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甜菜当年抽苔差异表达基因的克隆及特性研究

摘要第1-12页
Abstract第12-14页
1 前言第14-38页
   ·甜菜的生物学特性及甜菜种植业在国民经济中的意义第14页
   ·甜菜抽苔机理的研究第14-22页
     ·栽培甜菜当年抽苔的研究进展第15-18页
     ·植物春化作用和光周期的分子生物学研究进展概述第18-21页
     ·分子生物学在甜菜抽苔相关基因研究中的应用第21-22页
   ·植物基因差异表达(DGE)分析方法第22-27页
     ·差异显示技术(DDRT)第23-24页
     ·cDNA代表性差示分析(cDNA-RDA)第24页
     ·抑制消减杂交法(SSH)第24-25页
     ·交互扣除RNA差别显示技术(RSDD)第25-26页
     ·基因表达系统分析(SAGE)第26页
     ·GeneCalling第26-27页
     ·各种差异表达分析技术比较第27页
   ·植物基因克隆的方法及研究进展第27-32页
     ·根据基因差异表达分析进行克隆第27页
     ·结合分子标记的染色体定位克隆第27-28页
     ·根据已知基因序列PCR扩增克隆基因第28-29页
     ·根据已知蛋白序列的进行功能克隆第29页
     ·转座子或T-DNA标签法第29-30页
     ·表达序列标签法(EST)第30-31页
     ·应用DNA芯片技术筛选新基因第31页
     ·人工合成并克隆基因第31-32页
   ·植物全长基因的获得方法进展第32-33页
     ·基因文库筛选第32页
     ·RACE技术第32-33页
   ·植物基因内含子及其对基因表达水平的影响第33-35页
     ·内含子的产生第33-34页
     ·植物基因内含子的结构特点第34页
     ·植物基因内含子对基因表达模式及表达水平的影响第34-35页
   ·本研究意义、研究内容、预期目标和技术路线第35-38页
     ·研究意义第35页
     ·研究内容第35-36页
     ·预期目标第36-37页
     ·技术路线第37-38页
2 材料与方法第38-67页
   ·cDNA代表性差示分析(cDNA-RDA)第38-50页
     ·试验材料第39-40页
     ·试验方法第40-47页
     ·差异片段的克隆第47-49页
     ·酶切鉴定第49页
     ·测序第49-50页
   ·cDNA末端快速扩增(RACE)第50-56页
     ·引物设计和合成第50页
     ·cDNA 3′末端快速扩增(3′ RACE)第50-53页
     ·cDNA 5′末端快速扩增(5′ RACE)第53-55页
     ·3′RACE和5′RACE扩增产物的测序第55-56页
     ·RACE扩增产物序列的拼接第56页
   ·甜菜cDNA和基因组DNA的PCR扩增及克隆、测序第56-59页
     ·引物设计第56页
     ·cDNA的PCR扩增及克隆、测序第56-57页
     ·基因组DNA的PCR扩增及克隆、测序第57-59页
   ·差异片段RT-PCR分析和RNA、DNA杂交第59-63页
     ·RT-PCR分析第59页
     ·RNA杂交(Northern Blot)第59-61页
     ·DNA杂交(Southern Blot)第61-63页
   ·目的片段的原核表达及SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第63-67页
     ·目的片段的原核表达第63-65页
     ·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第65-67页
3 结果与分析第67-94页
   ·甜菜抽苔相关基因cDNA代表性差示分析(cDNA-RDA)第67-72页
     ·RNA的提取第67页
     ·cDNA第一链及cDNA第二链的合成第67-68页
     ·Tester和Driver cDNA的扩增第68-69页
     ·杂交-扩增第69页
     ·差异片段的克隆第69-71页
     ·测序及同源性比较第71-72页
   ·cDNA末端快速扩增第72-75页
     ·cDNA 3′末端快速扩增(3′ RACE)第72-73页
     ·cDNA 5′末端快速扩增(5′ RACE)第73-74页
     ·3′ RACE和5′ RACE测序结果与靶序列DP3的双拼接第74-75页
   ·cDNA和基因组DNA的PCR扩增及克隆、测序第75-80页
     ·cDNA的PCR扩增及克隆、测序第75-78页
     ·基因组DNA的PCR扩增及克隆、测序第78-80页
   ·cDNA差异片段的同源性比较分析第80-83页
     ·Ty7Br600 cDNA在GenBank基因数据库中同源性检索第80-82页
     ·Ty7Br900 DNA中的内含子序列第82页
     ·TA33Br600 DNA与特异cDNA片段Ty7Br600的比较第82-83页
   ·差异cDNA片段蛋白产物结构、功能预测第83-87页
     ·cDNA差异片段蛋白产物氨基酸序列的预测第83页
     ·Ty7Br600基因推断的蛋白结构分析第83-87页
   ·差异片段RT-PCR分析和RNA、DNA杂交第87-91页
     ·RT-PCR分析第87-88页
     ·RNA杂交(Northern Blot)第88-89页
     ·DNA杂交(Southern Blot)第89-91页
   ·目的片段的原核表达及SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第91-94页
     ·目的片段的原核表达第91-92页
     ·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第92-94页
4 讨论第94-99页
   ·实验选材与方法选择第94-95页
     ·实验选材第94页
     ·方法选择第94-95页
   ·cDNA-RDA与RACE结合的优越性第95-96页
   ·蛋白质在大肠杆菌中的表达第96页
   ·甜菜抽苔相关基因的克隆第96-97页
   ·甜菜抽苔的可能机制第97-98页
   ·存在的问题及展望第98-99页
5 结论第99-101页
   ·低温诱导甜菜抽苔差异表达基因片段的克隆第99页
   ·cDNA和基因组DNA的PCR扩增及克隆第99页
   ·差异表达基因Ty7Br600的特性第99-100页
   ·差异表达基因Ty7Br600的蛋白表达第100-101页
参考文献第101-113页
在读期间发表的文章第113-114页
致谢第114页

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