| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-28页 |
| ·水稻耐盐性的研究进展 | 第16-23页 |
| ·植物耐盐相关表型及生理性状的研究进展 | 第16-18页 |
| ·水稻耐盐QTL研究进展 | 第18-20页 |
| ·植物耐盐相关基因克隆研究进展 | 第20-22页 |
| ·植物激素与耐盐 | 第22-23页 |
| ·基因芯片分析技术 | 第23-24页 |
| ·基因芯片分析技术的原理及分类 | 第23页 |
| ·基因芯片分析技术在植物中的应用 | 第23-24页 |
| ·DNA甲基化与植物抗逆性 | 第24-27页 |
| ·DNA甲基化的原理 | 第25页 |
| ·DNA甲基化的相关酶 | 第25页 |
| ·DNA甲基化在植物生长发育及非生物抗性中的作用 | 第25-27页 |
| ·DNA甲基化的潜在育种应用 | 第27页 |
| ·本论文研究内容及意义 | 第27-28页 |
| 第二章 水稻耐盐聚合系的筛选及相关表型分析 | 第28-51页 |
| ·材料与方法 | 第28-31页 |
| ·水稻耐盐聚合系的构建 | 第28页 |
| ·水稻耐盐聚合系的初步筛选 | 第28页 |
| ·水稻耐盐聚合系的严格筛选 | 第28页 |
| ·水稻耐盐聚合系的基因型分析 | 第28-30页 |
| ·水稻耐盐聚合系的田间表型鉴定 | 第30页 |
| ·水稻耐盐聚合系的耐盐相关表型及生理性状鉴定 | 第30-31页 |
| ·结果与分析 | 第31-47页 |
| ·水稻聚合系的耐盐初步筛选结果 | 第31-32页 |
| ·水稻耐盐聚合系的表型重复鉴定 | 第32-33页 |
| ·水稻耐盐聚合系的基因型分析 | 第33-34页 |
| ·水稻耐盐聚合系的田间产量鉴定 | 第34-35页 |
| ·水稻耐盐聚合系的耐盐相关表型及生理性状分析 | 第35-47页 |
| ·讨论 | 第47-50页 |
| ·水稻聚合育种策略在耐盐育种中的应用 | 第47-48页 |
| ·盐胁迫对水稻耐盐聚合系生长及相关表型的影响 | 第48-49页 |
| ·盐胁迫对水稻聚合系钾钠离子吸收的影响 | 第49页 |
| ·水稻耐盐聚合系之间的表型差异分析 | 第49-50页 |
| ·小结 | 第50-51页 |
| 第三章 水稻耐盐聚合系的全基因组表达谱分析 | 第51-99页 |
| ·材料与方法 | 第51-52页 |
| ·实验材料及处理 | 第51页 |
| ·表型分析及钾钠离子浓度测定 | 第51页 |
| ·RNA的提取及芯片分析 | 第51-52页 |
| ·芯片数据处理 | 第52页 |
| ·Real time-PCR验证差异基因的表达 | 第52页 |
| ·结果与分析 | 第52-94页 |
| ·水稻耐盐聚合系177-103和IR64在盐和盐+ABA处理下的相关表型分析 | 第52-55页 |
| ·芯片结果的可靠性和样品的相关性分析 | 第55-56页 |
| ·IR64和177-103在三种处理条件下的表达基因数目 | 第56-57页 |
| ·不同基因型,不同组织以及不同处理条件下的全基因表达谱分析 | 第57-58页 |
| ·差异基因在不同基因型,不同组织以及不同处理条件下的重叠 | 第58-60页 |
| ·盐处理诱导的差异表达基因 | 第60-74页 |
| ·ABA诱导的差异表达基因 | 第74-83页 |
| ·盐处理条件下的水稻全基因组转录因子表达谱分析 | 第83-86页 |
| ·盐处理条件下的导入片段区间内的差异表达基因 | 第86-89页 |
| ·盐处理条件下的差异表达基因的染色体分布及与耐盐相关QTL的对应情况 | 第89-94页 |
| ·芯片结果的Real time-PCR验证 | 第94页 |
| ·讨论 | 第94-98页 |
| ·外施激素ABA对水稻耐盐的影响 | 第94-95页 |
