| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略符号对照表 | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 肠道菌群 | 第12-14页 |
| 1.1.1 肠道菌群的组成 | 第12页 |
| 1.1.2 肠道菌群与人体健康、疾病的关系 | 第12-13页 |
| 1.1.3 肠道菌群组成的影响因素 | 第13-14页 |
| 1.2 功能性低聚糖 | 第14-17页 |
| 1.2.1 功能性低聚糖的种类 | 第14-16页 |
| 1.2.2 低聚糖的代谢 | 第16页 |
| 1.2.3 低聚糖对肠道菌群的改变 | 第16-17页 |
| 1.3 益生菌对肠道菌群的影响 | 第17-18页 |
| 1.3.1 益生菌的定义 | 第17页 |
| 1.3.2 益生菌与肠道菌群 | 第17-18页 |
| 1.4 立题意义与研究内容 | 第18-20页 |
| 1.4.1 立题意义 | 第18页 |
| 1.4.2 主要研究内容 | 第18-20页 |
| 第二章 利用低聚糖的肠道细菌的预测、分离与鉴定 | 第20-37页 |
| 2.1 前言 | 第20页 |
| 2.2 实验材料与设备 | 第20-21页 |
| 2.2.1 试剂 | 第20-21页 |
| 2.2.2 菌株 | 第21页 |
| 2.2.3 培养基 | 第21页 |
| 2.2.4 主要仪器和设备 | 第21页 |
| 2.3 实验方法 | 第21-27页 |
| 2.3.1 肠道细菌本地数据库的建立 | 第21-22页 |
| 2.3.2 转运蛋白和糖苷酶基因的检索 | 第22-25页 |
| 2.3.3 BLASTP检索 | 第25页 |
| 2.3.4 利用乳酮糖、低聚果糖的肠道细菌的分离与鉴定 | 第25页 |
| 2.3.5 细菌利用乳酮糖、低聚果糖生长的表征 | 第25-26页 |
| 2.3.6 乳酮糖、低聚果糖含量的测定 | 第26页 |
| 2.3.7 细菌基因组DNA提取 | 第26页 |
| 2.3.8 细菌 16S rDNA鉴定 | 第26-27页 |
| 2.3.9 数据统计与分析 | 第27页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第27-36页 |
| 2.4.1 与低聚半乳糖利用相关的基因 | 第27页 |
| 2.4.2 与低聚果糖利用相关的基因 | 第27-28页 |
| 2.4.3 与低聚异麦芽糖利用相关的基因 | 第28页 |
| 2.4.4 与棉籽糖利用相关的基因 | 第28页 |
| 2.4.5 与低聚阿拉伯糖利用相关的基因 | 第28-29页 |
| 2.4.6 利用乳酮糖的细菌的分离与鉴定 | 第29-30页 |
| 2.4.7 购买菌株对乳酮糖的利用 | 第30-31页 |
| 2.4.8 利用低聚果糖的细菌的分离与鉴定 | 第31-33页 |
| 2.4.9 分离菌株对低聚果糖的利用 | 第33页 |
| 2.4.10 购买菌株对低聚果糖的利用 | 第33-34页 |
| 2.4.11 利用乳酮糖和低聚果糖的细菌 | 第34-36页 |
| 2.5 本章小结 | 第36-37页 |
| 第三章 低聚糖对小鼠粪便菌群组成的影响 | 第37-54页 |
| 3.1 前言 | 第37页 |
| 3.2 实验材料与设备 | 第37-38页 |
| 3.2.1 试剂 | 第37页 |
| 3.2.2 实验动物 | 第37页 |
| 3.2.3 主要仪器和设备 | 第37-38页 |
| 3.3 实验方法 | 第38-42页 |
| 3.3.1 乳酮糖干预的动物实验设计 | 第38页 |
| 3.3.2 低聚果糖干预的动物实验设计 | 第38-39页 |
| 3.3.3 细菌基因组的提取 | 第39-40页 |
| 3.3.4 细菌 16S rDNA的V4 区PCR扩增 | 第40页 |
| 3.3.5 V4 区PCR产物的胶回收与定量 | 第40-41页 |
| 3.3.6 混样、文库构建以及上机测序 | 第41页 |
| 3.3.7 下机数据处理 | 第41页 |
| 3.3.8 Olsenella的分离与鉴定 | 第41-42页 |
| 3.3.9 Olsenella利用低聚果糖生长的表征 | 第42页 |
| 3.3.10 数据统计与分析 | 第42页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第42-53页 |
| 3.4.1 小鼠的粪便菌群组成 | 第42-43页 |
| 3.4.2 乳酮糖对小鼠的粪便菌群组成的影响 | 第43-44页 |
| 3.4.3 FOS对小鼠粪便菌群组成的影响-序列丰富度 | 第44-45页 |
