生物分子数据的距离度量及其应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-19页 |
| ·生物信息学概论 | 第9-15页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第9-10页 |
| ·生物信息学的研究对象 | 第10-12页 |
| ·生物信息学的主要研究领域 | 第12-15页 |
| ·生物分子数据的比较 | 第15-17页 |
| ·序列比对 | 第15-16页 |
| ·不依赖于比对的序列比较方法 | 第16-17页 |
| ·本文的主要工作 | 第17-19页 |
| 2 基于"字频率"的序列比较方法 | 第19-35页 |
| ·研究概括 | 第19-20页 |
| ·加权序列熵 | 第20-27页 |
| ·典相对熵方法及其缺陷 | 第21-22页 |
| ·加权序列熵方法 | 第22-23页 |
| ·构建25种病毒的全基因组种系发生树 | 第23-27页 |
| ·序列比较的一个Poisson模型 | 第27-35页 |
| ·基于字"表达水平"的距离度量 | 第28-29页 |
| ·应用 | 第29-32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-35页 |
| 3 基于信息论的距离度量及其应用 | 第35-51页 |
| ·符号序列的LZ复杂度及距离度量 | 第35-37页 |
| ·蛋白质亚细胞位点预测 | 第37-44页 |
| ·蛋白质序列数据 | 第38-39页 |
| ·k-近邻与模糊k-近邻算法 | 第39-40页 |
| ·夹克刀检验与算法性能评估 | 第40-41页 |
| ·结果与讨论 | 第41-44页 |
| ·基于主链二面角的蛋白质结构分类 | 第44-50页 |
| ·蛋白质结构数据 | 第45页 |
| ·蛋白质二级结构的角序列 | 第45-47页 |
| ·结果与讨论 | 第47-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 4 用DNA约化二元序列构建物种系统发生树 | 第51-62页 |
| ·分子进化与系统发育分析 | 第51-52页 |
| ·DNA序列的特征序列 | 第52-53页 |
| ·用DNA序列的特征序列来构建系统发生树 | 第53-58页 |
| ·一个基因组进化模型 | 第58-60页 |
| ·本章小结 | 第60-62页 |
| 结论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-72页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 作者简介 | 第74-75页 |
