| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第1章 绪论 | 第18-35页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 1.2 钙蛋白酶家族 | 第19-27页 |
| 1.2.1 钙蛋白酶概述 | 第19页 |
| 1.2.2 CAPN1和CAPN2蛋白的结构与功能 | 第19-23页 |
| 1.2.3 CAPN3蛋白的结构与功能 | 第23-24页 |
| 1.2.4 CAST蛋白的结构和功能 | 第24-26页 |
| 1.2.5 鱼类钙蛋白酶系统研究现状 | 第26-27页 |
| 1.3 鱼类肉质质构研究进展 | 第27-33页 |
| 1.3.1 鱼类肉质质构研究现状 | 第27-28页 |
| 1.3.2 影响鱼类肉质质构的因素 | 第28-33页 |
| 1.4 本论文的主要研究内容 | 第33-35页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第35-48页 |
| 2.1 实验材料 | 第35-37页 |
| 2.1.1 实验样品采集 | 第35页 |
| 2.1.2 试剂 | 第35-37页 |
| 2.1.3 仪器 | 第37页 |
| 2.2 测试方法 | 第37-42页 |
| 2.2.1 总RNA的浓度与质量检测 | 第37-38页 |
| 2.2.2 PCR扩增 | 第38-39页 |
| 2.2.3 扩增产物的回收与测序 | 第39页 |
| 2.2.4 荧光定量PCR方法 | 第39-40页 |
| 2.2.5 蛋白浓度的测定 | 第40-41页 |
| 2.2.6 蛋白质聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第41页 |
| 2.2.7 鲤肌肉营养成分的测定 | 第41页 |
| 2.2.8 鲤肌肉质构（TPA）测量 | 第41-42页 |
| 2.3 实验方法 | 第42-46页 |
| 2.3.1 鲤全鱼总RNA的提取 | 第42页 |
| 2.3.2 引物的设计 | 第42-44页 |
| 2.3.3 5’RACE法扩增capn基因家族 5’末端 | 第44-45页 |
| 2.3.4 3’RACE法扩增capn基因家族 3’末端 | 第45页 |
| 2.3.5 钙蛋白酶的提取 | 第45-46页 |
| 2.3.6 生物信息学分析方法 | 第46页 |
| 2.4 数据处理 | 第46-48页 |
| 第3章 鲤capn基因家族克隆及序列分析 | 第48-67页 |
| 3.1 引言 | 第48页 |
| 3.2 鲤capn基因家族序列分析 | 第48-51页 |
| 3.2.1 capn1基因序列分析 | 第49页 |
| 3.2.2 capn2基因序列分析 | 第49-50页 |
| 3.2.3 capn3基因序列分析 | 第50-51页 |
| 3.2.4 cast基因序列分析 | 第51页 |
| 3.3 鲤capn基因家族外显子分析 | 第51-57页 |
| 3.3.1 capn1基因外显子分析 | 第51-53页 |
| 3.3.2 capn2基因外显子分析 | 第53-55页 |
| 3.3.3 capn3基因外显子分析 | 第55-56页 |
| 3.3.4 cast基因外显子分析 | 第56-57页 |
| 3.4 鲤capn基因家族系统发育及同源性分析 | 第57-65页 |
| 3.4.1 capn1基因的同源性及系统发育分析 | 第58-60页 |
| 3.4.2 capn2基因的同源性及系统发育分析 | 第60-62页 |
| 3.4.3 capn3基因的同源性及系统发育分析 | 第62-63页 |
| 3.4.4 cast基因的同源性及系统发育分析 | 第63-65页 |
| 3.5 本章小结 | 第65-67页 |
| 第4章 鲤capn基因家族编码蛋白质的特性 | 第67-83页 |
| 4.1 引言 | 第67页 |
| 4.2 CAPN蛋白家族的疏水性和跨膜螺旋预测 | 第67-71页 |
| 4.2.1 CAPN蛋白家族的疏水性 | 第68-69页 |
| 4.2.2 CAPN蛋白家族的跨膜螺旋预测 | 第69-71页 |
| 4.3 CAPN蛋白家族的信号肽及亚细胞定位 | 第71-73页 |
| 4.3.1 CAPN蛋白家族的信号肽分析 | 第71-73页 |
| 4.3.2 CAPN蛋白家族的亚细胞定位 | 第73页 |
| 4.4 CAPN蛋白家族磷酸化位点的预测 | 第73-78页 |
| 4.4.1 CAPN1蛋白磷酸化位点的预测 | 第74-75页 |
| 4.4.2 CAPN2蛋白质磷酸化位点的预测 | 第75-76页 |
| 4.4.3 CAPN3蛋白质磷酸化位点的预测 | 第76-77页 |
| 4.4.4 CAST蛋白质磷酸化位点的预测 | 第77-78页 |
| 4.5 CAPN蛋白家族糖基化位点预测 | 第78-82页 |
| 4.5.1 CAPN1蛋白糖基化位点预测 | 第78-79页 |
