| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8页 |
| 缩略语表(Abbreviations) | 第9-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-18页 |
| 1 锌污染现状及其生物修复 | 第10-11页 |
| 2 微生物及其分类学鉴定 | 第11-13页 |
| 2.1 微生物和人类 | 第11-12页 |
| 2.2 微生物的分类鉴定 | 第12-13页 |
| 3 SPHINGOBACTERIACEAE科简介 | 第13页 |
| 4 MUCILAGINIBACTER属简介 | 第13-14页 |
| 5 基因组分析 | 第14-18页 |
| 5.1 基因组学的发展 | 第14-15页 |
| 5.2 基因组测序及分析 | 第15-16页 |
| 5.3 研究目的意义及技术路线 | 第16-18页 |
| 第二章 材料与方法 | 第18-33页 |
| 1 TBZ30~T的多相分类学鉴定 | 第18-29页 |
| 1.1 实验材料 | 第18页 |
| 1.1.1 样品采集 | 第18页 |
| 1.1.2 培养基 | 第18页 |
| 1.2 实验方法 | 第18-29页 |
| 1.2.1 菌株筛选 | 第18页 |
| 1.2.2 形态学特征 | 第18-19页 |
| 1.2.3 生长特性 | 第19-20页 |
| 1.2.4 生理生化特性 | 第20-29页 |
| 2 TBZ30~T的基因组分析 | 第29-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-33页 |
| 2.2.1 总DNA提取 | 第29页 |
| 2.2.2 基因组测序 | 第29-30页 |
| 2.2.3 原始测序数据质量剪切 | 第30-31页 |
| 2.2.4 基因组注释及分析 | 第31-33页 |
| 第三章 结果与分析 | 第33-54页 |
| 1 TBZ30~T的分离以及土壤群落结构 | 第33-36页 |
| 1.1 TBZ30~T的分离纯化以及重金属MIC检测 | 第33页 |
| 1.2 土壤的多样性分析 | 第33-35页 |
| 1.3 TBZ30~T的锌去除能力 | 第35-36页 |
| 2 TBZ30~T的多相分类学鉴定 | 第36-48页 |
| 2.1 基因型特征 | 第36-40页 |
| 2.1.1 16S rRNA基因序列及其同源性比对结果 | 第36-37页 |
| 2.1.2 系统发育树的构建与分析 | 第37-40页 |
| 2.1.3 细菌总DNA G+C mol%的测定 | 第40页 |
| 2.2 化学分类学特征 | 第40-42页 |
| 2.2.1 全细胞脂肪酸分析 | 第40-41页 |
| 2.2.2 呼吸醌类型分析 | 第41-42页 |
| 2.2.3 极性脂类型分析 | 第42页 |
| 2.3 表型特征 | 第42-48页 |
| 2.3.1 形态学特征 | 第42-45页 |
| 2.3.2 生长特性 | 第45页 |
| 2.3.3 生理生化特征 | 第45-48页 |
| 3 TBZ30~T的基因组分析 | 第48-54页 |
| 3.1 TBZ30~T菌株基本信息 | 第48-49页 |
| 3.2 TBZ30~T基因测序基本信息 | 第49页 |
| 3.3 TBZ30~T基因组注释结果分析 | 第49-52页 |
| 3.4 TBZ30~T锌抗性分析 | 第52-54页 |
| 第四章 讨论及展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-61页 |
| 附录 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |