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髓系肿瘤中miR-378基因5侧翼区甲基化态势的临床研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
英文缩略语第13-16页
第一章 引言第16-26页
    1.1 微小RNA第16-17页
    1.2 微小RNA与肿瘤第17-19页
    1.3 微小RNA与表观遗传学调控第19-20页
    1.4 DNA甲基化与髓系肿瘤第20-26页
        1.4.1 AML第22-23页
        1.4.2 CML第23-24页
        1.4.3 MDS第24-26页
第二章 本论文研究的目的、方法及实验方案的设计、意义第26-30页
    2.1 研究背景及目的第26页
    2.2 研究方法及技术第26-28页
        2.2.1 实时荧光定量PCR(RQ-PCR)第26-27页
        2.2.2 实时定量甲基化特异性PCR(RQ-MSP)第27-28页
        2.2.3 亚硫酸氢盐测序(Bisulfite sequencing PCR, BSP)第28页
    2.3 实验方案的设计第28-29页
    2.4 本研究的意义第29-30页
第三章 AML患者中miR-378基因 5’侧翼区甲基化研究第30-54页
    3.1 材料第30-32页
        3.1.1 研究对象第30页
        3.1.2 主要仪器第30-31页
        3.1.3 主要试剂第31-32页
        3.1.4 引物第32页
    3.2 方法第32-41页
        3.2.1 细胞培养和药物处理第32页
        3.2.2 骨髓单个核细胞的分离、全部mRNA及基因组DNA的提取第32-33页
        3.2.3 DNA硫化修饰(Epitect? Bisulfite Kit修饰DNA)第33-34页
        3.2.4 逆转录第34页
        3.2.5 MiR-378基因表达的RQ-PCR检测第34-35页
        3.2.6 MiR-378基因 5’侧翼区的RQ-MSP检测第35-37页
        3.2.7 MiR-378基因 5’侧翼区BSP分析第37页
        3.2.8 纯化回收PCR产物第37-38页
        3.2.9 构建重组载体第38页
        3.2.10 重组质粒转化第38-39页
        3.2.11 重组质粒提取及测序、鉴定第39-40页
        3.2.12 建立阳性模板第40页
        3.2.13 细胞遗传学检测第40-41页
        3.2.14 基因突变检测第41页
        3.2.15 统计学处理第41页
    3.3 结果第41-51页
        3.3.1 RQ-MSP灵敏度、重复性、特异性第41-43页
        3.3.2 MiR-378基因 5’侧翼区CpG岛第43-44页
        3.3.3 对照组miR-378基因 5’侧翼区甲基化水平第44-45页
        3.3.4 AML患者miR-378基因 5’侧翼区甲基化水平与临床相关性第45-47页
        3.3.5 MiR-378基因甲基化态势与AML患者染色体核型分析第47-48页
        3.3.6 AML患者miR-378基因 5’侧翼区甲基化密度分析第48-49页
        3.3.7 MiR-378基因 5’侧翼区甲基化与表达相关性分析第49-51页
        3.3.8 MiR-378基因 5’侧翼区甲基化态势与AML患者预后分析第51页
    3.4 讨论第51-54页
第四章 CML患者中miR-378基因 5’侧翼区甲基化研究第54-60页
    4.1 材料第54页
        4.1.1 研究对象第54页
        4.1.2 主要仪器第54页
        4.1.3 主要试剂第54页
        4.1.4 引物第54页
    4.2 方法第54-55页
        4.2.1 骨髓单个核细胞分离及基因组DNA制备第54-55页
        4.2.2 DNA硫化修饰第55页
        4.2.3 MiR-378基因 5’侧翼区RQ-MSP检测第55页
        4.2.4 纯化回收PCR产物第55页
        4.2.5 构建重组载体第55页
        4.2.6 重组质粒转化第55页
        4.2.7 重组质拉提取及测序、鉴定第55页
        4.2.8 建立阳性模板第55页
        4.2.9 细胞遗传学检查第55页
        4.2.10统计学处理第55页
    4.3 结果第55-58页
        4.3.1 CML患者和对照组miR-378基因 5’侧翼区甲基化水平第55-57页
        4.3.2 MiR-378基因 5’侧翼区甲基化水平与临床相关性第57页
        4.3.3 不同分期CML患者miR-378基因 5’侧翼区甲基化水平第57-58页
    4.4 讨论第58-60页
第五章 MDS患者中MiR-378基因 5’侧翼区甲基化研究第60-70页
    5.1 材料第60-61页
        5.1.1 研究对象第60页
        5.1.2 主要仪器第60页
        5.1.3 主要试剂第60-61页
        5.1.4 引物第61页
    5.2 方法第61-62页
        5.2.0 BMMNCs 分离及基因组 DNA 制备第61页
        5.2.1 DNA 硫化修饰第61页
        5.2.2 mi R-378 基因 5’侧翼区 RQ-MSP 检测第61页
        5.2.3 miR-378基因5’侧翼区 BSP 分析第61页
        5.2.4 PCR 扩增产物纯化回收第61页
        5.2.5 重组载体构建第61页
        5.2.6 重组质粒转化第61页
        5.2.7 重组质拉提取及测序、鉴定第61页
        5.2.8 建立阳性模板第61页
        5.2.9 细胞遗传学检查第61页
        5.2.10 基因突变检测第61-62页
        5.2.11 统计学处理第62页
    5.3 结果第62-68页
        5.3.1 MDS患者和对照组miR-378基因 5’侧翼区甲基化水平第62-63页
        5.3.2 MiR-378基因 5’侧翼区甲基化水平与临床相关性第63-65页
        5.3.3 MDS患者miR-378基因 5’侧翼区甲基化密度分析第65页
        5.3.4 MiR-378基因 5’侧翼区甲基化态势与MDS患者预后分析第65-68页
    5.4 讨论第68-70页
第六章 结论和展望第70-71页
    6.1 主要结论第70页
    6.2 展望第70-71页
参考文献第71-82页
致谢第82-84页
攻读硕士学位期间发表的学术论文及其他科研成果第84页

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