| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-18页 |
| 1.1 碱基替换 | 第10-11页 |
| 1.2 核苷酸替换的相邻位点效应 | 第11-14页 |
| 1.3 利用相对熵研究 DNA 序列信息 | 第14-16页 |
| 1.4 替换的侧翼序列存在 3 碱基周期性 | 第16页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第16-18页 |
| 1.5.1 研究细菌基因组中替换的侧翼序列特征 | 第16-17页 |
| 1.5.2 改进阈值的计算方法 | 第17页 |
| 1.5.3 具体计算位点上相对熵的贡献 | 第17页 |
| 1.5.4 探索替换的侧翼序列特征产生的原因 | 第17-18页 |
| 第二章 替换侧翼序列位点的相对熵 | 第18-32页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-20页 |
| 2.1.1 序列数据与比对 | 第18-19页 |
| 2.1.2 替换及相邻位点信息 | 第19-20页 |
| 2.1.3 相对熵计算与作图 | 第20页 |
| 2.1.4 阈值的计算 | 第20页 |
| 2.2 结果分析 | 第20-27页 |
| 2.2.1 大肠杆菌基因组中核苷酸替换的侧翼序列特征 | 第21-23页 |
| 2.2.2 植物乳杆菌基因组中核苷酸替换的侧翼序列特征 | 第23-25页 |
| 2.2.3 蜡样芽胞杆菌基因组中核苷酸替换的侧翼序列特征 | 第25-27页 |
| 2.3 讨论与结论 | 第27-32页 |
| 第三章 替换的相邻位点相对熵的贡献 | 第32-38页 |
| 3.1 材料与方法 | 第32页 |
| 3.1.1 序列数据与比对 | 第32页 |
| 3.1.2 替换及相邻位点信息 | 第32页 |
| 3.1.3 相对熵贡献的计算 | 第32页 |
| 3.2 结果与分析 | 第32-34页 |
| 3.3 讨论与结论 | 第34-38页 |
| 第四章 替换侧翼序列周期性原因探究 | 第38-43页 |
| 4.1 材料与方法 | 第38页 |
| 4.1.1 序列数据与比对 | 第38页 |
| 4.1.2 替换及相邻位点信息 | 第38页 |
| 4.1.3 相对熵计算与作图 | 第38页 |
| 4.1.4 阈值的计算 | 第38页 |
| 4.2 结果分析与讨论 | 第38-43页 |
| 第五章 结论与创新点 | 第43-47页 |
| 5.1 结论 | 第43-44页 |
| 5.1.1 细菌基因组中替换的侧翼序列特征 | 第43-44页 |
| 5.1.2 核苷酸替换相邻位点的相对熵贡献 | 第44页 |
| 5.2 创新点 | 第44-45页 |
| 5.3 不足 | 第45页 |
| 5.4 展望 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 附录 | 第50-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |
