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磷酸甘油酸变位酶PGAM1参与DNA损伤应答机制研究

缩略词表第8-14页
摘要第14-17页
Abstract第17-19页
前言第20-30页
    1. 肿瘤有氧糖酵解第20-23页
    2. 有氧糖酵解酶第23-24页
    3. 磷酸甘油酸变位酶第24-26页
        3.1 PGAM的亚型第24页
        3.2 PGAM1与肿瘤第24-25页
        3.3 PGAM1的调控第25-26页
        3.4 PGAM1的靶向抑制剂研究第26页
    4. DNA损伤应答第26-29页
        4.1 同源重组第27-29页
        4.2 非同源末端连接第29页
    5. 本课题的研究目的及意义第29-30页
研究方案第30-32页
第一章 PGAM1调控DNA同源重组修复通路第32-55页
    1.1 引言第32-33页
    1.2 材料与方法第33-42页
        1.2.1 药品和试剂第33页
        1.2.2 质粒第33页
        1.2.3 主要仪器第33-34页
        1.2.4 细胞株及细胞培养第34-35页
        1.2.5 质粒扩增、抽提、纯化第35页
        1.2.6 质粒转染第35-36页
        1.2.7 稳定干扰株构建第36-37页
        1.2.8 基于稳定同位素氨基酸标记的细胞培养技术的蛋白质组学研究第37-38页
        1.2.9 蛋白免疫印迹第38页
        1.2.10 克隆形成第38-39页
        1.2.11 细胞凋亡检测第39页
        1.2.12 细胞周期检测第39页
        1.2.13 免疫荧光实验第39-40页
        1.2.14 彗星电泳(单细胞凝胶电泳实验)第40页
        1.2.15 瞬时干扰第40-41页
        1.2.16 HR报告分析系统第41页
        1.2.17 NHEJ报告系统第41页
        1.2.18 统计学分析方法第41-42页
    1.3 结果第42-53页
        1.3.1 基于SILAC的蛋白质组学研究干扰PGAM1对细胞总蛋白水平的影响第42-43页
        1.3.2 干扰PGAM1选择性增强细胞对DNA损伤药物的敏感性第43-48页
        1.3.3 PGAM1参与调控同源重组修复通路第48-53页
    1.4 讨论第53-55页
第二章 PGAM1调控HR修复依赖其代谢酶活性第55-76页
    2.1 引言第55-56页
    2.2 材料与方法第56-64页
        2.2.1 药品与试剂第56页
        2.2.2 质粒第56页
        2.2.3 主要仪器第56-57页
        2.2.4 细胞株及细胞培养第57页
        2.2.5 细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提第57-58页
        2.2.6 点突变试验第58-59页
        2.2.7 2-Phosphoglycerate检测第59页
        2.2.8 细胞代谢指标的检测第59-60页
        2.2.9 ATP检测第60-61页
        2.2.10 细胞外释放的乳酸检测第61页
        2.2.11 瞬时干扰第61-62页
        2.2.12 6PGD及PHGDH的酶活测定第62页
        2.2.13 细胞增殖(SRB法)第62-63页
        2.2.14 NADPH/NADP~+检测第63页
        2.2.15 dNTP水平测定第63页
        2.2.16 统计方法第63-64页
    2.3 结果第64-75页
        2.3.1 PGAM1调控HR修复依赖于其代谢酶活功能第64-69页
        2.3.2 PGAM1通过磷酸戊糖旁路调控HR功能第69-75页
    2.4 讨论第75-76页
第三章 PGAM1通过影响CtIP蛋白水平调控HR修复第76-102页
    3.1 引言第76-77页
    3.2 材料与方法第77-83页
        3.2.1 药品与试剂第77页
        3.2.2 质粒第77页
        3.2.3 主要仪器第77-78页
        3.2.4 细胞株及细胞培养第78页
        3.2.5 ssDNA形成荧光免疫染色测定第78-79页
        3.2.6 瞬时干扰第79-80页
        3.2.7 CtIP蛋白泛素化水平检测第80-81页
        3.2.8 细胞总RNA抽提第81页
        3.2.9 反转录第81页
        3.2.10 实时荧光定量PCR第81-82页
        3.2.11 染色质免疫共沉淀第82页
        3.2.12 统计方法第82-83页
    3.3 结果第83-101页
        3.3.1 PGAM1通过调控CtIP蛋白水平影响DSBs末端切除效率第83-88页
        3.3.2 PGAM1通过调控dNTP代谢影响CtIP蛋白水平第88-90页
        3.3.3 PGAM1通过调节dNTP代谢影响CtIP蛋白稳定性第90-96页
        3.3.4 dNTP水平下调激活p53/p73通路第96-101页
    3.4 讨论第101-102页
第四章 抑制PGAM1增敏乳腺癌对PARP抑制剂的敏感性第102-117页
    4.1 引言第102-103页
    4.2 材料和方法第103-107页
        4.2.1 药物及试剂第103页
        4.2.2 主要仪器第103页
        4.2.3 细胞株及细胞培养第103-104页
        4.2.4 体内抗肿瘤实验第104页
        4.2.5 动物实验中瘤组织蛋白提取第104-105页
        4.2.6 免疫组织化学第105-106页
        4.2.7 瘤组织中2-PG水平检测第106页
        4.2.8 统计方法第106-107页
    4.3 结果第107-115页
        4.3.1 干扰PGAM1增强BRCA野生型乳腺癌细胞对Olaparib的敏感性第107-108页
        4.3.2 Olaparib对PGAM1稳定干扰的BRCA野生型乳腺癌的体内抗肿瘤作用第108-111页
        4.3.3 联用PGAM1抑制剂增强BRCA野生型肿瘤对PARP抑制剂的敏感性第111-115页
    4.4 讨论第115-117页
小结第117-120页
参考文献第120-130页
致谢第130-132页
附录一 攻读学位期间发表的学术论文第132-133页

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