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广西宠物犬星状病毒分子流行病学调查及ORF2基因序列分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
符号缩写表第8-11页
第一章 前言第11-24页
    1.1 星状病毒的概述第11-16页
        1.1.1 命名与分类第11-12页
        1.1.2 病原的形态结构第12-13页
        1.1.3 分子生物学结构第13-16页
    1.2 星状病毒的病理学第16-17页
    1.3 犬星状病毒的流行病学第17-18页
    1.4 传播途径第18页
    1.5 星状病毒检测技术应用第18-23页
        1.5.1 电镜检测法第18-19页
        1.5.2 病毒细胞培养和分离鉴定第19页
        1.5.3 ELISA法第19-20页
        1.5.4 RT-PCR法第20页
        1.5.5 实时荧光定量PCR法第20-21页
        1.5.6 LAMP法第21-22页
        1.5.7 其它的检测方法第22-23页
    1.6 本研究的目的与意义第23-24页
第二章 广西宠物犬星状病毒分子流行病学调查第24-41页
    2.1 实验材料第24-26页
        2.1.1 实验样品第24页
        2.1.2 实验主要仪器第24-25页
        2.1.3 实验主要试剂第25页
        2.1.4 主要培养基及缓冲液配制第25-26页
    2.2 实验方法第26-33页
        2.2.1 实验设计和技术路线第26-27页
        2.2.2 粪便样品处理第27页
        2.2.3 引物设计第27页
        2.2.4 CAstV检测第27-31页
        2.2.5 序列分析比对及进化树构建第31-33页
    2.3 结果与分析第33-38页
        2.3.1 广西宠物犬CAstV检测结果第33页
        2.3.2 不同生长年龄阶段宠物犬CAstV感染情况第33-34页
        2.3.3 宠物犬AstV不同季节感染率情况第34-35页
        2.3.4 宠物犬病毒性疾病混合感染情况第35页
        2.3.5 ORF1b基因同源性分析第35-36页
        2.3.6 遗传进化树的构建第36-37页
        2.3.7 ORF1b基因推导的氨基酸序列分析第37-38页
    2.4 讨论第38-41页
第三章 犬星状病毒部分ORF2基因扩增和全基因的克隆及序列分析第41-56页
    3.1 实验材料第41页
        3.1.1 实验样品第41页
        3.1.2 实验主要仪器第41页
        3.1.3 实验试剂第41页
        3.1.4 载体和菌种第41页
    3.2 方法与步骤第41-47页
        3.2.1 引物设计第41-42页
        3.2.2 反转录-聚合酶链式反应第42-44页
        3.2.3 电泳第44页
        3.2.4 部分ORF2胶回收第44页
        3.2.5 全基因ORF2第44-46页
        3.2.6 全基因ORF2酶切鉴定第46页
        3.2.7 目的基因序列测定及分析第46页
        3.2.8 序列分析第46-47页
    3.3 结果与分析第47-54页
        3.3.1 CAstV部分ORF2基因检测结果第47-48页
        3.3.2 CAstV全基因ORF2检测结果第48页
        3.3.3 CAstV全基因ORF2酶切鉴定结果第48-49页
        3.3.4 部分ORF2基因推导的氨基酸同源性分析第49-50页
        3.3.5 部分ORF2基因推导的氨基酸遗传进化树的构建第50-51页
        3.3.6 GXK466/2015-ORF2全基因氨基酸同源性分析第51-52页
        3.3.7 GXK466/2015阳性株衣壳蛋白遗传进化树分析第52-53页
        3.3.8 GXK466/2015衣壳蛋白不同抗原区域氨基酸同源性比较第53页
        3.3.9 GXK466/2015衣壳蛋白区域Ⅱ氨基酸序列差异性分析第53-54页
    3.4 讨论第54-56页
第四章 全文结论第56-57页
参考文献第57-68页
致谢第68-69页
攻读学位期间论文发表情况第69页

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