| 符号说明 | 第4-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第14-30页 |
| 1.1 苹果连作障碍概述 | 第14-19页 |
| 1.1.1 连作障碍形成原因及其危害 | 第14-16页 |
| 1.1.2 连作障碍的防治措施 | 第16-19页 |
| 1.1.2.1 合理的轮作和间作制度 | 第16页 |
| 1.1.2.2 科学合理的施肥 | 第16-17页 |
| 1.1.2.3 土壤消毒 | 第17页 |
| 1.1.2.4 应用抗性品种和砧木 | 第17页 |
| 1.1.2.5 嫁接 | 第17页 |
| 1.1.2.6 生物防治 | 第17-19页 |
| 1.2 植物根际促生菌(PGPR)的作用机制 | 第19-22页 |
| 1.2.1 产生蛋白酶 | 第19-20页 |
| 1.2.2 溶磷和解磷的方式 | 第20页 |
| 1.2.3 产生调节植物生长物质 | 第20页 |
| 1.2.4 产生嗜铁素 | 第20-21页 |
| 1.2.5 拮抗病原菌 | 第21页 |
| 1.2.6 竞争作用 | 第21页 |
| 1.2.7 诱导系统抗性(InducedSystemicResistance,ISR) | 第21-22页 |
| 1.3 微生物肥料 | 第22-23页 |
| 1.3.1 微生物肥料的概述 | 第22页 |
| 1.3.2 微生物肥料的作用机制 | 第22页 |
| 1.3.3 微生物肥料的施用条件及注意问题 | 第22-23页 |
| 1.3.3.1 施用条件 | 第22页 |
| 1.3.3.2 施用方法 | 第22-23页 |
| 1.3.3.3 注意问题 | 第23页 |
| 1.3.3.4 发展前景 | 第23页 |
| 1.4 微生物多样性的研究 | 第23-26页 |
| 1.4.1 末端限制性酶切片段长度多态性分析法(T-RFLP) | 第24页 |
| 1.4.2 变性梯度凝胶电泳法(DGGE) | 第24页 |
| 1.4.3 聚合酶链式反应(PCR) | 第24-25页 |
| 1.4.4 高通量测序技术 | 第25-26页 |
| 1.5 微生物群落多样性的测度 | 第26-27页 |
| 1.5.1 物种丰富度指数 | 第26页 |
| 1.5.2 物种多样性指数 | 第26-27页 |
| 1.5.3 物种均匀度指数 | 第27页 |
| 1.6 立项依据、研究内容与技术路线 | 第27-30页 |
| 1.6.1 立项依据 | 第27-28页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第28-29页 |
| 1.6.3 技术路线 | 第29-30页 |
| 2 材料和方法 | 第30-37页 |
| 2.1 土样 | 第30-31页 |
| 2.1.1 取样地 | 第30页 |
| 2.1.2 土样采集试验设计 | 第30-31页 |
| 2.2 实验材料 | 第31-32页 |
| 2.2.1 生化试剂 | 第31页 |
| 2.2.2 主要仪器设备 | 第31页 |
| 2.2.3 主要溶液的配制方法 | 第31-32页 |
| 2.3 培养基的配制方法 | 第32页 |
| 2.4 土壤养分的测定方法 | 第32-33页 |
| 2.5 土壤微生物总DNA的提取及16SrDNA的PCR扩增 | 第33-34页 |
| 2.5.1 土壤总DNA的提取 | 第33页 |
| 2.5.2 PCR扩增引物 | 第33页 |
| 2.5.3 16S rDNA的PCR扩增 | 第33-34页 |
| 2.6 16S rDNA高通量测序 | 第34页 |
| 2.7 数据分析 | 第34页 |
| 2.8 苹果根际功能菌株的筛选 | 第34-36页 |
| 2.8.1 苹果根系土壤微生物的分离 | 第34页 |
| 2.8.2 苹果根际功能菌株的筛选 | 第34-36页 |
| 2.8.2.1 蛋白酶产生菌的筛选及产生能力的鉴定 | 第34-35页 |
| 2.8.2.2 生长素产生菌的筛选及产生能力的鉴定 | 第35页 |
| 2.8.2.3 有机磷降解菌的筛选及产生能力的鉴定 | 第35页 |
| 2.8.2.4 病原拮抗细菌的筛选及产生能力的鉴定 | 第35-36页 |
| 2.9 菌株鉴定 | 第36-37页 |
| 2.9.1 根际功能菌株的生理生化鉴定 | 第36页 |
| 2.9.2 根际功能菌株的16SrDNA系统鉴定 | 第36-37页 |
| 2.9.2.1 细菌DNA基因组提取 | 第36页 |
| 2.9.2.2 16S rDNA基因组测序及鉴定 | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-70页 |
| 3.1 根际功能菌株的筛选 | 第37-41页 |
| 3.1.1 蛋白酶产生菌的筛选 | 第37-38页 |
| 3.1.2 生长素产生菌的筛选 | 第38页 |
| 3.1.3 有机磷降解菌的筛选 | 第38-39页 |
| 3.1.4 拮抗细菌的筛选 | 第39-41页 |
| 3.2 菌种鉴定 | 第41-46页 |
| 3.2.1 功能菌株形态特征观察 | 第41-42页 |
| 3.2.2 生理生化鉴定 | 第42-43页 |
| 3.2.3 PGPR菌株系统发育分析 | 第43-46页 |
| 3.3 苹果根际土壤中的养分含量测定 | 第46-48页 |
| 3.3.1 养分含量的差异性分析 | 第46-47页 |
| 3.3.2 养分含量的柱状图分析 | 第47-48页 |
| 3.4 土壤样品的测序深度评估 | 第48-49页 |
| 3.5 苹果根际微生物群落的多样性和丰富度评估 | 第49-53页 |
| 3.5.1 Chao指数结果分析 | 第50页 |
| 3.5.2 Shannon指数结果分析 | 第50-51页 |
| 3.5.3 ACE指数结果分析 | 第51页 |
| 3.5.4 不同样品之间的OTU分布结果分析 | 第51-53页 |
| 3.6 苹果根际微生物群落的分类统计 | 第53-65页 |
| 3.6.1 门水平的分类统计 | 第53-55页 |
| 3.6.2 属水平的分类统计 | 第55-56页 |
| 3.6.3 样品共有属分析 | 第56-57页 |
| 3.6.4 属水平的年限和位点差异分析 | 第57-65页 |
| 3.6.4.1 相同位点不同年限的分析 | 第57-61页 |
| 3.6.4.2 相同年限不同位点的分析 | 第61-65页 |
| 3.7 苹果根际微生物群落的β多样性评估 | 第65-68页 |
| 3.7.1 主成分分析(PCA分析) | 第65-67页 |
| 3.7.2 群落组成间的热图分析(Heatmap图) | 第67-68页 |
| 3.8 微生物群落与环境因子的RDA分析 | 第68-70页 |
| 4 讨论 | 第70-75页 |
| 4.1 苹果根际促生菌的筛选和鉴定 | 第70-71页 |
| 4.2 不同年限和不同位点对苹果根际土壤中的养分的影响 | 第71-72页 |
| 4.3 不同年限和不同位点对苹果根际土壤微生物群落结构分析 | 第72-73页 |
| 4.4 微生物群落与环境因子的RDA分析 | 第73-75页 |
| 5 结论 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
