| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-15页 |
| 引言 | 第15-19页 |
| 1 研究背景 | 第15页 |
| 2 本研究工作的总体思路、主要研究方法和预期成果 | 第15-17页 |
| 参考文献 | 第17-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-44页 |
| ·中药DNA条形码研究进展 | 第19-21页 |
| ·转录组及其在药用植物中应用 | 第21-26页 |
| ·植物器官大小调控基因研究进展 | 第26-34页 |
| 附表 | 第32-34页 |
| 参考文献 | 第34-44页 |
| 第二章 基于DNA条形码的青天葵真伪鉴别 | 第44-70页 |
| ·青天葵与常见混伪品的鉴别 | 第44-60页 |
| ·材料与试剂 | 第44-45页 |
| ·植物材料 | 第44页 |
| ·试剂 | 第44-45页 |
| ·仪器 | 第45页 |
| ·方法 | 第45-46页 |
| ·DNA提取 | 第45-46页 |
| ·PCR扩增与测序 | 第46页 |
| ·序列分析 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-59页 |
| ·PCR与测序成功率 | 第46-47页 |
| ·序列变异分析 | 第47-52页 |
| ·遗传距离分析 | 第52-56页 |
| ·聚类分析 | 第56-57页 |
| ·ITS2序列二级结构比较 | 第57-59页 |
| ·讨论 | 第59-60页 |
| ·青天葵与同属近缘品的鉴别 | 第60-68页 |
| ·材料与试剂 | 第60页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·试剂与仪器 | 第60页 |
| ·方法 | 第60-63页 |
| ·DNA提取、PCR扩增和测序 | 第60-63页 |
| ·数据分析 | 第63页 |
| ·序列处理与提交 | 第63页 |
| ·不同候选序列的序列变异分析 | 第63页 |
| ·Wilcoxon秩合检验 | 第63页 |
| ·Barcoding gap评估 | 第63页 |
| ·鉴定成功率评价 | 第63页 |
| ·遗传关系分析 | 第63页 |
| ·结果与分析 | 第63-67页 |
| ·扩增和测序成功率 | 第63-64页 |
| ·种间和种内变异分析 | 第64-65页 |
| ·barcoding gap评价 | 第65-66页 |
| ·鉴定效率评价 | 第66页 |
| ·基于;WC7/尺序列的亲缘关系分析 | 第66-67页 |
| ·讨论 | 第67-68页 |
| ·小结 | 第68页 |
| 参考文献 | 第68-70页 |
| 第三章 青天葵转录组学研究 | 第70-97页 |
| ·植物材料 | 第70页 |
| ·方法 | 第70-73页 |
| ·RNA提取 | 第70页 |
| ·cDNA文库的建立和测序 | 第70-71页 |
| ·序列组装 | 第71-72页 |
| ·基因注释和挖掘 | 第72-73页 |
| ·基因表达量计算 | 第73页 |
| ·结果与分析 | 第73-95页 |
| ·RNA提取 | 第73-74页 |
| ·产量统计、序列组装、基因注释 | 第74-77页 |
| ·SSR分析 | 第77-78页 |
| ·基因注释和分类 | 第78-81页 |
| ·代谢途径分析 | 第81-83页 |
| ·基因差异表达分析 | 第83-85页 |
| ·基因挖掘 | 第85-87页 |
| ·次生代谢产物生源途径相关基因 | 第85-86页 |
| ·生理功能过程相关基因 | 第86-87页 |
| 附表 | 第87-95页 |
| ·讨论 | 第95页 |
| ·小结 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-97页 |
| 第四章 青天葵转录组的验证—器官生长调控基因NfEBP1的克隆与分析 | 第97-132页 |
| ·材料与试药 | 第97-99页 |
| ·植物材料 | 第97页 |
| ·引物 | 第97页 |
| ·菌种与载体 | 第97-98页 |
| ·分子生物学试剂 | 第98页 |
| ·其他相关试剂配制 | 第98-99页 |
| ·测序 | 第99页 |
| ·主要仪器 | 第99页 |
| ·方法 | 第99-111页 |
| ·NfEBPl的克隆 | 第99-107页 |
| ·青天葵叶片总RNA提取 | 第99-100页 |
| ·引物设计 | 第100页 |
| ·5'-RACE | 第100-104页 |
| ·3'-RACE | 第104-106页 |
| ·cDNA全序列的拼接 | 第106页 |
| ·NfEBP1编码区的克隆 | 第106-107页 |
| ·序列提交 | 第107页 |
| ·基因编码蛋白的分析 | 第107页 |
| ·NfEBP1在青天葵不同组织的表达分析 | 第107-111页 |
| ·青天葵不同组织的RNA提取 | 第107-108页 |
| ·反转录PCR | 第108页 |
| ·引物设计 | 第108-109页 |
| ·内参基因核心片段的普通PCR扩增 | 第109-110页 |
| ·内参基因扩增效率的检测 | 第110页 |
| ·内参基因的稳定性评价 | 第110页 |
| ·目的基因NfEBP1在青天葵不同组织的相对表达量分析 | 第110-111页 |
| ·结果与分析 | 第111-128页 |
| ·N-BP1的克隆 | 第111-122页 |
| ·RNA提取效果 | 第111页 |
| ·Unigene片段的筛选 | 第111页 |
| ·NfEBP1的5’RACE克隆 | 第111-114页 |
| ·NfEBP1的3’RACE克隆 | 第114-117页 |
| ·NfEBP1的全长的拼接 | 第117-118页 |
| ·NfEBP1编码区的克隆及编码蛋白分析 | 第118-122页 |
| ·NfEBP1在青天葵不同组织中的表达分析 | 第122-128页 |
| ·青天葵组织总RNA提取 | 第122-123页 |
| ·内参基因的普通PCR扩增 | 第123页 |
| ·内参基因的扩增效率和特异性 | 第123-125页 |
| ·内参基因的实时定量PCR分析 | 第125-126页 |
| ·内参基因的稳定性评价 | 第126-127页 |
| ·NfEBP1在青天葵不同组织的表达分析 | 第127-128页 |
| ·讨论 | 第128-130页 |
| ·NfEBP1的克隆与表达 | 第128-129页 |
| ·青天葵实时荧光定量PCR内参基因的选择 | 第129-130页 |
| ·小结 | 第130页 |
| 参考文献 | 第130-132页 |
| 第五章 结论与展望 | 第132-134页 |
| ·结论 | 第132-133页 |
| ·展望 | 第133-134页 |
| 附录 | 第134-165页 |
| 附录1 青天葵KEGG代谢途径及基因差异 | 第134-151页 |
| 附录2 NJEBP1-5’564 BLASTN结果 | 第151-153页 |
| 附录3 NfEBP1-3’807 BLASTN结果 | 第153-155页 |
| 附录4 NfEBP1编码区序列BLASTN结果 | 第155-157页 |
| 附录5 NfEBP1氨基酸序列BLASTP结果 | 第157-159页 |
| 附录6 NfEBP1亚细胞定位分析结果 | 第159-160页 |
| 附录7 英文缩略词表 | 第160-161页 |
| 附录8 图片目录 | 第161-163页 |
| 附录9 表格目录 | 第163-165页 |
| 研究生在学期间参与课题情况 | 第165-166页 |
| 研究生在学期间发表论文及著作 | 第166-168页 |
| 研究生在学期间获得的奖励和资助 | 第168-169页 |
| 致谢 | 第169-170页 |
| 统计学证明 | 第170页 |
