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基于RNA核糖开关调控的类黄酮生物传感器的构建与应用

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 绪论第18-39页
    1.1 黄酮类化合物概述第18-26页
        1.1.1 黄酮类化合物的结构第18-20页
        1.1.2 黄酮类化合物的生物活性第20-21页
        1.1.3 黄酮类化合物的生物合成途径第21-24页
        1.1.4 黄酮类化合物的代谢调控研究现状第24-26页
    1.2 核糖开关研究进展第26-32页
        1.2.1 核糖开关的发现第26-29页
        1.2.2 核糖开关的结构第29-30页
        1.2.3 核糖开关的作用机理第30-32页
    1.3 生物传感器的研究与应用第32-38页
        1.3.1 生物传感器的工作原理第32-34页
        1.3.2 生物传感器的性能参数第34-35页
        1.3.3 生物传感器的应用第35-38页
    1.4 立题目的及意义第38页
    1.5 本论文研究内容第38-39页
第二章 柚皮素核糖开关的建构第39-60页
    2.1 前言第39页
    2.2 材料与方法第39-49页
        2.2.1 菌种和培养基第39-42页
        2.2.2 主要试剂及仪器第42-43页
        2.2.3 实验方法第43-48页
            2.2.3.1 实验室常用分子生物学操作技术第43-44页
            2.2.3.2 柚皮素响应RNA适体的体外SELEX筛选第44-47页
            2.2.3.3 核糖开关文库的构建第47页
            2.2.3.4 核糖开关的体内富集第47-48页
        2.2.4 核糖开关剂量反应曲线的测定第48页
        2.2.5 核糖开关对类黄酮生产菌的响应第48-49页
        2.2.6 RNA高级结构的预测第49页
    2.3 结果与讨论第49-59页
        2.3.1 SELEX体外适体筛选第49-51页
            2.3.1.1 柚皮素的固定化第49-50页
            2.3.1.2 柚皮素RNA适体的SELEX筛选第50-51页
        2.3.2 核糖开关的胞内富集第51-55页
            2.3.2.1 核糖开关文库的建构第51-53页
            2.3.2.2 核糖开关胞内富集条件的优化第53-54页
            2.3.2.3 核糖开关胞内富集结果第54-55页
        2.3.3 核糖开关的测序结果第55-57页
        2.3.4 核糖开关柚皮素剂量反应曲线第57-58页
        2.3.5 核糖开关胞内专一性初探第58-59页
    2.4 小结第59-60页
第三章 柚皮素核糖开关的构效关系研究第60-90页
    3.1 前言第60页
    3.2 材料与方法第60-67页
        3.2.1 菌种和培养基第60-61页
        3.2.2 主要试剂及仪器第61-63页
        3.2.3 实验方法第63-67页
            3.2.3.1 核糖开关的生物活性检验第63页
            3.2.3.2 类黄酮平行筛选实验条件第63-64页
            3.2.3.3 流式细胞仪的荧光测定第64页
            3.2.3.4 分析软件第64页
            3.2.3.5 QSPR建模方法第64-67页
    3.3 结果与讨论第67-89页
        3.3.1 核糖开关的柚皮素响应特征第67-68页
        3.3.2 柚皮素核糖开关生物专一性平行筛选第68-71页
        3.3.3 基于核糖开关M1的生物传感器构效分析第71-78页
            3.3.3.1 模型M1的特征描述符第71-72页
            3.3.3.2 模型M1的评价第72-74页
            3.3.3.3 模型M1的生物学特征第74-78页
        3.3.4 基于核糖开关M2的生物传感器构效分析第78-81页
            3.3.4.1 模型M2的特征描述符第78-79页
            3.3.4.2 模型M2的评价第79-80页
            3.3.4.3 模型M2的生物学特征第80-81页
        3.3.5 基于核糖开关O的生物传感器构效分析第81-85页
            3.3.5.1 模型O的特征描述符第81-82页
            3.3.5.2 模型O的评价第82-83页
            3.3.5.3 模型O的生物学特征第83-85页
        3.3.6 核糖开关对黄酮类糖苷化合物的响应与分析第85-89页
    3.4 小结第89-90页
第四章 柚皮素高通量筛选平台的构建第90-105页
    4.1 前言第90页
    4.2 材料与方法第90-96页
        4.2.1 菌种和培养基第90-91页
        4.2.2 主要试剂及仪器第91-92页
        4.2.3 实验方法第92-96页
            4.2.3.1 启动子对核糖开关表征的影响第92页
            4.2.3.2 核糖开关表征随时间的变化第92-93页
            4.2.3.3 宿主菌对核糖开关表征的影响第93页
            4.2.3.4 培养基对核糖开关表征的影响第93页
            4.2.3.5 柚皮素生产菌的构建第93-94页
            4.2.3.6 生物传感器与生产菌的共培养条件第94-95页
            4.2.3.7 高效液相色谱测定柚皮素含量第95-96页
    4.3 结果与讨论第96-103页
        4.3.1 核糖开关表征性能的影响因素第96-100页
            4.3.1.1 基因元件对核糖开关表征的影响第96-98页
            4.3.1.2 宿主菌对核糖开关表征的影响第98-99页
            4.3.1.3 培养基对核糖开关表征的影响第99-100页
        4.3.2 双荧光生物传感器的构建第100-102页
        4.3.3 生物传感器在共培养体系中的应用第102-103页
    4.4 小结第103-105页
第五章 结论与展望第105-108页
参考文献第108-116页
附录1 tetA序列第116-117页
附录2 黄酮类化合物平行筛选的表征结果第117-118页
附录3 核糖开关M1其它活性位点分子对接碰撞特性得分与荧光激发值对比第118-120页
致谢第120-121页
研究成果及发表的学术论文第121-122页
作者简介第122页
导师简介第122-123页
附件第123-124页

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