| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 符号及缩略词对照表 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-18页 |
| 1. 昆虫病原线虫的研究现状 | 第10-12页 |
| 1.1 昆虫病原线虫及共生菌分类概况 | 第10页 |
| 1.2 昆虫病原线虫及共生菌致病性 | 第10-11页 |
| 1.3 拟异小杆属昆虫病原线虫及其共生菌相关研究 | 第11-12页 |
| 2. 高通量测序技术及应用 | 第12-14页 |
| 2.1 转录组概念 | 第12-13页 |
| 2.2 转录组测序 | 第13页 |
| 2.3 测序平台优势及应用 | 第13-14页 |
| 3. 线虫的相关信号通路的研究 | 第14-17页 |
| 3.1 与线虫应激、寿命调控相关信号通路研究 | 第14-15页 |
| 3.2 与线虫滞育机制相关信号通路研究 | 第15-16页 |
| 3.3 与线虫免疫相关通路研究 | 第16-17页 |
| 4. 实验目的及意义 | 第17-18页 |
| 第二章 Heterorhabditidoides-serratia转录组从头测序及功能注释分析 | 第18-46页 |
| 1. 材料与方法 | 第18-24页 |
| 1.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 1.1.1 实验样品 | 第18页 |
| 1.1.2 主要试剂 | 第18页 |
| 1.1.3 主要仪器设备 | 第18-19页 |
| 1.1.4 主要生物信息学数据库和计算机软件 | 第19页 |
| 1.2 实验方法 | 第19-24页 |
| 1.2.1 总RNA提取 | 第19-20页 |
| 1.2.1.1 总RNA提取前准备 | 第19页 |
| 1.2.1.2 总RNA提取方法 | 第19-20页 |
| 1.2.1.3 DNase I的处理 | 第20页 |
| 1.2.1.4 总RNA检测 | 第20页 |
| 1.2.2 Illumina测序 | 第20-21页 |
| 1.2.3 转录组数据的组装 | 第21-22页 |
| 1.2.4 转录组数据的分析 | 第22-24页 |
| 1.2.4.1 Blast比对 | 第23页 |
| 1.2.4.2 Unigene功能注释及COG分类 | 第23页 |
| 1.2.4.3 Unigene的GO分类 | 第23页 |
| 1.2.4.4 Unigene Pathway分析 | 第23页 |
| 1.2.4.5 编码蛋白框的预测 | 第23-24页 |
| 2. 实验结果及分析 | 第24-42页 |
| 2.1 RNA提取质量检测 | 第24页 |
| 2.2 Illumina测序产量统计 | 第24页 |
| 2.3 组装结果分析 | 第24-25页 |
| 2.4 Unigene功能注释及COG分类 | 第25-28页 |
| 2.5 Unigene的GO分析 | 第28-29页 |
| 2.6 Unigene pathway分析 | 第29-37页 |
| 2.6.1 PCR克隆验证 | 第36-37页 |
| 2.7 编码蛋白框(CDS)预测 | 第37-39页 |
| 2.8 SSR及SNP结果 | 第39-42页 |
| 3. 讨论 | 第42-46页 |
| 3.1 测序效率 | 第42页 |
| 3.2 相关功能通路分析 | 第42-43页 |
| 3.3 SSR分析和SNP分析 | 第43-46页 |
| 全文总结 | 第46-48页 |
| 创新点 | 第48-50页 |
| 不足与展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
