| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| 1 国内外研究进展 | 第11-19页 |
| 1.1 水牛瘤胃微生物多样性的研究 | 第11-12页 |
| 1.2 瘤胃内主要功能细菌的研究 | 第12-13页 |
| 1.3 日粮对瘤胃微生物群落影响的研究进展 | 第13-16页 |
| 1.3.1 日粮结构不同对瘤胃微生物群落的影响 | 第14页 |
| 1.3.2 日粮粗饲料类型对瘤胃微生物群落的影响 | 第14-15页 |
| 1.3.3 日粮转变对瘤胃微生物群落的影响 | 第15-16页 |
| 1.4 分子生物学方法应用于瘤胃微生物群落多样性的研究 | 第16-19页 |
| 1.4.1 瘤胃微生物的多样性的DGGE研究技术研究 | 第17-18页 |
| 1.4.2 瘤胃微生物多样性的实时荧光定量PCR研究技术 | 第18-19页 |
| 2 研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 第二章 不同NDF水平日粮条件下水牛瘤胃细菌多样性研究 | 第20-34页 |
| 1 材料与方法 | 第20-25页 |
| 1.1 试验动物 | 第20页 |
| 1.2 试验设计与试验日粮 | 第20-21页 |
| 1.3 瘤胃液采集与总DNA提取 | 第21-22页 |
| 1.3.1 瘤胃液采集 | 第21页 |
| 1.3.2 液相、固相瘤胃微生物总DNA提取 | 第21-22页 |
| 1.4 PCR扩增 16S rDNA V3 区域 | 第22页 |
| 1.5 变性梯度凝胶电泳（DGGE） | 第22-25页 |
| 1.5.1 主要溶液试剂配制 | 第22-23页 |
| 1.5.2 操作步骤 | 第23-25页 |
| 1.6 差异条带的克隆和测序 | 第25页 |
| 1.7 数据分析 | 第25页 |
| 2 结果与分析 | 第25-31页 |
| 2.1 瘤胃固相粘附微生物DNA的提取及PCR扩增 | 第25-26页 |
| 2.2 DGGE指纹图谱分析 | 第26-27页 |
| 2.3 聚类分析 | 第27-28页 |
| 2.4 多样性分析 | 第28-30页 |
| 2.5 条带测序 | 第30-31页 |
| 3 讨论 | 第31-32页 |
| 4 本章小结 | 第32-34页 |
| 第三章 不同NDF水平日粮对杂交水牛瘤胃内主要功能细菌数量的影响 | 第34-41页 |
| 1 试验材料与方法 | 第34-36页 |
| 1.1 试验动物、设计与日粮 | 第34页 |
| 1.2 瘤胃液采集与总DNA提取 | 第34-35页 |
| 1.3 引物设计 | 第35页 |
| 1.4 标准品制备 | 第35-36页 |
| 1.5 qPCR检测瘤胃功能细菌数量 | 第36页 |
| 1.6 统计分析 | 第36页 |
| 2 结果与分析 | 第36-40页 |
| 2.1 瘤胃微生物总DNA提取结果 | 第36-37页 |
| 2.2 qPCR标准曲线 | 第37页 |
| 2.3 qPCR检测瘤胃功能细菌数量 | 第37-40页 |
| 2.3.1 不同NDF水平日粮对瘤胃蛋白质分解菌数量的影响 | 第38页 |
| 2.3.2 不同NDF水平日粮对瘤胃纤维分解菌数量的影响 | 第38-39页 |
| 2.3.3 不同NDF水平日粮对瘤胃脂解细菌数量的影响 | 第39-40页 |
| 3 讨论 | 第40-41页 |
| 4 本章小结 | 第41页 |
| 第四章 全文结论、创新点与后期展望 | 第41-43页 |
| 4.1 全文结论 | 第41-42页 |
| 4.2 创新点 | 第42页 |
| 4.3 有待进一步的研究与问题 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 附录 | 第51-53页 |
| 附录一 瘤胃中已测序的菌株 | 第51-52页 |
| 附录二 PCR纯化产物与载体的连接转化 | 第52页 |
| 附录三 质粒提取方法 | 第52-53页 |
