转录调控序列数据挖掘研究与实现
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-15页 |
| ·研究背景 | 第8-12页 |
| ·生物信息学 | 第8-9页 |
| ·生物数据挖掘 | 第9-11页 |
| ·转录调控序列挖掘 | 第11-12页 |
| ·研究意义 | 第12-13页 |
| ·本文工作 | 第13页 |
| ·文章结构 | 第13-15页 |
| 第2章 转录调控序列数据挖掘的研究现状 | 第15-26页 |
| ·生物学背景 | 第15-16页 |
| ·转录因子识别和分类 | 第16-19页 |
| ·KNN方法 | 第17-18页 |
| ·HMM方法 | 第18-19页 |
| ·顺式调控元件挖掘 | 第19-25页 |
| ·基于字串的算法 | 第20-21页 |
| ·基于概率模型的方法 | 第21-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 基于支持向量机的转录因子识别和分类方法 | 第26-35页 |
| ·转录因子概述 | 第26-27页 |
| ·转录因子识别和分类问题分析 | 第27-28页 |
| ·基于支持向量机的转录因子识别和分类算法 | 第28-31页 |
| ·问题定义 | 第28-29页 |
| ·算法描述 | 第29-31页 |
| ·实验 | 第31-34页 |
| ·数据来源 | 第31页 |
| ·算法准确率等相关性能比较 | 第31-32页 |
| ·算法推广能力比较 | 第32-33页 |
| ·实验结果分析 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第4章 基于半监督支持向量机的顺式调控元件挖掘 | 第35-45页 |
| ·顺式调控元件挖掘问题分析 | 第35-37页 |
| ·半监督支持向量机 | 第37-38页 |
| ·顺式调控元件识别 | 第38-41页 |
| ·数据集 | 第38页 |
| ·训练和测试 | 第38-39页 |
| ·算法评测工具及指标 | 第39页 |
| ·编码方法 | 第39-40页 |
| ·核函数 | 第40-41页 |
| ·实验 | 第41-43页 |
| ·MEME和AlignACE的评估 | 第41-42页 |
| ·Match的评估 | 第42页 |
| ·S~3VMBSP的评估与对比 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 第5章 转录调控序列数据挖掘系统TBMiner | 第45-53页 |
| ·转录调控序列数据挖掘系统概述 | 第45-47页 |
| ·系统功能和实现 | 第47-52页 |
| ·顺式调控元件挖掘工具 | 第47-51页 |
| ·转录因子挖掘工具 | 第51-52页 |
| ·本章小结 | 第52-53页 |
| 第6章 总结与展望 | 第53-55页 |
| ·总结 | 第53-54页 |
| ·研究展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 附录 | 第59-60页 |
| A 发表论文 | 第59页 |
| B 参加项目 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
