| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 1 前言 | 第14-29页 |
| 1.1 慢性疼痛介绍 | 第14-22页 |
| 1.1.1 慢性疼痛的感知和识别 | 第14-15页 |
| 1.1.2 慢性疼痛形成机制 | 第15-17页 |
| 1.1.3 背跟神经节在疼痛调制中的作用 | 第17-18页 |
| 1.1.4 DRG中与疼痛有关的递质及其受体 | 第18-20页 |
| 1.1.5 DRG中与疼痛有关的离子通道 | 第20-21页 |
| 1.1.6 慢性疼痛研究的动物模型 | 第21-22页 |
| 1.2 转录组及其研究方法 | 第22-24页 |
| 1.2.1 转录组 | 第22-23页 |
| 1.2.2 转录组研究方法 | 第23-24页 |
| 1.3 RNA-Seq技术 | 第24-28页 |
| 1.3.1 RNA-Seq技术测序平台 | 第25页 |
| 1.3.2 RNA-Seq技术流程 | 第25-28页 |
| 1.4 山羊/绵羊转录组研究进展 | 第28页 |
| 1.5 本研究目的意义 | 第28-29页 |
| 2 DRG组织转录组建库和高通量测序 | 第29-35页 |
| 2.1 引言 | 第29页 |
| 2.2 试验材料 | 第29-30页 |
| 2.2.1 试验动物 | 第29-30页 |
| 2.2.2 主要试剂及药品 | 第30页 |
| 2.2.3 试验设备和仪器 | 第30页 |
| 2.3 试验方法 | 第30-32页 |
| 2.3.1 疼痛模型的建立 | 第30-31页 |
| 2.3.2 实验分组 | 第31页 |
| 2.3.3 背跟神经节(DRG)的分离 | 第31页 |
| 2.3.4 各样本总RNA的提取 | 第31页 |
| 2.3.5 各样本总RNA的纯化与检测 | 第31-32页 |
| 2.3.6 DRG转录组文库的构建 | 第32页 |
| 2.3.7 cDNA文库测序 | 第32页 |
| 2.4 结果与分析 | 第32-35页 |
| 2.4.1 12个DRG组织总RNA质量分析结果 | 第32-33页 |
| 2.4.2 12个DRG组织cDNA建库质量分析结果 | 第33-35页 |
| 2.5 讨论 | 第35页 |
| 3 转录组测序数据基础分析 | 第35-54页 |
| 3.1 引言 | 第35-36页 |
| 3.2 分析方法 | 第36-39页 |
| 3.2.1 原始数据预处理 | 第36页 |
| 3.2.2 clean reads质量评估 | 第36-37页 |
| 3.2.3 全基因组比对分析 | 第37-38页 |
| 3.2.4 基因表达水平分析 | 第38-39页 |
| 3.3 结果与分析 | 第39-52页 |
| 3.3.1 测序数据产出质量统计 | 第39-40页 |
| 3.3.2 clean reads质量分析结果 | 第40-45页 |
| 3.3.3 测序随机性评估 | 第45-47页 |
| 3.3.4 Reads与参考基因组比对结果 | 第47-48页 |
| 3.3.5 Reads在基因组上不同区域的分布情况 | 第48-50页 |
| 3.3.6 基因表达水平分析结果 | 第50-52页 |
| 3.4 讨论 | 第52-53页 |
| 3.5 小结 | 第53-54页 |
| 4. 转录组差异表达分析 | 第54-71页 |
| 4.1 引言 | 第54-55页 |
| 4.2 分析方法 | 第55-56页 |
| 4.2.1 样本间相关性分析 | 第55页 |
| 4.2.2 样本间差异表达基因(DEG)筛选 | 第55页 |
| 4.2.3 样本间差异基因层次聚类分析 | 第55-56页 |
| 4.2.4 标准DEG功能聚类(GO)分析 | 第56页 |
| 4.3 结果与分析 | 第56-67页 |
| 4.3.1 样本相关性分析 | 第56-58页 |
| 4.3.2 样本间差异表达基因(DEG)分析 | 第58-62页 |
| 4.3.3 标准DEG go分析 | 第62-67页 |
| 4.4 讨论 | 第67-70页 |
| 4.4.1 从疼痛发生时DRG内基因表达变化探讨 | 第67-68页 |
| 4.4.2 从山羊/绵羊疼痛应答遗传机制探讨 | 第68-70页 |
| 4.4.3 从相关基因本底表达水平探讨 | 第70页 |
| 4.5 小结 | 第70-71页 |
| 5 可变剪接图谱 | 第71-81页 |
| 5.1 引言 | 第71-72页 |
| 5.2 分析方法 | 第72-73页 |
| 5.2.1 各样本剪接位点SJ(Splice Junction)检出情况 | 第72页 |
| 5.2.2 可变剪接事件的检出情况 | 第72页 |
| 5.2.3 可变剪接差异表达(DAS)分析 | 第72-73页 |
| 5.2.4 可变剪接功能聚类(DASG)分析 | 第73页 |
| 5.3 结果与分析 | 第73-79页 |
| 5.3.1 转录组数据的覆盖度评估 | 第73-74页 |
| 5.3.2 剪接位点SJ检出情况 | 第74-75页 |
| 5.3.3 可变剪接事件的检出情况 | 第75-76页 |
| 5.3.4 可变剪接事件的归类分析 | 第76-77页 |
| 5.3.5 可变剪接差异表达基因筛选结果 | 第77-78页 |
| 5.3.6 可变剪接差异表达基因功能分析 | 第78-79页 |
| 5.4 讨论 | 第79-81页 |
| 5.5 小结 | 第81页 |
| 6 全文结论 | 第81-82页 |
| 7 研究创新点与展望 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-95页 |
| 附录 | 第95-110页 |
| 作者简介 | 第110页 |