| 4.5.2 CAPN2蛋白质糖基化位点预测 | 第79-80页 |
| 4.5.3 CAPN3蛋白质糖基化位点预测 | 第80-81页 |
| 4.5.4 CAST蛋白质糖基化位点预测 | 第81-82页 |
| 4.6 本章小结 | 第82-83页 |
| 第5章 鲤CAPN蛋白家族结构与功能域分析 | 第83-105页 |
| 5.1 引言 | 第83页 |
| 5.2 CAPN蛋白家族氨基酸组成分析 | 第83-85页 |
| 5.3 CAPN蛋白家族一级结构 | 第85-87页 |
| 5.4 CAPN蛋白家族二级结构预测 | 第87-91页 |
| 5.4.1 CAPN1蛋白二级结构预测 | 第87-88页 |
| 5.4.2 CAPN2蛋白质二级结构预测 | 第88-89页 |
| 5.4.3 CAPN3蛋白质二级结构预测 | 第89-90页 |
| 5.4.4 CAST蛋白质二级结构预测 | 第90-91页 |
| 5.5 CAPN蛋白家族三级结构预测 | 第91-95页 |
| 5.5.1 CAPN1蛋白质三级结构预测 | 第91-92页 |
| 5.5.2 CAPN2蛋白质三级结构预测 | 第92-93页 |
| 5.5.3 CAPN3蛋白质三级结构预测 | 第93-94页 |
| 5.5.4 CAST蛋白质三级结构预测 | 第94-95页 |
| 5.6 CAPN蛋白家族的结构域及功能基序分析 | 第95-104页 |
| 5.6.1 CAPN1蛋白质的结构域及功能基序分析 | 第95-97页 |
| 5.6.2 CAPN2蛋白质的结构域及功能基序分析 | 第97-99页 |
| 5.6.3 CAPN3蛋白质的结构域及功能基序分析 | 第99-102页 |
| 5.6.4 CAST蛋白质的结构域及功能基序分析 | 第102-104页 |
| 5.7 本章小结 | 第104-105页 |
| 第6章 鲤capn基因家族表达及与肌肉质构相关分析 | 第105-132页 |
| 6.1 引言 | 第105页 |
| 6.2 鲤capn基因家族不同组织表达分析 | 第105-110页 |
| 6.2.1 鲤组织RNA提取方法的优化 | 第106页 |
| 6.2.2 鲤capn1基因不同组织表达分析 | 第106-108页 |
| 6.2.3 鲤capn2基因不同组织表达分析 | 第108-109页 |
| 6.2.4 鲤cast基因不同组织表达分析 | 第109-110页 |
| 6.3 capn基因家族在胚胎和肌肉内的表达相关分析 | 第110-113页 |
| 6.3.1 capn基因家族在不同胚胎发育时期表达分析 | 第110-112页 |
| 6.3.2 capn基因家族在两种鲤肌肉内表达及相关分析 | 第112-113页 |
| 6.4 鲤肌肉CAPN蛋白酶家族的分离及相关分析 | 第113-115页 |
| 6.4.1 鲤肌肉C A PN蛋 白酶家族的分离与检测 | 第113-114页 |
| 6.4.2 鲤肌肉C A PN蛋 白酶家族的电泳分析 | 第114-115页 |
| 6.5 两种鲤营养成分和不同温度下肌肉质构分析 | 第115-123页 |
| 6.5.1 两种鲤常规营养成分分析 | 第116页 |
| 6.5.2 不同 4℃冷藏时间对鲤肌肉质构的影响 | 第116-117页 |
| 6.5.3 不同保存温度对鲤肌肉硬度的影响 | 第117-118页 |
| 6.5.4 不同保存温度对鲤肌肉黏附性的影响 | 第118-119页 |
| 6.5.5 不同保存温度对鲤肌肉弹性的影响 | 第119-120页 |
| 6.5.6 不同保存温度对鲤肌肉黏聚性的影响 | 第120-121页 |
| 6.5.7 不同保存温度对鲤肌肉胶黏性的影响 | 第121页 |
| 6.5.8 不同保存温度对鲤肌肉咀嚼度的影响 | 第121-122页 |
| 6.5.9 不同保存温度对鲤肌肉恢复性的影响 | 第122-123页 |
| 6.6 鲤生长性状和营养成分与肌肉质构的相关分析 | 第123-126页 |
| 6.6.1 鲤生长性状及营养成分与肌肉质构的相关分析 | 第124页 |
| 6.6.2 鲤肌肉质构和肌肉营养成分的主成分分析 | 第124-126页 |
| 6.7 鲤capn基因家族与生长和肉质性状相关分析 | 第126-130页 |
| 6.7.1 鲤capn基因家族与生长和肌肉营养成分相关分析 | 第126-127页 |
| 6.7.2 鲤capn基因家族与肌肉质构的相关分析 | 第127-129页 |
| 6.7.3 鲤肌肉capn基因家族和质构指标的主成分分析 | 第129-130页 |
| 6.8 本章小结 | 第130-132页 |
| 结论 | 第132-133页 |
| 创新点 | 第133-134页 |
| 展望 | 第134-135页 |
| 参考文献 | 第135-148页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文及其它成果 | 第148-150页 |
| 致谢 | 第150-151页 |
| 个人简历 | 第151-152页 |
| 附录 | 第152-156页 |
