| 中文摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 前言 | 第14-42页 |
| 1.1 HIV-1 致病生物学 | 第14-20页 |
| 1.1.1 HIV-1 简介 | 第14-16页 |
| 1.1.2 HIV-1 感染进程 | 第16-20页 |
| 1.1.2.1 HIV-1 传染 | 第16-18页 |
| 1.1.2.2 HIV-1 传染后续事件 | 第18-20页 |
| 1.2 抗 HIV-1 免疫机制 | 第20-26页 |
| 1.2.1 抗 HIV-1 固有免疫 | 第21-22页 |
| 1.2.1.1 急性期蛋白和细胞因子 | 第21页 |
| 1.2.1.2 树突状细胞 | 第21-22页 |
| 1.2.1.3 自然杀伤细胞和自然杀伤 T 细胞 | 第22页 |
| 1.2.2 抗 HIV-1 适应免疫 | 第22-26页 |
| 1.2.2.1 体液免疫 | 第23-24页 |
| 1.2.2.2 细胞免疫 | 第24-26页 |
| 1.3 HIV-1 免疫逃避 | 第26-29页 |
| 1.3.1 精英控制者 | 第26-27页 |
| 1.3.2 HIV-1 逃逸突变 | 第27-29页 |
| 1.3.3 HIV-1 补偿突变与回复突变 | 第29页 |
| 1.4 HIV-1 复制适应性 | 第29-39页 |
| 1.4.1 HIV-1 适应性的重要意义 | 第30-32页 |
| 1.4.2 HIV-1 适应性的研究方法 | 第32-36页 |
| 1.4.2.1 平行感染培养法和竞争感染培养法 | 第32-33页 |
| 1.4.2.2 重组病毒感染法和全病毒感染法 | 第33-35页 |
| 1.4.2.3 报告基因检测法和直接检测法 | 第35-36页 |
| 1.4.3 应用 PFA 法研究 HIV-1 适应性 | 第36-39页 |
| 1.4.3.1 SGA 法和 T/F 病毒的重建 | 第36-37页 |
| 1.4.3.2 PASS 法检测的原理 | 第37-38页 |
| 1.4.3.3 PFA 单轮感染法和多次传代感染法 | 第38-39页 |
| 1.5 立题依据 | 第39-42页 |
| 第二章 材料与方法 | 第42-56页 |
| 2.1 实验材料与常规试剂 | 第42-46页 |
| 2.1.1 病人和临床样品 | 第42页 |
| 2.1.2 T/F 病毒及突变体感染性分子克隆的构建 | 第42-45页 |
| 2.1.3 肽合成 | 第45-46页 |
| 2.2 仪器与设备 | 第46-47页 |
| 2.3 方法与相关试剂 | 第47-56页 |
| 2.3.1 SGA 测序和结果比对 | 第47-48页 |
| 2.3.2 细胞培养和转染 | 第48页 |
| 2.3.3 蔗糖垫超速离心法浓缩病毒 | 第48页 |
| 2.3.4 免疫印迹分析 | 第48-49页 |
| 2.3.5 HIV-1 病毒滴度检测 | 第49-50页 |
| 2.3.6 CD4 阳性 T 细胞的纯化 | 第50-51页 |
| 2.3.7 流式细胞技术 | 第51页 |
| 2.3.8 平行感染实验及单独病毒生长曲线 | 第51页 |
| 2.3.9 竞争感染实验及混合病毒生长曲线 | 第51-52页 |
| 2.3.10 病毒 RNA 提取和 cDNA 合成 | 第52页 |
| 2.3.11 PASS 实验 | 第52-54页 |
| 2.3.12 HIV-1 相对适应性计算模型 | 第54页 |
| 2.3.13 潜在 HIV-1 隐藏抗原表位的预测 | 第54页 |
| 2.3.14 体外 ELISpot 实验 | 第54-56页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第56-110页 |
| 3.1 CTL 逃逸突变 T242N 对 HIV-1 适应性的影响 | 第56-74页 |
| 3.1.1 HIV-1 的 T/F 病毒重建 | 第57-59页 |
| 3.1.2 T242N 突变体的设计、构建和表达 | 第59-61页 |
| 3.1.3 平行感染培养法测定 T242N 突变的适应性影响 | 第61-63页 |
| 3.1.4 PFA 法测定 T242N 突变的适应性影响 | 第63-71页 |
| 3.1.5 讨论 | 第71-74页 |
| 3.1.6 小结 | 第74页 |
| 3.2 补偿突变对 CTL 逃逸突变 T242N 的影响 | 第74-88页 |
| 3.2.1 突变体 I247V 和 Q219H 的设计、构建和表达 | 第75-77页 |
| 3.2.2 平行感染培养法测定补偿缺陷型突变体的适应性影响 | 第77-78页 |
| 3.2.3 PFA 法测定 I247 和 Q219 对 T242N 突变的补偿作用 | 第78-85页 |
| 3.2.4 讨论 | 第85-88页 |
| 3.2.5 小结 | 第88页 |
| 3.3 T242N 免疫逃逸 T/F 病毒的适应性研究 | 第88-98页 |
| 3.3.1 T/F 病毒及其同源突变体的设计、构建和表达 | 第89-92页 |
| 3.3.2 N242T 的适应性影响 | 第92-93页 |
| 3.3.3 I247 突变的适应性影响 | 第93-96页 |
| 3.3.4 讨论 | 第96-97页 |
| 3.3.5 小结 | 第97-98页 |
| 3.4 HIV-1 选择突变的适应性研究 | 第98-110页 |
| 3.4.1 选择突变 K43R 和 N323TC | 第99-103页 |
| 3.4.2 K43R 和 N323TC 突变体的设计、构建和表达 | 第103-105页 |
| 3.4.3 K43R 和 N323TC 突变的病毒适应性影响 | 第105-107页 |
| 3.4.4 讨论 | 第107-109页 |
| 3.4.5 小结 | 第109-110页 |
| 结论 | 第110-112页 |
| 参考文献 | 第112-122页 |
| 作者简介及在学期间所获得科研成果 | 第122-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
