摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6页 |
第1章 绪论 | 第9-17页 |
1.1 瞬时受体电位通道(TRP)研究概述 | 第9-10页 |
1.1.1 瞬时受体电位通道简介 | 第9页 |
1.1.2 瞬时受体电位通道的结构与功能特征 | 第9-10页 |
1.2 TRPM8的研究进展 | 第10-15页 |
1.2.1 TRPM8的国内外研究背景 | 第10-12页 |
1.2.2 TRPM8的影响因素、结构及表达 | 第12页 |
1.2.3 TRPM8的作用机制及调节方式 | 第12-13页 |
1.2.4 TRPM8的病理生理学功能 | 第13-15页 |
1.3 研究内容及选题意义 | 第15-17页 |
第2章 鼠源TRPM8通道研究的理论和实验方法 | 第17-22页 |
2.1 同源模建 | 第17-19页 |
2.1.1 同源模建的基本步骤 | 第17-18页 |
2.1.2 同源模建工具 | 第18-19页 |
2.2 分子动力学模拟 | 第19-20页 |
2.2.1 分子动力学模拟的基本思想 | 第19页 |
2.2.2 能量最小化和能量平衡 | 第19-20页 |
2.3 分子对接 | 第20-21页 |
2.3.1 分子对接原理 | 第20页 |
2.3.2 分子对接方法分类 | 第20页 |
2.3.3 常见的分子对接软件 | 第20-21页 |
2.3.4 构象搜索的常用方法 | 第21页 |
2.4 本章小结 | 第21-22页 |
第3章 鼠源TRPM8结构的同源模建 | 第22-33页 |
3.1 实验材料 | 第22页 |
3.2 计算平台 | 第22-25页 |
3.2.1 硬件平台 | 第22-23页 |
3.2.2 软件平台 | 第23-25页 |
3.3 试验过程 | 第25-31页 |
3.3.1 TRPM8模型的构建 | 第25-29页 |
3.3.2 模型的精修 | 第29-31页 |
3.4 试验结果与讨论 | 第31-32页 |
3.4.1 动力学模拟结果讨论 | 第31-32页 |
3.4.2 模型结构的讨论 | 第32页 |
3.5 本章小结 | 第32-33页 |
第4章 不同温度下相互作用对鼠源TRPM8通道门控机制的影响 | 第33-40页 |
4.1 不同温度下的分子动力学模拟 | 第33-34页 |
4.1.1 对体系进行310K、280K的分子动力学模拟 | 第33页 |
4.1.2 结果及分析 | 第33-34页 |
4.2 低温更有利于维持TRPM8通道下方门的开放 | 第34-35页 |
4.3 温度引起构象发生变化的分子机制 | 第35-39页 |
4.3.1 温度诱导构象发生变化 | 第35-36页 |
4.3.2 调控通道的相互作用网络 | 第36-39页 |
4.4 本章小结 | 第39-40页 |
第5章 鼠源TRPM8模型与配体的对接研究 | 第40-43页 |
5.1 试验材料 | 第40页 |
5.2 试验过程 | 第40-41页 |
5.2.1 配体分子的准备 | 第40页 |
5.2.2 受体分子的准备 | 第40页 |
5.2.3 运行AutoGrid | 第40-41页 |
5.2.4 运行AutoDock | 第41页 |
5.3 对接结果与讨论 | 第41-42页 |
5.4 本章小结 | 第42-43页 |
第6章 结论与展望 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-48页 |
攻读学位期间所取得的相关科研成果 | 第48-49页 |
致谢 | 第49页 |