基于线粒体细胞色素b基因序列的秧鸡科10种鸟类的系统进化研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第9-23页 |
| 1.1 分子生态学 | 第9-11页 |
| 1.1.1 分子生态学的发展 | 第9页 |
| 1.1.2 分子标记 | 第9-10页 |
| 1.1.3 现今分子生态学的主要研究方法 | 第10-11页 |
| 1.2 系统发育学 | 第11-15页 |
| 1.2.1 系统发育学的发展 | 第12页 |
| 1.2.2 分子系统发育学 | 第12-13页 |
| 1.2.3 系统发生树 | 第13-14页 |
| 1.2.4 分子钟理论 | 第14-15页 |
| 1.3 鸟类分子系统发育研究 | 第15-17页 |
| 1.3.1 分子系统发育学在鸟类系统研究中的应用 | 第15-17页 |
| 1.3.2 鸟类分子系统发育研究的现状 | 第17页 |
| 1.4 地理历史事件及其影响 | 第17-20页 |
| 1.4.1 地理历史事件 | 第18-19页 |
| 1.4.2 地理历史事件的影响 | 第19-20页 |
| 1.5 秧鸡科鸟类概述 | 第20-23页 |
| 1.5.1 秧鸡科鸟类概况 | 第20页 |
| 1.5.2 秧鸡科鸟类的分类关系 | 第20-21页 |
| 1.5.3 秧鸡科鸟类研究现状 | 第21-22页 |
| 1.5.4 本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料和方法 | 第23-30页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 实验样品 | 第23-25页 |
| 2.1.2 外群的选择 | 第25页 |
| 2.2 仪器设备 | 第25-26页 |
| 2.3 试剂与溶液 | 第26-27页 |
| 2.3.1 试剂 | 第26-27页 |
| 2.3.2 溶液的配制 | 第27页 |
| 2.4 实验方法 | 第27-30页 |
| 2.4.1 样品的预处理 | 第27页 |
| 2.4.2 总DNA的提取 | 第27-28页 |
| 2.4.3 总DNA琼脂糖凝胶电泳检测 | 第28页 |
| 2.4.4 总DNA扩增及序列测定 | 第28-29页 |
| 2.4.5 数据分析 | 第29-30页 |
| 第三章 结果与分析 | 第30-42页 |
| 3.1 Cyt b基因的碱基组成和序列差异 | 第30-35页 |
| 3.1.1 Cyt b基因的碱基和氨基酸组成分析 | 第30-32页 |
| 3.1.2 物种间Cyt b基因序列差异 | 第32-34页 |
| 3.1.3 Cyt b基因序列饱和度分析 | 第34-35页 |
| 3.2 分子系统树的构建 | 第35-40页 |
| 3.2.1 加权方案的确定 | 第35-36页 |
| 3.2.2 碱基替换模型的确定 | 第36-37页 |
| 3.2.3 分子系统树 | 第37-40页 |
| 3.3 物种分歧时间 | 第40-42页 |
| 第四章 讨论 | 第42-46页 |
| 4.1 Cyt b基因序列变异分析 | 第42页 |
| 4.2 秧鸡科鸟类系统发育关系 | 第42-44页 |
| 4.3 秧鸡科鸟类物种形成分析 | 第44-45页 |
| 4.4 秧鸡科鸟类保护探讨 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-55页 |
| 附录 | 第55-60页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第60页 |
