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纤维素酶ChCel5A活性架构中关键氨基酸的功能分析与其荧光淬灭动力学研究

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩略词表第13-14页
第一章 绪论第14-28页
   ·木质纤维素的化学组成与分子结构第14-18页
     ·纤维素的空间架构第15-16页
     ·半纤维的组成成分第16-17页
     ·异质性的聚合物-木质素第17-18页
   ·降解纤维素的主要微生物第18-19页
     ·真菌类微生物第18页
     ·细菌类微生物第18-19页
   ·纤维素降解菌降解木质纤维素的主要策略第19-22页
     ·游离的纤维素酶系统第19-20页
     ·复合的纤维素酶系统第20-21页
     ·细胞结合型的非复合体纤维素降解酶系统第21-22页
   ·糖苷水解酶5家族(GH5)的相关研究进展第22-27页
     ·GH5家族结构特征第22-23页
     ·GH5家族亚家族分类标准第23-24页
     ·GH5家族的催化机理第24-27页
   ·立题依据第27-28页
第二章 糖苷水解酶GH5-2亚家族的结构生物信息学分析第28-38页
   ·材料与方法第28-30页
     ·生物信息学数据网站第28页
     ·生物信息学分析软件第28-29页
     ·GH5家族活性架构序列谱的绘制过程第29页
     ·GH5-2亚家族系统发育树的构建第29-30页
     ·ChCel5A的同源模建第30页
   ·结果与分析第30-36页
     ·GH5-2亚家族重要酶分子的性质统计分析第30-31页
     ·ChCel5A的同源模建第31-32页
     ·GH5-2亚家族酶分子表面电势分析第32-33页
     ·GH5-2亚家族的系统发育树第33-34页
     ·GH5-2亚家族活性架构序列谱第34-36页
   ·小结与讨论第36-38页
第三章 ChCel5A活性架构保守功能残基的突变及其功能的研究第38-54页
   ·材料与方法第38-45页
     ·菌株与质粒第38页
     ·主要仪器与试剂第38-39页
     ·主要培养基与缓冲液第39页
     ·ChCel5A的基因克隆第39-41页
     ·大肠杆菌BL21(DE3)异源表达突变蛋白及亲和层析第41-43页
     ·蛋白质浓度的测定第43页
     ·内切纤维素酶活力测定第43-44页
     ·荧光辅助糖电泳(FACE)表征产物谱的变化第44-45页
   ·结果与分析第45-52页
     ·ChCel5A的活性架构中保守氨基酸的功能分析第45-46页
     ·ChCel5A质粒的构建和突变第46-47页
     ·ChCel5A中N165、Y227的定点突变第47页
     ·N165A、Y227A突变质粒的验证第47-48页
     ·突变蛋白N165A、Y227A的内切纤维素酶活力测定第48-49页
     ·N165A和Y227A水解RAC的产物谱分析第49-51页
     ·WT、N165A以及Y227A水解RAC的产物谱模式图绘制第51-52页
   ·小结与讨论第52-54页
第四章 ChCel5A活性架构中芳香族氨基酸的突变及其功能分析第54-66页
   ·材料与方法第54-57页
     ·菌株与质粒第54页
     ·仪器与试剂第54-55页
     ·主要培养基第55页
     ·基因克隆第55页
     ·大肠杆菌DH5α异源表达突变蛋白第55页
     ·蛋白质浓度的测定第55-56页
     ·内切纤维素酶活力的测定第56页
     ·pNPC酶活力的测定第56页
     ·突变蛋白催化动力学K_m、K_(cat)的测定第56-57页
   ·结果与分析第57-63页
     ·活性架构中突变位点的功能分析与预测第57-58页
     ·W61Y、Y203W的定点突变第58页
     ·W61Y和Y203W突变质粒的验证第58-59页
     ·突变蛋白W61Y和Y203W的表达和纯化第59-60页
     ·突变蛋白W61Y和Y203W的内切纤维素酶活力测定第60页
     ·pNPC酶活力的测定第60-61页
     ·突变蛋白W61Y、Y203W的催化动力学常数测定第61-62页
     ·利用FACE分析W61Y、Y203W水解CMC的产物谱变化第62-63页
   ·小结与讨论第63-66页
第五章 荧光光谱法测定酶活性架构中亚位点氨基酸与底物的结合力第66-82页
   ·材料与方法第66-70页
     ·主要试剂和设备第66-67页
     ·酶分子的异源表达和RAC底物的制备第67页
     ·内切纤维素酶活力和动力学参数的测定第67页
     ·荧光体与底物pNP、pNPC、CMC以及RAC的荧光光谱测定第67-70页
   ·结果与分析第70-81页
     ·多点结合动力学的判断和单点结合区间的确定第70-71页
     ·ChCel5A活性架构中亚位点氨基酸与不同底物的结合常数第71-74页
     ·TrCel5A和TrCel12A与底物CMC的荧光光谱第74-75页
     ·温度对于TrCel12A-E200Q与CMC荧光光谱的影响第75-77页
     ·荧光光谱直观地表征pNP类底物的局限性第77-78页
     ·荧光光谱定量地表征pNP类底物的局限性第78-79页
     ·以RAC为底物的荧光光谱初探第79-81页
   ·小结与讨论第81-82页
全文总结与展望第82-84页
参考文献第84-92页
致谢第92-94页
攻读硕士期间发表的论文第94-95页
附件第95页

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