茶园土壤假单胞菌咖啡因降解相关基因克隆及功能解析
致谢 | 第6-11页 |
摘要 | 第11-13页 |
Abstract | 第13-14页 |
第1章 文献综述 | 第15-32页 |
1.1 咖啡因生理功能研究现状 | 第15-19页 |
1.1.1 对神经系统的作用 | 第15-16页 |
1.1.2 对心血管系统的影响 | 第16-17页 |
1.1.3 对内分泌系统的影响 | 第17页 |
1.1.4 对消化系统的影响 | 第17页 |
1.1.5 对呼吸系统的影响 | 第17-18页 |
1.1.6 抗癌功能 | 第18页 |
1.1.7 对骨组织的影响 | 第18-19页 |
1.1.8 对胚胎发育的影响 | 第19页 |
1.2 茶产品中脱咖啡因技术研究现状 | 第19-25页 |
1.2.1 溶剂萃取法 | 第20-21页 |
1.2.2 吸附分离脱咖啡因技术 | 第21-23页 |
1.2.3 膜分离脱咖啡因技术 | 第23页 |
1.2.4 超临界CO_2萃取脱咖啡因技术 | 第23-25页 |
1.2.5 低咖啡因茶树育种 | 第25页 |
1.3 微生物和酶途径降解咖啡因 | 第25-31页 |
1.3.1 降解咖啡因的微生物 | 第26页 |
1.3.2 细菌降解咖啡因研究 | 第26-31页 |
1.4 本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
第2章 基因组文库构建方法优化 | 第32-51页 |
2.1 材料与方法 | 第32-41页 |
2.1.1 细菌 | 第33页 |
2.1.2 主要试剂 | 第33页 |
2.1.3 主要仪器与设备 | 第33-34页 |
2.1.4 试剂配置方法 | 第34-35页 |
2.1.5 细菌培养与活化 | 第35页 |
2.1.6 基因DNA提取和切割 | 第35-37页 |
2.1.7 载体处理 | 第37-39页 |
2.1.8 DNA片段连接和转化 | 第39页 |
2.1.9 蓝白斑筛选 | 第39-40页 |
2.1.10 重组质粒检测 | 第40-41页 |
2.1.11 库容量鉴定 | 第41页 |
2.1.12 保菌 | 第41页 |
2.2 结果与分析 | 第41-49页 |
2.2.1 基因组DNA提取效果 | 第41-42页 |
2.2.2 基因组DNA切割效果 | 第42-45页 |
2.2.3 pUC19载体前处理效果 | 第45-47页 |
2.2.4 连接与转化效果 | 第47-49页 |
2.3 本章小结 | 第49-51页 |
第3章 转化子筛选和咖啡因降解相关基因簇分析 | 第51-76页 |
3.1 材料与方法 | 第52-53页 |
3.1.1 主要试剂 | 第52页 |
3.1.2 主要仪器与设备 | 第52页 |
3.1.3 CT25基因组文库构建 | 第52页 |
3.1.4 转化子咖啡因筛选培养基配制 | 第52页 |
3.1.5 野生大肠杆菌的抗咖啡因试验 | 第52页 |
3.1.6 文库筛选方法 | 第52-53页 |
3.1.7 阳性克隆序列分析 | 第53页 |
3.1.8 数据分析方法 | 第53页 |
3.2 结果与分析 | 第53-75页 |
3.2.1 野生大肠杆菌对咖啡因的抗性 | 第53-54页 |
3.2.2 文库筛选结果 | 第54-75页 |
3.3 本章小结 | 第75-76页 |
第4章 比较转录组差异表达分析 | 第76-111页 |
4.1 材料与方法 | 第77-84页 |
4.1.1 材料处理 | 第77页 |
4.1.2 转录组测序方法 | 第77-83页 |
4.1.3 序列组装 | 第83页 |
4.1.4 差异表达基因分析 | 第83-84页 |
4.1.5 差异表达基因的GO和COG分析 | 第84页 |
4.2 结果与分析 | 第84-109页 |
4.2.1 差异基因表达分析 | 第84-85页 |
4.2.2 差异基因GO注释结果 | 第85-104页 |
4.2.3 差异表达基因的COG富集分析 | 第104-106页 |
4.2.4 未知功能差异基因 | 第106-109页 |
4.3 本章小结 | 第109-111页 |
第5章 结论与展望 | 第111-113页 |
5.1 结论 | 第111-112页 |
5.2 展望 | 第112-113页 |
参考文献 | 第113-124页 |