摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-19页 |
·转录调控的保守和演化 | 第12-14页 |
·MADS-box 转录因子家族 | 第14-16页 |
·MADS-box 基因分布 | 第14-15页 |
·MADS-box 基因类型 | 第15-16页 |
·动物 MADS-box 转录因子 | 第16-17页 |
·SRF 的表达和功能 | 第16-17页 |
·MEF2 的表达和功能 | 第17页 |
·SRF 和 MEF2 的 DNA 结合位点 | 第17-18页 |
·相似性和差异性 | 第17页 |
·SRF 结合位点 | 第17-18页 |
·本论文研究内容和意义 | 第18-19页 |
第二章 功能 CArG box 侧翼 DNA 序列特征研究 | 第19-28页 |
·材料和方法 | 第19-20页 |
·功能 CArG box 侧翼序列 | 第19页 |
·背景 CArG box 侧翼序列 | 第19页 |
·卡方拟合优度检验和计算机模拟 | 第19页 |
·卡方独立性检验和计算机模拟 | 第19-20页 |
·结果和分析 | 第20-26页 |
·人和小鼠功能 CArG box 侧翼位点 | 第20-22页 |
·一致性 CArG box 和 CArG-like box 侧翼位点 | 第22-24页 |
·功能 CArG box 侧翼序列中二联子分布 | 第24页 |
·功能 CArG box 及其侧翼碱基位点关联性 | 第24-26页 |
·讨论 | 第26-28页 |
·影响 SRF 与 CArG box 结合的因素 | 第26页 |
·功能 CArG box 侧翼保守位点作用 | 第26页 |
·功能 CArG-like box 侧翼保守位点 | 第26-27页 |
·CpG 含量等其它因素的影响 | 第27-28页 |
第三章 MADS 功能域及其 DNA 结合位点保守和演化 | 第28-40页 |
·材料和方法 | 第28-29页 |
·MADS box 及其 DNA 结合位点 | 第28页 |
·SRF 和 MEF2 型 MADS 功能域 | 第28页 |
·SRF 和 MEF2 型 DNA 结合位点 | 第28页 |
·SRF 型 DNA 结合位点同源序列 | 第28页 |
·MADS 和 DNA 结合位点 LOGO 图 | 第28-29页 |
·功能 CArG box 的分类 | 第29页 |
·MADS box 祖先序列推导 | 第29页 |
·结果和分析 | 第29-37页 |
·MADS box 的保守和演化 | 第30-31页 |
·MADS box 祖先序列 AncMADS | 第31-33页 |
·MADS box 的 DNA 结合位点 | 第33-34页 |
·功能 CArG box 保守和演化 | 第34-37页 |
·讨论 | 第37-40页 |
·MADS box 保守位点 | 第37页 |
·MADS box 演化位点 | 第37-38页 |
·影响 MADS-DNA 空间结构的位点 | 第37-38页 |
·影响 MADS 二聚体形成的位点 | 第38页 |
·AncMADS 的功能演化 | 第38页 |
·AncMADS 的结合位点 | 第38-39页 |
·DNA 结合位点弯曲度 | 第39页 |
·SRF 结合位点的演化 | 第39-40页 |
第四章 脊椎动物 MEF2A-D 基因起源、保守和演化 | 第40-50页 |
·材料和方法 | 第40-41页 |
·数据搜集和序列比对 | 第40页 |
·MEF2 系统演化分析 | 第40页 |
·MEF2A-D 选择压力检测 | 第40-41页 |
·结果和分析 | 第41-47页 |
·MEF2 同源基因系统演化树 | 第41-42页 |
·MEF2A-D 在小鼠和人中的演化速度 | 第42-43页 |
·MEF2A-D 各演化枝受到的自然选择 | 第43-44页 |
·MEF2A-D 内部位点受到的自然选择 | 第44-45页 |
·MEF2A-D 演化枝内部位点受到的自然选择 | 第45-46页 |
·SRF 和 MEF2 型 MADS 转录因子的演化 | 第46-47页 |
·讨论 | 第47-50页 |
·脊椎动物 MEF2 基因复制 | 第47-48页 |
·MEF2A-D 功能分歧和冗余 | 第48页 |
·小鼠和人中 MADS 演化速度 | 第48-49页 |
·动物 SRF 和 MEF2 演化速度 | 第49-50页 |
第五章 总结和展望 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-60页 |
附录 | 第60-104页 |
致谢 | 第104-106页 |
个人简介 | 第106页 |