摘要 | 第5-7页 |
abstract | 第7-8页 |
第一章 绪论 | 第15-31页 |
1.1 内质网应激 | 第16-20页 |
1.1.1 UPR的研究 | 第17-18页 |
1.1.2 IRE1的研究 | 第18页 |
1.1.3 SCJ1的研究 | 第18-20页 |
1.1.4 突变体酵母(scj1-1Δire1)的研究 | 第20页 |
1.2 SSZ1功能 | 第20-23页 |
1.2.1 PDR信号通路 | 第20-22页 |
1.2.2 RAC复合物 | 第22-23页 |
1.3 细胞壁完整性通路研究 | 第23-27页 |
1.3.1 酵母细胞壁 | 第23-24页 |
1.3.2 酵母细胞壁的分子结构 | 第24-25页 |
1.3.3 CWI信号通路与激活 | 第25页 |
1.3.4 CWI与应激 | 第25-27页 |
1.4 RSC30研究进展 | 第27-29页 |
1.5 研究目的与意义 | 第29页 |
1.6 研究内容和技术路线 | 第29-31页 |
1.6.1 研究内容 | 第29-30页 |
1.6.2 技术路线 | 第30-31页 |
第二章 SSZ1结构域缺失突变体的载体构建 | 第31-43页 |
2.1 实验材料 | 第31-33页 |
2.1.1 菌株 | 第31页 |
2.1.2 质粒 | 第31页 |
2.1.3 试剂 | 第31-32页 |
2.1.4 仪器设备 | 第32-33页 |
2.2 实验方法 | 第33-38页 |
2.2.1 感受态制备 | 第33-34页 |
2.2.2 引物设计 | 第34-35页 |
2.2.3 基因扩增 | 第35-36页 |
2.2.4 纯化片段 | 第36页 |
2.2.5 片段连接 | 第36页 |
2.2.6 质粒转化 | 第36-37页 |
2.2.7 菌落PCR | 第37页 |
2.2.8 质粒提取 | 第37页 |
2.2.9 质粒酶切 | 第37-38页 |
2.2.10 测序 | 第38页 |
2.3 实验结果 | 第38-41页 |
2.3.1 SSZ1缺失突变体蛋白产物的预测 | 第38-40页 |
2.3.2 琼脂糖凝胶电泳鉴定目的片段 | 第40页 |
2.3.3 质粒双酶切和PCR鉴定目的片段 | 第40-41页 |
2.3.4 测序验证 | 第41页 |
2.4 本章小结 | 第41-43页 |
第三章 SSZ1结构域缺失突变体的细胞功能研究 | 第43-56页 |
3.1 SSZ1突变体抗药性研究 | 第43-48页 |
3.1.1 实验材料 | 第43-46页 |
3.1.1.1 菌株 | 第43页 |
3.1.1.2 质粒 | 第43-44页 |
3.1.1.3 试剂 | 第44-45页 |
3.1.1.4 培养基 | 第45-46页 |
3.1.2 实验方法 | 第46-47页 |
3.1.2.1 质粒提取 | 第46页 |
3.1.2.2 酵母转化和筛选 | 第46页 |
3.1.2.3 梯度连续稀释培养 | 第46-47页 |
3.1.3 实验结果 | 第47页 |
3.1.4 小节讨论 | 第47-48页 |
3.2 SSZ1缺失突变体对温度敏感型酵母的影响 | 第48-51页 |
3.2.1 实验材料 | 第48页 |
3.2.1.1 菌株 | 第48页 |
3.2.1.2 质粒 | 第48页 |
3.2.1.3 培养基 | 第48页 |
3.2.2 实验方法 | 第48-49页 |
3.2.2.1 质粒提取 | 第48-49页 |
3.2.2.2 酵母转化和筛选 | 第49页 |
3.2.2.3 梯度连续稀释培养 | 第49页 |
3.2.3 实验结果 | 第49-50页 |
3.2.3.1 温度敏感型酵母(scj1-1Δire1)的表型 | 第49页 |
3.2.3.2 SSZ1结构域缺失突变体对温度敏感型酵母(scj1-1Δire1)生长表型的影响 | 第49-50页 |