| ·盐胁迫条件下耐盐聚合系177-103和轮回亲本IR64的表达谱分析 | 第95-96页 |
| ·盐胁迫条件下差异基因表达的组织特异性 | 第96页 |
| ·ABA诱导的基因变化及与耐盐性的影响 | 第96-97页 |
| ·盐处理条件下的差异基因与耐盐QTL的对应关系 | 第97-98页 |
| ·小结 | 第98-99页 |
| 第四章 干旱诱导的位点特异性DNA甲基化与水稻的抗旱性 | 第99-125页 |
| ·材料与方法 | 第99-102页 |
| ·试验材料 | 第99-100页 |
| ·IR64和DK151的基因型分析以及抗旱表型鉴定 | 第100页 |
| ·干旱处理 | 第100页 |
| ·DNA甲基化敏感性扩增多态性分析 | 第100-102页 |
| ·结果与分析 | 第102-122页 |
| ·IR64和DK151的遗传背景差异分析 | 第102页 |
| ·IR64和DK151在对照和干旱条件下相关表型鉴定结果 | 第102-105页 |
| ·DK151和IR64 DNA甲基化的基本模式 | 第105-106页 |
| ·DK151和IR64在不同组织,不同生长发育时期DNA甲基化水平变化情况 | 第106页 |
| ·DK151和IR64在对照,干旱胁迫及复水过程中DNA甲基化水平变化情况 | 第106-110页 |
| ·DK151和IR64在对照,干旱胁迫及复水过程中DNA甲基化多态性变化情况 | 第110-117页 |
| ·在干旱胁迫及复水过程中DNA甲基化的不同基因型,不同组织和不同发育时期的特异性 | 第117页 |
| ·在差异片段的序列同源性分析结果 | 第117-122页 |
| ·讨论 | 第122-124页 |
| ·DNA甲基化与水稻抗旱性 | 第122页 |
| ·DNA甲基化的品种,组织和发育时期特异性 | 第122-123页 |
| ·DNA甲基化的可逆性和隔代遗传 | 第123-124页 |
| ·小结 | 第124-125页 |
| 第五章 两个耐盐性不同的水稻品种在盐胁迫条件下的DNA甲基化分析 | 第125-146页 |
| ·材料与方法 | 第125-126页 |
| ·试验材料 | 第125页 |
| ·FL478和IR29的基因型分析 | 第125页 |
| ·FL478和IR29的盐处理及相关表型分析 | 第125-126页 |
| ·DNA甲基化敏感性扩增多态性分析 | 第126页 |
| ·结果与分析 | 第126-142页 |
| ·FL478和IR29的遗传背景差异分析 | 第126页 |
| ·FL478和IR29在对照和盐胁迫条件下相关表型及生理分析结果 | 第126-130页 |
| ·FL478和IR29 DNA甲基化的基本模式 | 第130页 |
| ·FL478和IR29在不同组织,不同生长发育时期DNA甲基化水平变化情况 | 第130-133页 |
| ·FL478和IR29在对照,盐胁迫过程中DNA甲基化水平变化情况 | 第133-134页 |
| ·FL478和IR29在对照,盐胁迫过程中DNA甲基化多态性变化情况 | 第134-139页 |
| ·差异片段的序列同源性分析结果 | 第139-142页 |
| ·讨论 | 第142-145页 |
| ·DNA甲基化与植物耐盐性 | 第142页 |
| ·耐盐品种FL478和盐敏感对照IR29的DNA甲基化差异及组织和发育时期特异性 | 第142-143页 |
| ·MSAP差异片段的染色体定位以及与FL478和IR29之间遗传基础差异的关系 | 第143-144页 |
| ·MSAP差异片段的同源性分析及与植物抗逆性的关系 | 第144页 |
| ·转座子的DNA甲基化 | 第144-145页 |
| ·小结 | 第145-146页 |
| 第六章 结论 | 第146-147页 |
| 参考文献 | 第147-160页 |
| 致谢 | 第160-161页 |
| 作者简历 | 第161页 |
| 博士期间发表论文 | 第161页 |
