| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 1 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 甘蔗黑穗病概况 | 第11-14页 |
| 1.1.1 甘蔗黑穗病的发生与危害 | 第11页 |
| 1.1.2 甘蔗黑穗病发病规律与病症 | 第11-12页 |
| 1.1.3 甘蔗黑穗病菌的特征及生理小种分化 | 第12页 |
| 1.1.4 甘蔗黑穗病菌快速检测 | 第12-13页 |
| 1.1.5 甘蔗黑穗病菌遗传多样性 | 第13-14页 |
| 1.2 分子标记及其应用 | 第14-16页 |
| 1.2.1 分子标记概况 | 第14-15页 |
| 1.2.2 ISSR分子标记 | 第15页 |
| 1.2.3 SCoT分子标记 | 第15-16页 |
| 1.3 甘蔗黑穗病菌与寄主互作 | 第16-18页 |
| 1.3.1 基于形态学的甘蔗黑穗病菌与寄主互作 | 第16页 |
| 1.3.2 基于生理基础的甘蔗黑穗病菌与寄主互作 | 第16-17页 |
| 1.3.3 基于分子水平的甘蔗黑穗病菌与寄主互作 | 第17-18页 |
| 1.4 研究目的意义和内容 | 第18-19页 |
| 1.4.1 研究目的意义 | 第18-19页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第19页 |
| 1.5 技术路线 | 第19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-26页 |
| 2.1 甘蔗黑穗病菌遗传多样性分析 | 第19-24页 |
| 2.1.1 黑穗病菌的采集 | 第19-21页 |
| 2.1.2 菌株分离、纯化培养 | 第21-22页 |
| 2.1.3 黑穗病菌DNA提取与鉴定 | 第22-23页 |
| 2.1.4 ISSR-PCR反应 | 第23页 |
| 2.1.5 SCoT-PCR反应体系优化 | 第23页 |
| 2.1.6 引物筛选及扩增 | 第23页 |
| 2.1.7 数据统计分析 | 第23-24页 |
| 2.2 甘蔗黑穗病菌与寄主互作生理差异 | 第24-26页 |
| 2.2.1 供试材料 | 第24-25页 |
| 2.2.2 接种 | 第25页 |
| 2.2.3 酶样采集 | 第25页 |
| 2.2.4 寄主防御酶活性测定 | 第25-26页 |
| 2.2.5 数据处理与分析 | 第26页 |
| 3 结果 | 第26-48页 |
| 3.1 交配型菌株的分离培养及鉴定 | 第26页 |
| 3.2 基因组DNA质量检测 | 第26-28页 |
| 3.3 SCoT-PCR反应体系优化 | 第28-31页 |
| 3.3.1 模板DNA浓度对SCoT-PCR反应的影响 | 第28页 |
| 3.3.2 dNTPs浓度对SCoT-PCR反应的影响 | 第28-29页 |
| 3.3.3 引物浓度对SCoT-PCR反应的影响 | 第29页 |
| 3.3.4 rTaq DNA聚合酶用量对SCoT-PCR反应的影响 | 第29-30页 |
| 3.3.5 Mg~(2+)浓度对SCoT-PCR反应的影响 | 第30页 |
| 3.3.6 SCoT-PCR正交试验结果 | 第30-31页 |
| 3.4 引物多态性分析 | 第31-33页 |
| 3.4.1 ISSR引物多态性分析 | 第31页 |
| 3.4.2 SCoT引物多态性分析 | 第31-33页 |
| 3.5 甘蔗黑穗病菌遗传多样性分析 | 第33-36页 |
| 3.5.1 基于ISSR分子标记的遗传多样性分析 | 第33-35页 |
| 3.5.2 基于SCoT分子标记的遗传多样性分析 | 第35-36页 |
| 3.5.3 基于ISSR+SCoT的遗传多样性分析 | 第36页 |
| 3.6 聚类分析 | 第36-41页 |
| 3.6.1 基于ISSR标记的聚类分析 | 第36-39页 |
| 3.6.2 基于SCoT标记的聚类分析 | 第39-40页 |
| 3.6.3 基于ISSR+SCoT的聚类分析 | 第40-41页 |
| 3.7 主成分分析 | 第41-44页 |
| 3.7.1 基于ISSR标记的主成分分析 | 第41页 |
| 3.7.2 基于SCoT标记的主成分分析 | 第41-43页 |
| 3.7.3 基于ISSR+SCoT的主成分分析 | 第43-44页 |
| 3.8 ISSR、SCoT及ISSR+SCoT标记之间相关性分析 | 第44页 |
| 3.9 甘蔗黑穗病菌与甘蔗互作 | 第44-48页 |
| 3.9.1 超氧化物歧化酶（SOD） | 第44页 |
| 3.9.2 过氧化物酶（POD） | 第44-45页 |
| 3.9.3 过氧化氢酶（CAT） | 第45-46页 |
| 3.9.4 苯丙氨酸解氨酶（PAL） | 第46-47页 |
| 3.9.5 多酚氧化酶（PPO） | 第47-48页 |
| 4 讨论与结论 | 第48-57页 |
| 4.1 讨论 | 第48-54页 |
| 4.1.1 SCoT反应体系优化 | 第48页 |
| 4.1.2 ISSR和SCoT引物筛选及多态性 | 第48-49页 |
| 4.1.3 群体遗传多样性及遗传分化 | 第49-52页 |
| 4.1.4 甘蔗黑穗病菌与甘蔗互作 | 第52-54页 |
| 4.2 结论 | 第54-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-67页 |
| 附录 | 第67页 |
