| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-23页 |
| 1 文献综述 | 第9-21页 |
| ·生防微生物研究进展 | 第9-16页 |
| ·生防微生物种类 | 第9-14页 |
| ·生防细菌 | 第10-11页 |
| ·生防放线菌 | 第11-12页 |
| ·生防真菌 | 第12-14页 |
| ·生防微生物拮抗机制 | 第14-15页 |
| ·竞争作用 | 第14页 |
| ·寄生作用 | 第14页 |
| ·拮抗作用 | 第14页 |
| ·诱导植物抗性 | 第14-15页 |
| ·Terribacillus属拮抗研究进展 | 第15-16页 |
| ·Terribacillus属分类地位 | 第15页 |
| ·Terribacillus属拮抗功能研究现状 | 第15-16页 |
| ·微生物基因组学 | 第16-21页 |
| ·微生物基因组学发展历程 | 第16-17页 |
| ·已完成基因组测序的微生物 | 第17页 |
| ·微生物基因组测序技术 | 第17-21页 |
| ·Illumina---Solexa | 第18-19页 |
| ·Roche--454 | 第19页 |
| ·ABI--SOLi D | 第19-21页 |
| 2 本研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 3 本研究技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 生防细菌的筛选及拮抗机制初探 | 第23-39页 |
| 1 材料与方法 | 第23-28页 |
| ·生防细菌的筛选 | 第23页 |
| ·实验材料 | 第23页 |
| ·供试菌株 | 第23页 |
| ·实验方法 | 第23页 |
| ·生防菌株筛选及拮抗能力分析 | 第23页 |
| ·生防菌株的初步鉴定 | 第23-26页 |
| ·培养性状和形态特征 | 第23-24页 |
| ·群体形态---菌落形态的观察 | 第23页 |
| ·个体形态观察---扫描电镜样品制备过程 | 第23-24页 |
| ·生理生化特性 | 第24-25页 |
| ·Biolog---可利用碳源、氮源、盐、抗生素抗性等 | 第24页 |
| ·可生长温度和最佳生长温度 | 第24页 |
| ·耐盐性---可生长Na Cl的浓度 | 第24-25页 |
| ·可生长p H范围和最佳生长p H | 第25页 |
| ·16S r DNA序列分析 | 第25-26页 |
| ·小量MP602基因组DNA的提取 | 第25页 |
| ·16S r DNA PCR | 第25-26页 |
| ·MP602系统发育树的构建 | 第26页 |
| ·MP602拮抗机制初探 | 第26-28页 |
| ·实验材料 | 第26-27页 |
| ·供试菌株 | 第26页 |
| ·培养基 | 第26-27页 |
| ·实验方法 | 第27-28页 |
| ·MP602抑菌谱的确定 | 第27页 |
| ·拮抗代谢物对病原真菌的拮抗实验 | 第27-28页 |
| 2 结果与分析 | 第28-38页 |
| ·生防菌株的筛选及拮抗能力分析 | 第28页 |
| ·拮抗细菌MP602的鉴定 | 第28-36页 |
| ·细菌形态特征 | 第28-29页 |
| ·Biolog 结果分析 | 第29-30页 |
| ·生长温度范围和最佳生长温度确定 | 第30-32页 |
| ·耐盐性---可生长的Na Cl浓度 | 第32页 |
| ·可生长p H范围及最佳生长p H的确定 | 第32-33页 |
| ·16S r DNA序列分析 | 第33-36页 |
| ·MP602拮抗机制初探 | 第36-38页 |
| ·抑菌谱实验结果 | 第36-37页 |
| ·拮抗代谢物对番茄灰霉的拮抗实验 | 第37-38页 |
| 3 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 Terribacillus aidingensis MP602全基因组测序 | 第39-54页 |
| 1 材料与方法 | 第39-46页 |
| ·实验材料 | 第39-41页 |
| ·菌株及质粒载体 | 第39页 |
| ·培养基 | 第39页 |
| ·工具酶及 DNA 分子量标准 | 第39页 |
| ·所用试剂盒 | 第39-40页 |
| ·主要化学试剂及配制方法 | 第40页 |
| ·DNA提取常用试剂及配制 | 第40页 |
| ·其它测序所需试剂 | 第40页 |
| ·主要仪器及设备 | 第40-41页 |
| ·实验方法 | 第41-46页 |
| ·全基因组测序 | 第41-45页 |
| ·Terribacillus sp. MP602菌株的培养及基因组DNA的提取 | 第41页 |
| ·基因组DNA测序 | 第41-42页 |
| ·Gap Finishing | 第42-45页 |
| ·全基因组注释 | 第45-46页 |
| ·开放阅读框（ORFs）的预测 | 第46页 |
| ·基因功能注释 | 第46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-52页 |
| ·Terribacillus aidingensis MP602全基因组测序 | 第46-48页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第46-47页 |
| ·Gap Finishing及序列拼接结果 | 第47-48页 |
| ·Terribacillus sp. MP602全基因组注释 | 第48-52页 |
| ·基因组结构注释信息 | 第48页 |
| ·基因组功能注释信息--COG | 第48-50页 |
| ·基因组完成图谱 | 第50-52页 |
| 3 小结 | 第52-54页 |
| 第四章 总结 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 作者简介 | 第63-64页 |
| 附录 | 第64-66页 |
