| 目录 | 第1-7页 |
| 图表索引 | 第7-9页 |
| 英语缩略词 | 第9-11页 |
| 摘要 | 第11-14页 |
| ABSTRACT | 第14-18页 |
| 第一章 多灶肺癌的基因组学研究 | 第18-93页 |
| 导论(含文献综述) | 第18-34页 |
| 1. 多原发肺癌概述 | 第18-19页 |
| 2. 研究多原发肺癌的意义及研究现状 | 第19-23页 |
| 3. 第二代测序技术概述 | 第23-25页 |
| 4. 第二代测序技术在肿瘤基因组研究中的应用 | 第25-27页 |
| 5. 第二代测序技术在肿瘤研究中面临的挑战 | 第27-29页 |
| 6. 第二代测序技术在肺癌研究中的进展 | 第29-32页 |
| 7. 存在的问题及本实验室前期的相关工作基础 | 第32页 |
| 8. 本项研究的目的和策略 | 第32-34页 |
| 第一部分 经手术治疗的21例多灶肺癌病例报告 | 第34-43页 |
| 一、结果 | 第34-40页 |
| 1. 一般特征 | 第34-35页 |
| 2. 临床症状 | 第35-36页 |
| 3. 术前检查 | 第36页 |
| 4. 治疗情况 | 第36-38页 |
| 5. 术后组织病理学和分子病理学检查 | 第38-39页 |
| 6. 出院诊断 | 第39页 |
| 7. 随访 | 第39-40页 |
| 二、讨论 | 第40-43页 |
| 第二部分 同时性多灶肺腺癌的基因组学分析 | 第43-79页 |
| 一、结果：同时性多灶肺腺癌的基因组改变 | 第43-71页 |
| 1. 以第二代测序分析多灶肺癌6例 | 第43-65页 |
| ·6例多灶肺癌临床相关信息 | 第43-50页 |
| ·获得高质量基因组DNA | 第50页 |
| ·1例多灶肺癌全基因组测序和5例多灶肺癌外显子组测序实验数据分析 | 第50-57页 |
| ·基于获得验证的体细胞突变谱鉴别多原发肺癌与肺内转移 | 第57-60页 |
| ·同时性多灶肺腺癌不同病灶的进化分析 | 第60-64页 |
| ·同时性多灶肺腺癌不同病灶中治疗靶点的异质性 | 第64-65页 |
| 2. 以array-CGH技术分析多灶肺癌的DNA拷贝数改变 | 第65-71页 |
| 二、讨论 | 第71-79页 |
| 1. 测序前严格控制入组样品的质量 | 第71页 |
| 2. 以高通量测序分析或基因芯片分析鉴别多原发肺癌与肺转移癌 | 第71-73页 |
| 3. 多原发肺癌中测序获得的体细胞非同义突变和结构变异的验证及意义 | 第73-75页 |
| 4. 对验证后结果的深入理解和剖析 | 第75-77页 |
| 5. 展望 | 第77-79页 |
| 本章小结 | 第79-80页 |
| 材料与方法 | 第80-93页 |
| 一、实验材料 | 第80-83页 |
| 1. 肺癌患者及其组织样品 | 第80页 |
| 2. 主要试剂 | 第80-82页 |
| 3. 主要仪器 | 第82页 |
| 4. 主要分析软件 | 第82-83页 |
| 二、实验方法 | 第83-93页 |
| 1. 分子生物学方法 | 第83-92页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第83-85页 |
| ·第二代测序分析 | 第85-87页 |
| ·array-CGH分析 | 第87-91页 |
| ·质谱分析(SNVs的验证) | 第91页 |
| ·PCR | 第91-92页 |
| 2. 统计学分析 | 第92-93页 |
| 第二章 EMP2基因在非小细胞肺癌肿瘤转移中的作用 | 第93-141页 |
| 导论(含文献综述) | 第93-103页 |
| 1. EMP2的功能及参与的主要生物学过程 | 第94-99页 |
