| 中文摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 1 自然界中的水平基因转移现象 | 第15-34页 |
| 1.1 水平基因转移的概念 | 第15-16页 |
| 1.2 水平基因转移的途径 | 第16-29页 |
| 1.2.1 转化及其发生机制 | 第17-21页 |
| 1.2.2 接合及其发生机制 | 第21-23页 |
| 1.2.3 转导及其发生机制 | 第23-24页 |
| 1.2.4 基因转移因子(GTAs)介导的水平基因转移过程 | 第24-27页 |
| 1.2.5 其它水平基因转移方式 | 第27-29页 |
| 1.3 环境中供体DNA的贮存方式之一—缺陷性原噬菌体 | 第29-32页 |
| 1.4 枯草芽胞杆菌简介 | 第32页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第32-34页 |
| 2 枯草芽胞杆菌(B.subtilis)细胞间的遗传重组过程特性研究 | 第34-71页 |
| 2.1 实验材料 | 第34-42页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第34-37页 |
| 2.1.2 药品和试剂 | 第37-38页 |
| 2.1.3 培养基和溶液配制 | 第38-40页 |
| 2.1.4 引物 | 第40-41页 |
| 2.1.5 仪器 | 第41-42页 |
| 2.2 实验方法 | 第42-48页 |
| 2.2.1 E.coli质粒提取 | 第42页 |
| 2.2.2 B.subtilis质粒提取 | 第42-43页 |
| 2.2.3 B.subtilis基因组提取 | 第43页 |
| 2.2.4 E.coli感受态制备及转化 | 第43-44页 |
| 2.2.5 B.subtilis转化方法 | 第44页 |
| 2.2.6 B.subtilis细胞间遗传重组实验 | 第44页 |
| 2.2.7 B.subtilis相关基因敲除突变株的构建 | 第44-45页 |
| 2.2.8 B.subtilis培养液上清中DNA提取 | 第45页 |
| 2.2.9 缺陷性原噬菌体的诱导及浓度检测 | 第45-46页 |
| 2.2.10 B.subtilis细胞破碎方法 | 第46页 |
| 2.2.11 相关酶使用方法 | 第46页 |
| 2.2.12 U型管中进行的B.subtilis细胞间遗传重组实验 | 第46-48页 |
| 2.2.13 微孔滤膜上进行的B.subtilis细胞间遗传重组实验 | 第48页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第48-70页 |
| 2.3.1 B.subtilis细胞间的遗传重组现象 | 第48-52页 |
| 2.3.2 B.subtilis细胞间的遗传重组现象具有普遍性 | 第52-53页 |
| 2.3.3 DNase对B.subtilis细胞间遗传重组过程的影响 | 第53-54页 |
| 2.3.4 GTA类似因子—缺陷性原噬菌体PBSX对B.subtilis细胞间遗传重组过程的影响 | 第54-58页 |
| 2.3.5 供体菌活菌数对B.subtilis细胞间遗传重组过程的影响 | 第58-60页 |
| 2.3.6 人工提取DNA与供体细胞中DNA转移效率比较 | 第60-62页 |
| 2.3.7 细胞间的直接接触对B.subtilis细胞间遗传重组过程的重要性 | 第62-64页 |
| 2.3.8 B.subtilis胞间遗传重组过程不同于接合 | 第64-65页 |
| 2.3.9 微孔滤膜上进行的B.subtilis细胞间遗传重组过程 | 第65-70页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第70-71页 |
| 3 B.subtilis中PBSX类缺陷性原噬菌体的普遍性调查 | 第71-79页 |
| 3.1 实验材料和方法 | 第71-74页 |
| 3.1.1 实验菌株 | 第71-73页 |
| 3.1.2 实验材料及溶液配制 | 第73页 |
| 3.1.3 仪器 | 第73页 |
| 3.1.4 PBSX类缺陷性原噬菌体的检测 | 第73页 |
| 3.1.5 裂解液上清电镜观察 | 第73-74页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第74-77页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第77-79页 |
| 4 短小芽胞杆菌(B.pumilus)CCTCC AB94180中的缺陷性原噬菌体PBP180 | 第79-105页 |
| 4.1 实验材料 | 第79-84页 |
| 4.1.1 菌株 | 第79页 |
| 4.1.2 药品和试剂 | 第79-80页 |
| 4.1.3 培养基和溶液配制 | 第80-81页 |
| 4.1.4 引物 | 第81-84页 |
| 4.2 实验方法 | 第84-87页 |
| 4.2.1 淀粉水解实验 | 第84页 |
| 4.2.2 硝酸盐还原实验 | 第84-85页 |
| 4.2.3 马尿酸盐水解实验 | 第85页 |
| 4.2.4 Phusion聚合酶高保真扩增长片段DNA PCR体系 | 第85页 |
| 4.2.5 噬菌体样品诱导及纯化 | 第85-86页 |
| 4.2.6 SDS-PAGE | 第86-87页 |
| 4.2.7 氨基酸序列同源性比对方法 | 第87页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第87-104页 |
| 4.3.1 B.pumilus AB94180菌种鉴定 | 第87-88页 |
| 4.3.2 B.pumilus AB94180中缺陷性原噬菌体PBP180的诱导及形态观察 | 第88-90页 |
| 4.3.3 缺陷性原噬菌体PBP180包裹的DNA检测 | 第90-92页 |
| 4.3.4 缺陷性原噬菌体PBP180杀菌谱 | 第92-93页 |
| 4.3.5 缺陷性原噬菌体PBP180的结构蛋白及质谱分析 | 第93-94页 |
| 4.3.6 缺陷性原噬菌体PBP180编码基因预测及分析 | 第94-100页 |
| 4.3.7 缺陷性原噬菌体PBP180与PBSX及B.pumilis AB94044和SAFR-032缺陷噬菌体编码原件比较分析 | 第100-104页 |
| 4.4 小结及讨论 | 第104-105页 |
| 研究总结与展望 | 第105-108页 |
| 参考文献 | 第108-120页 |
| 博士研究生期间科研成果 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
