前言 | 第23-24页 |
| 2.2 基因组拼接质量评估方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 基因组大小估计 | 第24-25页 |
| 2.2.2 基因组拼接长度估计 | 第25页 |
| 2.2.3 质粒克隆测序验证 | 第25-26页 |
| 2.2.4 CEGMA评估 | 第26页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第26-31页 |
| 2.3.1 基因组大小估计 | 第26-28页 |
| 2.3.2 基因组拼接长度估计 | 第28页 |
| 2.3.3 质粒克隆测序比对评估 | 第28-30页 |
| 2.3.4 CEGMA比对评估 | 第30-31页 |
| 3 基因组注释 | 第31-51页 |
| 3.1 前言 | 第31-38页 |
| 3.2 基因组注释方法 | 第38-49页 |
| 3.2.1 基因组重复序列分析方法 | 第38-41页 |
| 3.2.2 基因预测方法 | 第41-47页 |
| 3.2.3 基因功能注释方法 | 第47-49页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第49-51页 |
| 3.3.1 重复序列分析 | 第49-50页 |
| 3.3.2 基因预测 | 第50页 |
| 3.3.3 基因功能注释 | 第50-51页 |
| 4 比较基因组学分析 | 第51-63页 |
| 4.1 前言 | 第51-53页 |
| 4.2 比较基因组学分析方法 | 第53-58页 |
| 4.2.1 同源基因识别方法 | 第53-54页 |
| 4.2.2 基因组共线性分析方法 | 第54-56页 |
| 4.2.3 基因组进化分析方法 | 第56-58页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第58-63页 |
| 4.3.1 同源基因识别 | 第58页 |
| 4.3.2 基因组共线性分析 | 第58-61页 |
| 4.3.3 基因组进化分析 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-75页 |