| ·EMP2与caveolae | 第95-96页 |
| ·EMP2与integrin | 第96-98页 |
| ·EMP2与胚泡植入 | 第98页 |
| ·EMP2与细胞死亡 | 第98-99页 |
| ·其他 | 第99页 |
| 2. EMP2与恶性肿瘤 | 第99-101页 |
| ·EMP2与B细胞淋巴瘤 | 第99-100页 |
| ·EMP2与卵巢癌 | 第100页 |
| ·EMP2与子宫内膜癌 | 第100-101页 |
| 3. 存在的问题及本实验室前期的工作基础 | 第101页 |
| 4. 本项研究的目的和策略 | 第101-103页 |
| 结果 | 第103-113页 |
| 1. EMP2在肺癌组织和细胞系中的表达 | 第103-106页 |
| ·EMP2基因在肺癌及其癌旁组织中的表达 | 第103-104页 |
| ·EMP2蛋白在肺癌组织中的表达 | 第104-106页 |
| ·EMP2基因在肺癌细胞和永生化支气管上皮细胞中的表达 | 第106页 |
| 2. EMP2基因的克隆和真核表达质粒的构建 | 第106-107页 |
| 3. EMP2基因过表达对肺癌细胞H1299表型的影响 | 第107-109页 |
| ·稳定表达外源性EMP2的H1299细胞的获得与筛选 | 第107-108页 |
| ·EMP2基因过表达对H1299细胞增殖能力的影响 | 第108-109页 |
| ·EMP2基因高表达对细胞体外迁移和侵袭能力的影响 | 第109页 |
| 4. EMP2调节H1299细胞转移能力的分子机制 | 第109-113页 |
| ·稳定高表达EMP2不影响CAV1 mRNA和蛋白表达 | 第109-110页 |
| ·EMP2高表达抑制β-catenin入核 | 第110-111页 |
| ·EMP2高表达下调MMP9和MMP7表达并抑制MMP9的活性 | 第111-113页 |
| 讨论 | 第113-120页 |
| 1. 胚胎植入与肿瘤转移 | 第113-114页 |
| 2. EMP2基因表达与肺癌临床特征之间的关系 | 第114页 |
| 3. 外源性EMP2高表达对H1299细胞体外转移能力的影响 | 第114-116页 |
| 4. EMP2调节H1299细胞侵袭转移的分子机制 | 第116-120页 |
| ·EMP2对CAV1 mRNA和蛋白水平的影响 | 第116页 |
| ·EMP2对β-catenin表达的影响 | 第116-117页 |
| ·EMP2对基质金属蛋白酶家族成员的影响 | 第117-120页 |
| 本章小结 | 第120-121页 |
| 材料与方法 | 第121-141页 |
| 一、实验材料 | 第121-129页 |
| 1. 肺癌患者及其手术切除组织样品 | 第121页 |
| 2. 细胞系 | 第121-122页 |
| 3. 菌株及质粒载体 | 第122-123页 |
| 4. 引物序列 | 第123-124页 |
| 5. 抗体 | 第124页 |
| 6. 主要试剂 | 第124-126页 |
| 7. 常用试剂的配制 | 第126-128页 |
| 8. 主要仪器 | 第128-129页 |
| 9. 主要分析软件 | 第129页 |
| 二、实验方法 | 第129-141页 |
| 1. 分子生物学方法 | 第129-137页 |
| 2. 细胞生物学方法 | 第137-140页 |
| 3. 免疫组织化学染色 | 第140页 |
| 4. 统计学分析 | 第140-141页 |
| 参考文献 | 第141-152页 |
| 课题资助基金 | 第152-153页 |
| 致谢 | 第153-156页 |
| 个人简介 | 第156页 |
| 教育背景 | 第156页 |
| 获奖情况 | 第156页 |
| 发表论文及参加会议 | 第156-157页 |
