基于特征融合的膜蛋白跨膜螺旋预测
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 目录 | 第5-7页 |
| 1. 绪论 | 第7-13页 |
| ·引言 | 第7页 |
| ·研究的背景 | 第7-11页 |
| ·生物信息学研究及其进展 | 第7-8页 |
| ·蛋白质的结构模型 | 第8页 |
| ·蛋白质序列分析的主要内容 | 第8-9页 |
| ·蛋白质二级结构预测 | 第9-10页 |
| ·膜蛋白及其结构预测研究 | 第10-11页 |
| ·本文研究的主要内容 | 第11页 |
| ·论文的组织与结构 | 第11-13页 |
| 2. 膜蛋白结构与预测 | 第13-27页 |
| ·蛋白质概述 | 第13-14页 |
| ·蛋白质的结构层次 | 第14-15页 |
| ·蛋白质一级结构 | 第14页 |
| ·蛋白质的空间结构 | 第14-15页 |
| ·蛋白质结构测定 | 第15页 |
| ·蛋白质二级结构预测的经验参数方法 | 第15-19页 |
| ·膜蛋白概述 | 第19页 |
| ·膜蛋白分类 | 第19-22页 |
| ·内在膜蛋白 | 第20页 |
| ·外周蛋白 | 第20-21页 |
| ·脂锚定蛋白 | 第21页 |
| ·膜蛋白六分类模型 | 第21-22页 |
| ·膜蛋白功能 | 第22-23页 |
| ·膜蛋白结构预测 | 第23-25页 |
| ·本章小结 | 第25-27页 |
| 3. 基于特征融合的跨膜螺旋预测 | 第27-44页 |
| ·氨基酸特征提取 | 第27-36页 |
| ·特定位置得分矩阵(PSSM) | 第27-28页 |
| ·主成分分析(PCA) | 第28-29页 |
| ·PSSM特征提取与进化信息特征 | 第29-30页 |
| ·氨基酸疏水性特征 | 第30-32页 |
| ·氨基酸结构倾向性与螺旋倾向性特征 | 第32-34页 |
| ·氨基酸分布偏好性与跨膜末端倾向性特征 | 第34-35页 |
| ·特征融合 | 第35-36页 |
| ·预测模型建立 | 第36-41页 |
| ·朴素贝叶斯分类算法 | 第36页 |
| ·决策树分类算法 | 第36-37页 |
| ·KNN分类算法 | 第37-39页 |
| ·分类算法评价(交叉验证) | 第39-40页 |
| ·分类算法选择 | 第40-41页 |
| ·OET-KNN分类模型 | 第41-42页 |
| ·预测模型算法流程 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 4. 实验过程与结果分析 | 第44-55页 |
| ·数据来源 | 第44-45页 |
| ·SWISS-PROT数据库 | 第44页 |
| ·PDB | 第44-45页 |
| ·标准数据集 | 第45-47页 |
| ·预测结果评价标准 | 第47-48页 |
| ·预测结果与性能分析 | 第48-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 5. 总结与展望 | 第55-57页 |
| ·全部工作总结 | 第55-56页 |
| ·以后工作展望 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 附录 | 第62页 |
