| 中文摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 第1章 引言 | 第14-24页 |
| 1.1 水生植物异型叶分化概述 | 第14-17页 |
| 1.1.1 异型叶的生理结构和功能差异 | 第14-15页 |
| 1.1.2 环境对异型叶分化的影响 | 第15-16页 |
| 1.1.3 植物激素对异型叶的分化作用 | 第16页 |
| 1.1.4 异型叶的相关分子研究 | 第16-17页 |
| 1.2 转录组分析技术 | 第17-22页 |
| 1.2.1 转录组学的概念 | 第17-18页 |
| 1.2.2 转录组研究方法 | 第18-20页 |
| 1.2.2.1 基因芯片 | 第18页 |
| 1.2.2.2 基因表达系列分析技术与大规模平行测序技术 | 第18-19页 |
| 1.2.2.3 RNA测序技术 | 第19-20页 |
| 1.2.3 转录组测序在植物研究中的应用 | 第20-22页 |
| 1.2.3.1 有模式植物物种的转录组测序研究 | 第21页 |
| 1.2.3.2 无模式植物物种的转录组测序研究 | 第21-22页 |
| 1.2.4 De novo转录组数据分析的一般流程 | 第22页 |
| 1.3 眼子菜属异型叶的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.4 本研究的主要内容及解决的问题 | 第23-24页 |
| 第2章 钝脊眼子菜异型叶组织解剖结构特征的观察 | 第24-33页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.2.2 叶片形态结构的观察 | 第25-26页 |
| 2.2.3 表皮结构的观察 | 第26页 |
| 2.2.4 叶片解剖结构观察 | 第26页 |
| 2.2.5 叶绿素含量的测定 | 第26-27页 |
| 2.2.6 数据处理与统计分析 | 第27页 |
| 2.3 结果 | 第27-31页 |
| 2.3.1 钝脊眼子菜异型叶形态的变化 | 第27-28页 |
| 2.3.2 钝脊眼子菜异型叶的表皮特征 | 第28-30页 |
| 2.3.3 解剖结构 | 第30-31页 |
| 2.3.4 钝脊眼子菜异型叶的叶绿素含量 | 第31页 |
| 2.4 讨论 | 第31-33页 |
| 第3章 水位梯度对钝脊眼子菜生长和繁殖的影响 | 第33-44页 |
| 3.1 引言 | 第33-34页 |
| 3.2 材料与方法 | 第34-36页 |
| 3.2.1 试验地概况 | 第34页 |
| 3.2.2 植株的选取 | 第34页 |
| 3.2.3 试验设计 | 第34页 |
| 3.2.4 形态指标测定 | 第34-35页 |
| 3.2.5 胚珠和花粉量测定 | 第35页 |
| 3.2.6 自然结实统计 | 第35页 |
| 3.2.7 数据处理 | 第35-36页 |
| 3.3 结果 | 第36-41页 |
| 3.3.1 钝脊眼子菜在不同水深条件的平均株高变化 | 第36-37页 |
| 3.3.2 水深对钝脊眼子菜单株生物量及形态特征的影响 | 第37-39页 |
| 3.3.3 平均节间长和平均节间生物量 | 第39-40页 |
| 3.3.4 水深对钝脊眼子菜生物量分配及繁殖的影响 | 第40页 |
| 3.3.5 花粉数和结实数 | 第40-41页 |
| 3.4 讨论 | 第41-44页 |
| 3.4.1 水深对钝脊眼子菜生长的影响 | 第41-42页 |
| 3.4.2 水位梯度对植物生物量和繁殖器官的影响 | 第42-44页 |
| 第4章 HPLC法测定钝脊眼子菜异型叶生长过程中内源激素含量的变化 | 第44-53页 |
| 4.1 引言 | 第44-45页 |
| 4.2 材料与方法 | 第45-46页 |
| 4.2.1 材料 | 第45页 |
| 4.2.2 方法 | 第45-46页 |
| 4.3 结果 | 第46-50页 |
| 4.3.1 洗脱程序优化 | 第46-48页 |
| 4.3.2 标准曲线 | 第48-49页 |
| 4.3.3 样品激素含量的测定和加标回收率测试 | 第49页 |
