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Zhangfei基因在细胞内质网应激反应中的生物功能研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-14页
第一章 内质网应激与疾病第14-25页
 1 内质网应激第14-19页
   ·内质网的结构特征第14页
   ·内质网应激的产生第14-15页
   ·未折叠蛋白反应(UPR)第15-18页
     ·信号转导蛋白PERK 介导的信号通路第15页
     ·ATF6 介导的信号通路第15-18页
     ·IRE1 介导的信号通路第18页
   ·内质网相关性蛋白降解途径(ERAD)第18-19页
 2 内质网应激与细胞凋亡第19-22页
   ·细胞凋亡第19-21页
     ·细胞凋亡的外在途径第19-20页
     ·细胞凋亡的内在途径第20页
     ·细胞凋亡的过程第20-21页
   ·生长抑制DNA 损伤基因(CHOP/(GADD153)第21-22页
     ·CHOP 的结构与功能第21-22页
     ·CHOP 在细胞凋亡中的作用第22页
 3 内质网应激与疾病的关系第22-25页
   ·神经系统变性疾病第23页
   ·糖尿病第23页
   ·病毒感染性疾病第23-24页
   ·肿瘤第24-25页
第二章 ZHANGFEI 基因的研究进展第25-37页
 1 ZHANGFEI 和 LUMAN 基因的发现第25-31页
   ·LUMAN/CRE83第25-28页
     ·CREB/ATF 超蛋白家族第25-26页
     ·Luman 的结构和细胞定位第26页
     ·Luman 的激活第26-27页
     ·Luman 在未折叠蛋白应答反应中的作用第27页
     ·与Luman 相关联的蛋白第27-28页
   ·ZHANGFEI/CREBZF第28-31页
     ·Zhangfei 的结构和DNA 结合的特性第28-29页
     ·Zhangfei 的生物学功能第29-31页
 2 相关研究方法的原理第31-33页
   ·WESTERN BLOTTING 的原理第31-32页
   ·双荧光酶检测系统的原理第32-33页
   ·染色体免疫共沉淀的原理第33页
 3 存在问题第33-37页
第三章 ZHANGFEI 启动子克隆及其相关载体的鉴定第37-50页
 1 材料与方法第37-44页
   ·试验材料第37-39页
     ·血样第37页
     ·载体第37-38页
     ·试验试剂第38页
     ·仪器设备第38-39页
     ·主要试剂的配制第39页
   ·试验方法第39-44页
     ·Zhangfei 基因的结构分析第39页
     ·基因组DNA、细胞总RNA 的提取和cDNA 的合成第39-40页
     ·感受态细胞的制备和转化第40页
     ·Zhangfei 启动子克隆与载体构建第40-42页
     ·Zhangfei 启动子定点突变载体的构建第42-43页
     ·Zhangfei 4 种不同亚型表达载体的鉴定第43-44页
     ·CHOP 启动子克隆的相关载体的鉴定第44页
 2 结果第44-47页
   ·ZHANGFEI 基因序列结构分析第44-45页
   ·犬基因组DNA 的提取第45页
   ·不同长度的ZHANGFEI 启动子构建第45-46页
   ·四种不同ZHANGFEI 亚型表达载体的酶切鉴定结果第46页
   ·不同长度CHOP 启动子的酶切鉴定结果第46-47页
 3 讨论第47-49页
   ·ZHANGFEI 相关载体克隆的设计策略第47页
   ·关于载体克隆的策略第47-48页
   ·关于序列突变第48-49页
 4 小结第49-50页
第四章 氨基酸缺失通过启动子区的AARE 诱导ZHANGFEI 表达第50-62页
 1 材料和方法第50-54页
   ·材料第50-51页
     ·载体第50页
     ·细胞系第50页
     ·试剂第50-51页
     ·仪器设备第51页
     ·氨基酸缺失培养液的制备第51页
   ·方法第51-54页
     ·细胞培养和转染第51-52页
     ·细胞总RNA 的提取和cDNA 的合成第52页
     ·实时定量PCR 检测不同细胞系Zhangfei mRNA 的水平第52-53页
     ·双荧光酶检测第53页
       ·细胞裂解液的制备第53页
       ·双荧光酶检测程序第53页
     ·Zhangfei 启动子基本转录活性的检测第53-54页
     ·Tg 和Tm 对 Zhangfei 启动子转录活性的影响第54页
     ·单一氨基酸缺失对Zhangfei 启动子转录活性的影响第54页
     ·Zhangfei 启动子区AARE 的鉴定方法第54页
 2 结果第54-59页
   ·细胞总RNA 的提取第54-55页
   ·ZHANGFEI 在不同细胞中的表达水平检测第55页
   ·ZHANGFEI 启动子活性检测结果第55-56页
   ·ZHANGFEI 基因启动子5' 侧翼区对TG 和TM 处理的应答效果活性分析第56-57页
   ·单一氨基酸缺失可以增强ZHANGFEI 启动子的转录活性第57-59页
   ·ZHANGFEI 启动子上游区域AARE 的鉴定第59页
 3 讨论第59-61页
   ·氨基酸缺失通过AARE 诱导ZHANGFEI 基因的转录第59-60页
   ·关于MDCK 细胞的培养第60-61页
 4 小结第61-62页
第五章 ZHANGFEI 通过C/EBP-ATF 激活CHOP 表达并诱导细胞凋亡第62-80页
 1 材料与方法第62-68页
   ·试验材料第62-64页
     ·载体第62页
     ·细胞系第62页
     ·抗体第62页
     ·试剂第62-63页
     ·主要试验试剂的配制第63页
     ·试验仪器第63-64页
   ·试验方法第64-68页
     ·Hela 细胞的转染第64页
     ·细胞裂解液的制备和蛋白浓度测定第64-65页
     ·蛋白免疫印迹(Western blotting)第65-66页
     ·Zhangfei 4 种蛋白亚型的检测第66页
     ·内源性Zhangfei 在内质网应激状态下表达水平的检测第66页
     ·内质网应激状态下Zhangfei 下游基因CHOP 的表达检测第66-68页
     ·lZF-IFFFR 和sZF-IFFFR 引起细胞凋亡的检测第68页
 2 结果分析第68-75页
   ·ZHANGFEI 通过选择性剪切和翻译起始产生4 种不同的蛋白亚型第68-69页
   ·内质网应激能够诱导SZF-IFFFR 表达第69-70页
   ·SZF-IFFFR 调节内质网应激介导的细胞凋亡基因CHOP 的表达第70-71页
   ·CHOP 启动子中的C/EBP-ATF 元件能够应答 SZF-IFFFR 的诱导第71-74页
   ·LZF-IFFFR 和 SZF-IFFFR 可能通过诱导CHOP 的表达而引起细胞凋亡第74-75页
 3 讨论第75-79页
   ·关于ZHANGFEI 蛋白亚型第75-76页
   ·LZF-IFFFR 或SZF-IFFFR 可诱导下游基因CHOP 的表达第76-77页
   ·在内质网应激时CHOP 通过C/EBP–ATF 元件诱导细胞凋亡第77-78页
   ·在哺乳动物的UPR 途径中由SZF-IFFFR 介导的CHOP 工作模型第78-79页
 4 小结第79-80页
结论第80-81页
进一步研究的方向第81-82页
参考文献第82-92页
附录一 试剂的配制第92-93页
附录二:PEG PLASMID PURIFICATION第93-95页
附录三:CHROMATIN IMMUNOPRECIPITATION第95-97页
缩略词第97-101页
致谢第101-103页
作者简介第103页

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