| 3.4.4 低剂量FOS对小鼠粪便菌群组成的影响 | 第45-46页 |
| 3.4.5 高剂量FOS对小鼠粪便菌群组成的影响 | 第46-49页 |
| 3.4.6 急性高剂量FOS对小鼠粪便菌群组成的影响 | 第49-51页 |
| 3.4.7 Olsenella的分离、鉴定及其利用FOS生长的表征 | 第51-53页 |
| 3.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 第四章 低聚糖对小鼠肠腔内容物和粘膜菌群组成的影响 | 第54-68页 |
| 4.1 前言 | 第54页 |
| 4.2 实验材料与设备 | 第54-55页 |
| 4.2.1 试剂 | 第54页 |
| 4.2.2 培养基 | 第54-55页 |
| 4.2.3 实验动物 | 第55页 |
| 4.2.4 主要仪器和设备 | 第55页 |
| 4.3 实验方法 | 第55-58页 |
| 4.3.1 实验设计 | 第55-56页 |
| 4.3.2 盲肠、结肠的总重和壁重 | 第56页 |
| 4.3.3 内容物pH的测定 | 第56页 |
| 4.3.4 内容物中SCFAs含量的测定 | 第56-57页 |
| 4.3.5 内容物中铵含量的测定 | 第57页 |
| 4.3.6 内容物中乳酮糖、葡萄糖含量的测定 | 第57页 |
| 4.3.7 血清代谢参数测定 | 第57页 |
| 4.3.8 内容物和粘膜样品的 16S rDNA宏基因组测序分析 | 第57页 |
| 4.3.9 利用乳酮糖的细菌的分离、鉴定 | 第57-58页 |
| 4.3.10 数据统计与分析 | 第58页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第58-67页 |
| 4.4.1 小鼠体重与进食量 | 第58页 |
| 4.4.2 小鼠血清生化指标 | 第58-59页 |
| 4.4.3 盲肠和结肠总重、壁重 | 第59页 |
| 4.4.4 内容物的SCFAs的含量 | 第59-60页 |
| 4.4.5 内容物的pH | 第60-61页 |
| 4.4.6 内容物中乳酮糖和铵的含量 | 第61-62页 |
| 4.4.7 序列丰富度 | 第62页 |
| 4.4.8 内容物和粘膜的菌群组成 | 第62-63页 |
| 4.4.9 乳酮糖对内容物和粘膜的菌群组成的影响 | 第63-65页 |
| 4.4.10 利用乳酮糖的细菌 | 第65-67页 |
| 4.5 本章小结 | 第67-68页 |
| 第五章 低聚糖对细菌在小鼠肠道内定植的影响 | 第68-80页 |
| 5.1 前言 | 第68页 |
| 5.2 实验材料与设备 | 第68-69页 |
| 5.2.1 试剂 | 第68页 |
| 5.2.2 菌株 | 第68页 |
| 5.2.3 培养基 | 第68-69页 |
| 5.2.4 实验动物 | 第69页 |
| 5.2.5 主要仪器和设备 | 第69页 |
| 5.3 实验方法 | 第69-71页 |
| 5.3.1 动物实验设计 | 第69-70页 |
| 5.3.2 粪便样品的收集及细菌基因组提取 | 第70页 |
| 5.3.3 细菌菌群组成分析 | 第70页 |
| 5.3.4 细菌利用低聚果糖生长的代时测定 | 第70-71页 |
| 5.3.5 E. coli、Klebsiella以及L. plantarum ST-III的特异性PCR扩增 | 第71页 |
| 5.3.6 数据统计与分析 | 第71页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第71-79页 |
| 5.4.1 SPF级小鼠的粪便菌群组成 | 第71-72页 |
| 5.4.2 细菌利用低聚果糖、葡萄糖生长的代时 | 第72页 |
| 5.4.3 Escherichia coli的PCR检测 | 第72-73页 |
| 5.4.4 Klebsiella sp.的PCR检测 | 第73页 |
| 5.4.5 ST-III以及 ΔSac A的PCR检测 | 第73-74页 |
| 5.4.6 单菌灌胃时菌株在小鼠肠道内的定植 | 第74-76页 |
| 5.4.7 混合菌株灌胃时菌株在小鼠肠道内的定植 | 第76-79页 |
| 5.5 本章小结 | 第79-80页 |
| 主要结论与展望 | 第80-82页 |
| 主要结论 | 第80-81页 |
| 展望 | 第81-82页 |
| 论文创新点 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-98页 |
| 附录I：作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第98-99页 |
| 附录II | 第99-110页 |
