| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 文献综述 | 第12-22页 |
| 1 国内外对大鳞副泥鳅的研究现状 | 第12-14页 |
| 1.1 大鳞副泥鳅生态毒理学的研究 | 第12页 |
| 1.2 大鳞副泥鳅群体遗传学的研究 | 第12-13页 |
| 1.3 大鳞副泥鳅分子遗传学研究 | 第13-14页 |
| 2 分子标记与育种 | 第14-17页 |
| 2.1 分子标记的种类 | 第14-17页 |
| 3 SNP 标记在育种方面的应用 | 第17-20页 |
| 3.1 高密度遗传图谱的构建 | 第17页 |
| 3.2 遗传多样性研究 | 第17-18页 |
| 3.3 关联分析 | 第18-20页 |
| 4 高通量测序技术加快了 SNP 标记的开发进程 | 第20-22页 |
| 试验一 大鳞副泥鳅转录组结果分析以及 SNP 标记的开发 | 第22-34页 |
| 1 材料和方法 | 第22-24页 |
| 1.1 材料 | 第22页 |
| 1.2 RNA 的提取与转录组文库构建 | 第22-23页 |
| 1.3 转录组测序与组装 | 第23页 |
| 1.4 转录本基因注释 | 第23页 |
| 1.5 SNP 的分析 | 第23-24页 |
| 2 结果 | 第24-32页 |
| 2.1 数据的筛选、拼接与注释 | 第24-25页 |
| 2.2 SNP 的查找 | 第25-32页 |
| 3 讨论 | 第32-34页 |
| 3.1 测序结果注释 | 第32页 |
| 3.2 SNP 的开发 | 第32-33页 |
| 3.3 SNP 的验证 | 第33-34页 |
| 试验二 三个大鳞副泥鳅家系遗传多样性分析 | 第34-43页 |
| 1 材料与方法 | 第34-35页 |
| 1.1 样品的采集 | 第34页 |
| 1.2 样品 DNA 的提取 | 第34-35页 |
| 1.3 试验仪器与试剂 | 第35页 |
| 1.4 引物的筛选及 PCR 扩增 | 第35页 |
| 2 结果 | 第35-41页 |
| 2.1 家系间遗传多样性分析 | 第36-39页 |
| 2.2 家系间遗传分化 | 第39-41页 |
| 3 讨论 | 第41-43页 |
| 3.1 三个大鳞副泥鳅家系间的遗传多样性 | 第41-42页 |
| 3.2 群体间亲缘关系及遗传分化 | 第42-43页 |
| 试验三 大鳞副泥鳅生长相关分子标记的筛选 | 第43-58页 |
| 1 材料与方法 | 第43-45页 |
| 1.1 样品来源 | 第43页 |
| 1.2 样本群体的养殖与管理 | 第43-44页 |
| 1.3 样品 DNA 的提取 | 第44页 |
| 1.4 试验仪器与试剂 | 第44页 |
| 1.5 引物的筛选及 PCR 扩增 | 第44页 |
| 1.6 数据统计分析 | 第44-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-56页 |
| 2.1 混合群体的 SNP 相关性分析 | 第46-51页 |
| 2.2 家系群体的 SNP 相关性分析 | 第51-56页 |
| 3 讨论 | 第56-58页 |
| 3.1 SNP 标记基因型与性状的关联分析 | 第56-57页 |
| 3.2 SNP 标记的关联分析的应用 | 第57-58页 |
| 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-70页 |
| 攻读学位期间公开发表的论文 | 第70-71页 |
| 附录 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |