| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 绪论 | 第7-10页 |
| 第1章 DNA分子的结构特征、"KINK"结构及柔性缺陷模型 | 第10-23页 |
| ·脱氧核糖核酸分子的分子结构特征 | 第10-14页 |
| ·DNA分子"KINK"结构 | 第14-16页 |
| ·柔性缺陷模型 | 第16-23页 |
| 第2章 柔性陷构模型对微环拓扑结构的影响 | 第23-43页 |
| ·模型及算法 | 第23-25页 |
| ·关于含有柔性缺陷结构DNA微环相关性质影响的讨论 | 第25-31页 |
| ·扭转数分布的计算 | 第31-35页 |
| ·连接数分布 | 第35-43页 |
| 第3章 一个荧光单分子实验困难的解决 | 第43-53页 |
| ·荧光单分子实验及其遇到的困难 | 第43-45页 |
| ·实验困难的解决 | 第45-49页 |
| ·模拟结果及讨论 | 第49-53页 |
| 第4章 蛋白质对DNA分子拓扑构象的影响 | 第53-66页 |
| ·概述 | 第53-55页 |
| ·模型 | 第55-56页 |
| ·蛋白质绑定对环状DNA分子的相关性质影响 | 第56-62页 |
| ·蛋白质绑定对线性DNA分子的相关性质影响 | 第62-66页 |
| 第5章 DNA凝聚理论蒙特卡洛模拟研究 | 第66-89页 |
| ·DNA凝聚的研究背景 | 第66-74页 |
| ·我们的DNA分子凝聚模型 | 第74-75页 |
| ·结果与讨论 | 第75-89页 |
| 第6章 展望 | 第89-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 主要参考文献 | 第92-103页 |
| 附录 | 第103-144页 |
| 附录1 含有不同柔性缺陷个数的DNA微环构象出现的几率 | 第103-104页 |
| 附录2 平均扭转数分布的计算 | 第104-109页 |
| 附录3 DNA分子凝聚源程序 | 第109-141页 |
| 附录4 博士期间发表的论文 | 第141-142页 |
| 附录5 博士期间参加及主持的基金项目 | 第142-144页 |
