致谢 | 第5-6页 |
摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7页 |
附表 1 缩略语表 | 第8-11页 |
1 引言 | 第11-34页 |
1.1 非编码RNA分类及功能概述 | 第11-12页 |
1.1.1 miRNA | 第11页 |
1.1.2 lncRNA | 第11-12页 |
1.1.3 其它 | 第12页 |
1.2 lncRNA研究进展概述 | 第12-28页 |
1.2.1 lncRNA的概念和分类 | 第13页 |
1.2.2 lncRNA的生物学功能 | 第13-14页 |
1.2.3 lncRNA的作用机制 | 第14-15页 |
1.2.4 lncRNA的高通量鉴定 | 第15-16页 |
1.2.5 lncRNA研究的常用数据库资源与工具 | 第16-26页 |
1.2.6 lncRNA研究中的常用技术 | 第26-28页 |
1.3 视觉系统的结构和功能 | 第28-30页 |
1.3.1 眼部及视网膜结构 | 第28-30页 |
1.3.2 视网膜功能和视觉的形成机制 | 第30页 |
1.4 lncRNA在眼疾发病和眼睛发育过程中的功能研究 | 第30-32页 |
1.4.1 眼部疾病相关lncRNA的研究现状 | 第30-31页 |
1.4.2 lncRNA与眼部发育过程中相关的研究现状 | 第31-32页 |
1.5 展望 | 第32-34页 |
1.5.1 lncRNA鉴定和功能研究面临的主要问题 | 第32-33页 |
1.5.2 视网膜lncRNA研究的重点和意义 | 第33-34页 |
2. 转录组测序和lncRNA鉴定 | 第34-51页 |
2.1 RNA提取 | 第34-35页 |
2.1.1 材料、试剂与设备 | 第34页 |
2.1.2 实验方法 | 第34-35页 |
2.2 转录组链特异性文库制备 | 第35-43页 |
2.2.1 poly A+RNA纯化 | 第35-37页 |
2.2.2 cDNA合成 | 第37-39页 |
2.2.3 链特异性RNA-seq文库制备 | 第39-43页 |
2.3 转录组测序与分析 | 第43-51页 |
2.3.1 转录组测序数据的处理 | 第43页 |
2.3.2 lncRNA的鉴定 | 第43-45页 |
2.3.3 lncRNA鉴定结果 | 第45-46页 |
2.3.4 lncRNA的表达分析 | 第46-48页 |
2.3.5 linc RNA功能富集分析 | 第48-51页 |
3.视网膜中lncRNA的验证 | 第51-60页 |
3.1 实验材料 | 第51页 |
3.1.1 cDNA文库 | 第51页 |
3.1.2 引物合成 | 第51页 |
3.1.3 主要试剂与材料 | 第51页 |
3.1.4 主要仪器 | 第51页 |
3.2 实验方法 | 第51-55页 |
3.2.1 视网膜cDNA文库制备 | 第51-53页 |
3.2.2 引物设计 | 第53页 |
3.2.3 PCR检测 | 第53-54页 |
3.2.4 凝胶回收 | 第54页 |
3.2.5 PCR产物测序和结果分析 | 第54-55页 |
3.3 结果 | 第55-57页 |
3.3.1 引物设计 | 第55-56页 |
3.3.2 产物及测序结果 | 第56-57页 |
3.4 转录本统计分析 | 第57-58页 |
3.5 实验小结 | 第58-60页 |
4.结果与讨论 | 第60-63页 |
参考文献 | 第63-70页 |