| 4.3.4 钝脊眼子菜不同生长阶段叶片中ZT、GA3、IAA、ABA含量的变化规律 | 第49-50页 |
| 4.4 讨论 | 第50-53页 |
| 第5章 钝脊眼子菜转录组数据库建立及功能注释、代谢通路分析 | 第53-66页 |
| 5.1 前言 | 第53页 |
| 5.2 实验材料 | 第53-54页 |
| 5.2.1 研究材料 | 第53页 |
| 5.2.2 主要试剂 | 第53-54页 |
| 5.2.3 主要仪器 | 第54页 |
| 5.3 实验方法 | 第54-59页 |
| 5.3.1 样品的采集 | 第54页 |
| 5.3.2 RNA提取及纯化 | 第54-55页 |
| 5.3.3 总RNA质量的检测 | 第55页 |
| 5.3.4 测序文库的制备 | 第55-58页 |
| 5.3.4.1 mRNA的纯化 | 第55页 |
| 5.3.4.2 mRNA片段化 | 第55页 |
| 5.3.4.3 cDNA第一链的合成 | 第55-56页 |
| 5.3.4.5 末端修复 | 第56-57页 |
| 5.3.4.6 cDNA3'末端加A | 第57页 |
| 5.3.4.7 Adapter连接 | 第57页 |
| 5.3.4.8 琼脂糖凝胶电泳分离及片段回收 | 第57页 |
| 5.3.4.9 cDNA片段扩增 | 第57-58页 |
| 5.3.4.10 文库质量检测 | 第58页 |
| 5.3.5 文库测序 | 第58页 |
| 5.3.6 测序数据的处理及组装 | 第58-59页 |
| 5.3.7 转录组功能注释及代谢分析 | 第59页 |
| 5.4 结果 | 第59-65页 |
| 5.4.1 RNA质量检测 | 第59-60页 |
| 5.4.2 产量统计及组装结果 | 第60-62页 |
| 5.4.3 Unigene功能注释 | 第62-65页 |
| 5.4.3.1 Unigene的GO分类 | 第62-63页 |
| 5.4.3.2 Unigene的COG和KOG功能注释 | 第63-65页 |
| 5.4.3.3 Unigene的KEGG Pathway分类 | 第65页 |
| 5.5 讨论 | 第65-66页 |
| 第6章 不同发育时期异型叶转录组差异表达基因分析 | 第66-94页 |
| 6.1 前言 | 第66页 |
| 6.2 数据分析方法 | 第66-69页 |
| 6.2.1 基因表达量的计算 | 第66页 |
| 6.2.2 差异表达基因的筛选 | 第66-68页 |
| 6.2.3 差异表达基的qPCR验证 | 第68-69页 |
| 6.2.3.1 差异表达基因的筛选及引物设计 | 第68页 |
| 6.2.3.2 RNA提取 | 第68页 |
| 6.2.3.3 DNA酶消化 | 第68页 |
| 6.2.3.4 两步法RT-PCR | 第68-69页 |
| 6.2.3.5 数据分析 | 第69页 |
| 6.3 结果与分析 | 第69-91页 |
| 6.3.1 植物转录因子差异表达基因的筛选 | 第69-70页 |
| 6.3.2 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第70-78页 |
| 6.3.2.1 GO差异表达基因GO功能富集 | 第71-74页 |
| 6.3.2.2 KEGG pathway差异表达基因富集分析 | 第74-78页 |
| 6.3.3 转录因子的鉴定 | 第78-82页 |
| 6.3.4 异型叶中植物激素代谢和信号通路 | 第82-88页 |
| 6.3.5 脱落酸和赤霉素生物合成相关基因 | 第88页 |
| 6.3.6 气孔复合体形态及角质层生长相关基因 | 第88页 |
| 6.3.7 差异表达基因的qPCR验证 | 第88-91页 |
| 6.4 讨论 | 第91-94页 |
| 第7章 结论与展望 | 第94-96页 |
| 7.1 本文的主要结论 | 第94-95页 |
| 7.2 展望 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-105页 |
| 附录 | 第105-119页 |
| 在读期间发表及投稿论文 | 第119-120页 |
| 致谢 | 第120页 |
