中文摘要 | 第1-7页 |
英文摘要 | 第7-9页 |
1 前言 | 第9-19页 |
1.1 分子系统学 | 第9-11页 |
1.1.1 基本原理 | 第9页 |
1.1.2 分子系统学技术 | 第9-10页 |
1.1.3 分子系统发育树的主要构建方法 | 第10-11页 |
1.2 分子系统地理学 | 第11-15页 |
1.2.1 何谓分子系统地理学 | 第11-12页 |
1.2.2 中性理论和分子进化 | 第12-13页 |
1.2.3 网状支系分析 | 第13-14页 |
1.2.4 应用 | 第14页 |
1.2.5 存在的问题与展望 | 第14-15页 |
1.3 黄颡鱼属简介及研究进展 | 第15-17页 |
1.4 研究内容 | 第17-18页 |
1.4.1 研究类群的选取 | 第17页 |
1.4.2 分子标记的选择 | 第17-18页 |
1.5 本研究的目的 | 第18-19页 |
2 材料与方法 | 第19-29页 |
2.1 材料采集及实验样品 | 第19页 |
2.2 主要实验试剂、溶液和仪器 | 第19-23页 |
2.2.1 主要实验试剂 | 第19页 |
2.2.2 主要溶液 | 第19-23页 |
2.2.3 主要仪器 | 第23页 |
2.3 实验步骤 | 第23-26页 |
2.3.1 基因组 DNA的提取及检测 | 第23-24页 |
2.3.2 PCR扩增 | 第24页 |
2.3.3 DNA的纯化、回收和测序 | 第24-26页 |
2.4 数据分析 | 第26-29页 |
2.4.1 序列排定 | 第26页 |
2.4.2 系统发育分析 | 第26-27页 |
2.4.2.1 邻接法(NJ) | 第26页 |
2.4.2.2 最大简约法(MP) | 第26页 |
2.4.2.3 贝叶斯法(Bayesian) | 第26-27页 |
2.4.3 种群遗传分析 | 第27-29页 |
3 结果 | 第29-43页 |
3.1 线粒体 DNA(mtDNA) ND4基因序列及其碱基组成 | 第29-30页 |
3.2 系统发育分析 | 第30-31页 |
3.2.1 邻接法(NJ) | 第30页 |
3.2.2 最大简约法(MP) | 第30页 |
3.2.3 贝叶斯法(Bayesian) | 第30-31页 |
3.2.4 三种不同方法重建之系统发育树的比较 | 第31页 |
3.3 种群遗传结构分析 | 第31-43页 |
3.3.1 种群遗传多样性及网络关系 | 第31页 |
3.3.2 种群动态历史 | 第31-43页 |
4 讨论 | 第43-49页 |
4.1 线粒体 DNA ND4基因 | 第43页 |
4.2 中国黄颡鱼属鱼类的种间关系 | 第43页 |
4.3 黄颡鱼属鱼类的种群遗传结构 | 第43-49页 |
4.3.1 普通黄颡鱼的种群遗传结构 | 第43-45页 |
4.3.2 光泽黄颡鱼的种群遗传结构 | 第45-46页 |
4.3.3 瓦氏黄颡鱼的种群遗传结构 | 第46-47页 |
4.3.4 长须黄颡鱼的种群遗传结构 | 第47页 |
4.3.5 黄颡鱼属鱼类种群遗传结构小结 | 第47-49页 |
5 结论 | 第49-50页 |
5.1 线粒体 DNA ND4基因 | 第49页 |
5.2 黄颡鱼属鱼类的种间关系 | 第49页 |
5.3 黄颡鱼属鱼类的种群遗传结构 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-56页 |
致谢 | 第56页 |