3.2.4 小节讨论 | 第50-51页 |
3.3 颜色分离实验 | 第51-54页 |
3.3.1 实验材料 | 第51-52页 |
3.3.1.1 菌株 | 第51页 |
3.3.1.2 质粒 | 第51页 |
3.3.1.3 培养基 | 第51-52页 |
3.3.2 实验方法 | 第52页 |
3.3.2.1 质粒提取 | 第52页 |
3.3.2.2 酵母转化和筛选 | 第52页 |
3.3.2.3 梯度连续稀释培养 | 第52页 |
3.3.3 实验结果 | 第52-53页 |
3.3.3.1 SSZ1结构域缺失突变体的颜色分离实验结果 | 第52-53页 |
3.3.4 小节讨论 | 第53-54页 |
3.4 本章小结 | 第54-56页 |
第四章 SSZ1新功能机制的研究 | 第56-77页 |
4.1 SSZ1新功能 | 第56-59页 |
4.1.1 实验材料 | 第56-57页 |
4.1.1.1 菌株 | 第56页 |
4.1.1.2 质粒 | 第56-57页 |
4.1.1.3 培养基 | 第57页 |
4.1.2 实验方法 | 第57页 |
4.1.2.1 质粒提取 | 第57页 |
4.1.2.2 酵母转化和筛选 | 第57页 |
4.1.2.3 梯度连续稀释培养 | 第57页 |
4.1.3 实验结果 | 第57-58页 |
4.1.3.1 SSZ1抑制温度敏感型酵母(scj1-1Δire1)表型 | 第57-58页 |
4.1.4 小节讨论 | 第58-59页 |
4.2 转录组学分析 | 第59-69页 |
4.2.1 实验材料 | 第59-60页 |
4.2.2 实验方法 | 第60-61页 |
4.2.2.1 RNA抽提 | 第60页 |
4.2.2.2 转录组数据采集 | 第60-61页 |
4.2.2.3 转录组数据分析 | 第61页 |
4.2.3 实验结果 | 第61-68页 |
4.2.3.1 差异表达基因的聚类分析 | 第61-62页 |
4.2.3.2 差异表达基因的Venn图分析 | 第62-63页 |
4.2.3.3 差异表达基因的GO富集分析 | 第63-64页 |
4.2.3.4 差异表达基因的PPI网络 | 第64-65页 |
4.2.3.5 PDR通路中基因差异表达的比较 | 第65-66页 |
4.2.3.6 UPR通路中基因差异表达的比较 | 第66页 |
4.2.3.7 CWI通路中基因差异表达的比较 | 第66-68页 |
4.2.4 小节讨论 | 第68-69页 |
4.3 差异表达基因的验证 | 第69-75页 |
4.3.1 实验材料 | 第69-70页 |
4.3.1.1 菌株 | 第69页 |
4.3.1.2 质粒 | 第69-70页 |
4.3.1.3 试剂 | 第70页 |
4.3.1.4 培养基 | 第70页 |
4.3.2 实验方法 | 第70-72页 |
4.3.2.1 酵母基因组提取 | 第70-71页 |
4.3.2.2 差异表达基因的克隆 | 第71页 |
4.3.2.3 酵母转化与筛选 | 第71页 |
4.3.2.4 梯度连续稀释培养 | 第71-72页 |
4.3.3 实验结果 | 第72-74页 |
4.3.3.1 细胞壁完整性的验证 | 第72页 |
4.3.3.2 PDR通路相关基因的功能验证 | 第72-73页 |
4.3.3.3 CWI通路相关基因的功能验证 | 第73-74页 |
4.3.3.4 RSC30维持细胞稳健性的功能验证 | 第74页 |
4.3.4 小节讨论 | 第74-75页 |
4.4 本章小结 | 第75-77页 |
第五章 全文总结与展望 | 第77-79页 |
5.1 全文总结 | 第77页 |
5.2 展望 | 第77-79页 |
参考文献 | 第79-90页 |
硕士期间发表论文 | 第90-91页 |
致谢 | 第91页 |