| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 文献综述 | 第12-18页 |
| 1.1 研究的目的与意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状及发展动态分析 | 第13-17页 |
| 1.2.1 根瘤菌研究进展 | 第13-14页 |
| 1.2.2 噬菌体研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2.3 根瘤菌噬菌体研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2.4 微生物宏基因组学研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 本文主要研究内容 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-24页 |
| 2.1 试验材料 | 第18页 |
| 2.1.1 供试根瘤菌株和土壤样品 | 第18页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第18页 |
| 2.2 试验方法 | 第18-24页 |
| 2.2.1 土壤悬浮液的准备 | 第18页 |
| 2.2.2 噬菌体的富集与分离 | 第18-19页 |
| 2.2.3 噬菌体的纯化 | 第19页 |
| 2.2.4 噬菌体的样品制备与噬菌体颗粒的超离富集 | 第19页 |
| 2.2.5 噬菌体的电镜观察 | 第19页 |
| 2.2.6 噬菌体的生物学特性 | 第19-21页 |
| 2.2.7 噬菌体DNA提取 | 第21页 |
| 2.2.8 g23基因PCR扩增、纯化及克隆测序 | 第21页 |
| 2.2.9 数据分析 | 第21-22页 |
| 2.2.10 BDU-3 基因组提取 | 第22页 |
| 2.2.11 BDU-3 全基因组测序和基因组分析 | 第22-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-48页 |
| 3.1 豆科植物根瘤菌噬菌体的分离及生物学特性分析 | 第24-31页 |
| 3.1.1 根瘤菌噬菌体的分离与纯化 | 第24页 |
| 3.1.2 根瘤菌噬菌体的电镜观察 | 第24-25页 |
| 3.1.3 噬菌体的最佳感染复数的测定 | 第25-28页 |
| 3.1.4 噬菌体的一步生长曲线 | 第28-29页 |
| 3.1.5 生物学特性测定 | 第29-31页 |
| 3.2 中华苜蓿根瘤菌噬菌体主要壳蛋白g23基因的系统进化分析 | 第31-38页 |
| 3.2.1 噬菌体DNA提取，g23基因的PCR扩增、纯化及克隆分析 | 第31-32页 |
| 3.2.2 环境样品g23基因描述 | 第32页 |
| 3.2.3 苜蓿根瘤菌噬菌体g23基因的系统进化分析 | 第32-38页 |
| 3.3 慢生型根瘤菌噬菌体BDU-3 基因组测序及基因组结构分析 | 第38-48页 |
| 3.3.1 噬菌体BDU-3 的基因组概述 | 第38-41页 |
| 3.3.2 噬菌体BDU-3 与报道的噬菌体全基因组序列比较分析 | 第41页 |
| 3.3.3 噬菌体BDU-3 与噬菌体 ΦM12、vB_RleM_P10VF和vB_MloP_Lo5R7ANS的全基因组同源性分析 | 第41-45页 |
| 3.3.4 噬菌体BDU-3 系统进化树分析 | 第45-48页 |
| 4 结论与讨论 | 第48-54页 |
| 4.1 讨论 | 第48-52页 |
| 4.1.1 噬菌体分离、电镜观察和生物学特性 | 第48-50页 |
| 4.1.2 苜蓿根瘤菌噬菌体g23基因系统进化 | 第50-51页 |
| 4.1.3 BDU-3全基因组研究 | 第51-52页 |
| 4.2 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 附录1 | 第62-64页 |
| 附录2 | 第64-74页 |
| 致谢 | 第74-76页 |
| 个人简介 | 第76页 |
