| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 缩略语表 | 第10-16页 |
| 第1章 绪论 | 第16-42页 |
| 1.1 同源重组技术 | 第16-21页 |
| 1.1.1 Red/ET重组工程 | 第16-18页 |
| 1.1.2 Red/ET重组的应用 | 第18-19页 |
| 1.1.3 其他同源重组系统 | 第19-21页 |
| 1.2 天然产物的简介 | 第21-39页 |
| 1.2.1 天然产物的生物合成 | 第23-30页 |
| 1.2.2 隐性基因簇的研究进展 | 第30-39页 |
| 1.3 立题依据和意义 | 第39-42页 |
| 第2章 Burkholderia rhizoxinica HKI454的隐性基因簇挖掘 | 第42-91页 |
| 2.1 研究背景 | 第42-45页 |
| 2.2 材料和方法 | 第45-57页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第45-49页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第49-57页 |
| 2.3 结果与分析 | 第57-89页 |
| 2.3.1 抗生素浓度筛选 | 第57-58页 |
| 2.3.2 生物信息学分析B.rhizoxinica HKI454的基因组 | 第58-59页 |
| 2.3.3 菌株B.rhizoxinica HKI454/pBBR1-RhaB-GBAS-km的构建 | 第59-60页 |
| 2.3.4 重组菌株B. rhizoxinica HKI454△PPTase-apra和B.rhizoxinica HKI454△rhi-apra的构建及发酵 | 第60-63页 |
| 2.3.5 重组菌株B.rhizoxinica HKI454△rhi-genta的构建及发酵 | 第63页 |
| 2.3.6 不同基因簇在重组菌株HKI454△rhi的修饰及代谢图谱的比较 | 第63-66页 |
| 2.3.7 质粒pBRH01的cluster1在重组菌株HKI454△rhi的原位修饰及重组子的发酵 | 第66-68页 |
| 2.3.8 质粒pBRH01的cluster7在重组菌株HKI454△rhi的原位修饰及重组子的发酵 | 第68-71页 |
| 2.3.9 cluster1表达的化合物的分离纯化及结构解析 | 第71-87页 |
| 2.3.10 化合物rhizomide A的生物活性检测 | 第87-89页 |
| 2.4 讨论 | 第89-91页 |
| 第3章 Burkholderia DSM7029的隐性基因簇挖掘 | 第91-127页 |
| 3.1 研究背景 | 第91-92页 |
| 3.2 材料和方法 | 第92-103页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第92-96页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第96-103页 |
| 3.3 结果与分析 | 第103-125页 |
| 3.3.1 抗生素浓度筛选 | 第103页 |
| 3.3.2 生物信息学分析Burkholderia DSM7029的基因组 | 第103-104页 |
| 3.3.3 基因簇的直接克隆 | 第104-109页 |
| 3.3.4 菌株Burkholderia DSM7029/pBBR1-RhaB-gRedαβ7029-km的构建 | 第109页 |
| 3.3.5 重组菌株Burkholderia DSM7029△PPTase的构建及发酵 | 第109-111页 |
| 3.3.6 基因簇cluster11在野生型菌株Burkholderia DSM7029中的原位修饰及重组子的发酵 | 第111-115页 |
| 3.3.7 不同基因簇在重组菌株Burkholderia DSM7029△glb中的修饰及代谢图谱的比较 | 第115-117页 |
| 3.3.8 基因簇cluster11在重组菌株Burkholderia DSM7029△glb中的原位修饰及重组子的发酵 | 第117-119页 |
| 3.3.9 基因簇cluster7在重组菌株Burkholderia DSM7029△glb中的原位修饰及重组子的发酵 | 第119-125页 |
| 3.4 讨论 | 第125-127页 |
| 第4章 益生菌E. coli Nissle 1917的CDI功能研究 | 第127-147页 |
| 4.1 研究背景 | 第127-129页 |
| 4.2 材料及方法 | 第129-135页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第129-133页 |
| 4.2.2 实验方法 | 第133-135页 |
| 4.3 结果与分析 | 第135-145页 |
| 4.3.1 基因组分析 | 第135-138页 |
| 4.3.2 完整的CDI基因簇的功能验证 | 第138-139页 |
| 4.3.3 CDI基因簇的直接克隆 | 第139页 |
| 4.3.4 CdiA-CT和CdiA-CT_(O1)的生物活性 | 第139-140页 |
| 4.3.5 CdiA-CT的不同截短结构及生物活性 | 第140-141页 |
| 4.3.6 CdiI免疫蛋白中和CdiA的生物活性 | 第141-143页 |
| 4.3.7 CdiA-KO8蛋白与CdiB和CdiI的相关性 | 第143-145页 |
| 4.4 讨论 | 第145-147页 |
| 第5章 研究结论与展望 | 第147-149页 |
| 5.1 主要研究结论 | 第147页 |
| 5.2 展望 | 第147-149页 |
| 参考文献 | 第149-164页 |
| 论文发表情况 | 第164-165页 |
| 致谢 | 第165-166页 |
| 本论文感谢以下基金项目的资助 | 第166-167页 |
