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SRF和MEF2及其DNA结合位点保守和演化研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一章 文献综述第12-19页
   ·转录调控的保守和演化第12-14页
   ·MADS-box 转录因子家族第14-16页
     ·MADS-box 基因分布第14-15页
     ·MADS-box 基因类型第15-16页
   ·动物 MADS-box 转录因子第16-17页
     ·SRF 的表达和功能第16-17页
     ·MEF2 的表达和功能第17页
   ·SRF 和 MEF2 的 DNA 结合位点第17-18页
     ·相似性和差异性第17页
     ·SRF 结合位点第17-18页
   ·本论文研究内容和意义第18-19页
第二章 功能 CArG box 侧翼 DNA 序列特征研究第19-28页
   ·材料和方法第19-20页
     ·功能 CArG box 侧翼序列第19页
     ·背景 CArG box 侧翼序列第19页
     ·卡方拟合优度检验和计算机模拟第19页
     ·卡方独立性检验和计算机模拟第19-20页
   ·结果和分析第20-26页
     ·人和小鼠功能 CArG box 侧翼位点第20-22页
     ·一致性 CArG box 和 CArG-like box 侧翼位点第22-24页
     ·功能 CArG box 侧翼序列中二联子分布第24页
     ·功能 CArG box 及其侧翼碱基位点关联性第24-26页
   ·讨论第26-28页
     ·影响 SRF 与 CArG box 结合的因素第26页
     ·功能 CArG box 侧翼保守位点作用第26页
     ·功能 CArG-like box 侧翼保守位点第26-27页
     ·CpG 含量等其它因素的影响第27-28页
第三章 MADS 功能域及其 DNA 结合位点保守和演化第28-40页
   ·材料和方法第28-29页
     ·MADS box 及其 DNA 结合位点第28页
       ·SRF 和 MEF2 型 MADS 功能域第28页
       ·SRF 和 MEF2 型 DNA 结合位点第28页
       ·SRF 型 DNA 结合位点同源序列第28页
     ·MADS 和 DNA 结合位点 LOGO 图第28-29页
     ·功能 CArG box 的分类第29页
     ·MADS box 祖先序列推导第29页
   ·结果和分析第29-37页
     ·MADS box 的保守和演化第30-31页
     ·MADS box 祖先序列 AncMADS第31-33页
     ·MADS box 的 DNA 结合位点第33-34页
     ·功能 CArG box 保守和演化第34-37页
   ·讨论第37-40页
     ·MADS box 保守位点第37页
     ·MADS box 演化位点第37-38页
       ·影响 MADS-DNA 空间结构的位点第37-38页
       ·影响 MADS 二聚体形成的位点第38页
     ·AncMADS 的功能演化第38页
     ·AncMADS 的结合位点第38-39页
     ·DNA 结合位点弯曲度第39页
     ·SRF 结合位点的演化第39-40页
第四章 脊椎动物 MEF2A-D 基因起源、保守和演化第40-50页
   ·材料和方法第40-41页
     ·数据搜集和序列比对第40页
     ·MEF2 系统演化分析第40页
     ·MEF2A-D 选择压力检测第40-41页
   ·结果和分析第41-47页
     ·MEF2 同源基因系统演化树第41-42页
     ·MEF2A-D 在小鼠和人中的演化速度第42-43页
     ·MEF2A-D 各演化枝受到的自然选择第43-44页
     ·MEF2A-D 内部位点受到的自然选择第44-45页
     ·MEF2A-D 演化枝内部位点受到的自然选择第45-46页
     ·SRF 和 MEF2 型 MADS 转录因子的演化第46-47页
   ·讨论第47-50页
     ·脊椎动物 MEF2 基因复制第47-48页
     ·MEF2A-D 功能分歧和冗余第48页
     ·小鼠和人中 MADS 演化速度第48-49页
     ·动物 SRF 和 MEF2 演化速度第49-50页
第五章 总结和展望第50-52页
参考文献第52-60页
附录第60-104页
致谢第104-106页
个人简介第106页

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