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锑氧化型根癌农杆菌GW4中砷氧化酶AioBA对锑氧化、趋化和能量代谢的影响

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略语表第11-12页
1 前言第12-26页
    1.1 锑与锑污染第12-13页
    1.2 微生物对锑的代谢机制第13-17页
        1.2.1 微生物对锑的转运第14页
        1.2.2 微生物对锑的甲基化第14-15页
        1.2.3 微生物对锑的还原第15-16页
        1.2.4 微生物对锑的氧化第16-17页
    1.3 细菌运动与趋化第17-18页
    1.4 土壤杆菌属第18页
    1.5 蛋白质组学研究概况第18-23页
        1.5.1 蛋白质组学简介第18-19页
        1.5.2 蛋白质组学主要的研究技术第19-22页
            1.5.2.1 双向电泳第19-20页
            1.5.2.2 免疫共沉淀第20页
            1.5.2.3 酵母双杂交第20-21页
            1.5.2.4 蛋白质芯片第21页
            1.5.2.5 同位素标记相对和绝对定量技术第21-22页
        1.5.3 微生物蛋白质组学第22-23页
            1.5.3.1 病原微生物的蛋白质组学研究第22-23页
            1.5.3.2 逆境胁迫条件下的微生物蛋白质组学研究第23页
    1.6 本课题研究的立体背景和研究目的及技术路线第23-26页
        1.6.1 本课题研究的立体背景和研究目的第23-25页
        1.6.2 本课题研究的技术路线第25-26页
2 材料与方法第26-40页
    2.1 实验材料第26-30页
        2.1.1 实验菌株、质粒及引物第26-28页
        2.1.2 培养基配置及主要成分第28页
        2.1.3 酶与试剂盒来源第28页
        2.1.4 其它主要试剂及配方第28-30页
    2.2 实验方法第30-40页
        2.2.1 生长、氧化和抗性实验第30页
        2.2.2 平板游动法检测细菌对Sb(Ⅲ)的趋化性第30页
        2.2.3 双向电泳实验操作方法第30-33页
            2.2.3.1 全细胞蛋白质提取第30-31页
            2.2.3.2 蛋白质定量(Bradford法)第31页
            2.2.3.3 等电聚焦第31-32页
            2.2.2.4 SDS-PAGE电泳第32-33页
            2.2.3.5 硝酸银染色(质谱兼容)第33页
            2.2.3.6 图像扫描及分析第33页
        2.2.4 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)第33-35页
            2.2.4.1 细菌总RNA的抽提第33-34页
            2.2.4.2 DNase Ⅰ消化总RNA中的DNA第34页
            2.2.4.3 反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)第34-35页
            2.2.4.4 荧光定量PCR第35页
        2.2.5 检测细菌Sb(Ⅲ)氧化过程中的H202含量变化第35-36页
        2.2.6 细菌胞内ATP和NADH的含量检测第36-37页
        2.2.7 微量热法检测细菌产热量第37-40页
3 结果与分析第40-58页
    3.1 实验菌株的生长、Sb(Ⅲ)抗性和Sb(Ⅲ)氧化实验第40-42页
        3.1.1 加Sb(Ⅲ)条件下的生长实验第40-41页
        3.1.2 Sb(Ⅲ)抗性实验第41页
        3.1.3 Sb(Ⅲ)氧化实验第41-42页
    3.2 对Sb(Ⅲ)的趋化性实验第42-44页
    3.3 预测菌株GW4中蛋白质的等电点和分子量第44-45页
    3.4 双向电泳结果第45-48页
    3.5 差异蛋白质的功能分类第48-50页
    3.6 Sb(Ⅲ)氧化表型分析第50-52页
        3.6.1 荧光定量PCR检测Sb(Ⅲ)氧化相关基因的表达第50-51页
        3.6.2 Sb(Ⅲ)氧化过程中胞内H_2O_2含量检测第51-52页
    3.7 能量代谢第52-57页
        3.7.1 荧光定量PCR检测碳代谢和氨基酸代谢相关基因的表达第52-54页
        3.7.2 胞内NADH和ATP含量检测第54-55页
        3.7.3 微量热法检测菌株的微量热第55-57页
    3.8 其它代谢第57-58页
4 总结与讨论第58-60页
5 研究的创新性和展望第60-61页
参考文献第61-71页
附录第71-75页
发表的论文及获奖情况第75-76页
致谢第76页

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