| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-18页 |
| ·长雄野生稻的研究背景 | 第12-14页 |
| ·野生稻作为一个有用的基因库 | 第12页 |
| ·长雄野生稻的有利性状/基因发掘利用 | 第12-13页 |
| ·长雄野生稻地下茎性状/基因的研究进展 | 第13页 |
| ·植物地下茎表达相关的研究 | 第13-14页 |
| ·基因芯片分析技术 | 第14-16页 |
| ·基因芯片技术及作用 | 第14-15页 |
| ·基因芯片实验设计的过程 | 第15页 |
| ·水稻基因芯片的开发及应用 | 第15-16页 |
| ·长雄野生稻地下茎性状研究的意义 | 第16-18页 |
| 第二章 长雄野生稻地下茎基因RHZ2、RHZ3的精细定位 | 第18-39页 |
| ·长雄野生稻地下茎基因RHZ2、RHZ3精细定位的思路 | 第18-20页 |
| ·材料与方法 | 第20-25页 |
| ·地下茎基因Rhz2、Rhz3精细定位的分离群体构建及性状评价 | 第20页 |
| ·地下茎基因Rhz2、Rhz3精细定位的分子标记设计 | 第20页 |
| ·地下茎的田间表型评价标准 | 第20-21页 |
| ·DNA的提取、准备 | 第21-24页 |
| ·DNA浓度的校正 | 第24页 |
| ·SSR扩增反应 | 第24页 |
| ·PCR产物的电泳、染色和数据的读取 | 第24页 |
| ·作图方法 | 第24-25页 |
| ·结果与分析 | 第25-38页 |
| ·F_2群体地下茎的表型及基因型分析 | 第25-26页 |
| ·具有目标性状的F_2单株的筛选 | 第26页 |
| ·F_3群体(36-1)的表型及基因型分析 | 第26-27页 |
| ·F_3群体(34-31)的表型及基因型分析 | 第27-30页 |
| ·F_3群体(22-91)的表型及基因型分析 | 第30-33页 |
| ·F_3群体(14-2)的表型及基因型分析 | 第33-34页 |
| ·地下茎基因Rhz2、Rhz3可能的位点 | 第34-38页 |
| ·小结 | 第38-39页 |
| 第三章 长雄野生稻地下茎基囚的全基因组表达谱分析 | 第39-54页 |
| ·材料与方法 | 第39-42页 |
| ·长雄野生稻材料及RNA样品制备 | 第39页 |
| ·芯片实验和数据分析 | 第39-40页 |
| ·组织特异基因顺式作用调节元件的功能分类和预测 | 第40页 |
| ·地下茎特异表达基因与遗传图谱上地下茎相关QTLs比对和物理作图 | 第40页 |
| ·验证组织特异基因表达的半定量RT-PCR方法 | 第40-42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-53页 |
| ·长雄野生稻5种不同组织基因表达的总体变化 | 第42-44页 |
| ·长雄野生稻5种组织富集基因的功能分类 | 第44-49页 |
| ·长雄野生稻地下茎生长点(RT)相比地上茎生长点(ST)中不同的表达基因 | 第49-50页 |
| ·长雄野生稻不同组织中特异表达基因顺式调控元件的鉴定 | 第50-51页 |
| ·水稻和高梁地下茎特异表达基因以及地下茎相关基因的共定位 | 第51-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 第四章 讨论 | 第54-59页 |
| ·长雄野生稻地下茎显性互补基因的精细定位问题 | 第54-56页 |
| ·长雄野生稻地下茎生长点(RT)富集的基因具有地下茎生长和发育的特殊功能 | 第56页 |
| ·长雄野生稻地下茎生长点(RT)中具有不同功能基因的调节方式 | 第56-57页 |
| ·几个顺式调控元件可能在地下茎发育中发挥重要调节作用 | 第57页 |
| ·长雄野生稻地下茎特异表达基因和地下茎丰度以及长度QTLs的相关性 | 第57-59页 |
| 第五章 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-70页 |
| 致谢 | 第70-72页 |
| 作者简历 | 第72-73页 |
| 发表论文 | 第73页 |
