| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 研究背景 | 第11-21页 |
| 1.1 盐胁迫对植物的影响 | 第11-14页 |
| 1.1.1 高盐浓度对植物的影响 | 第11-12页 |
| 1.1.2 植物对盐胁迫的响应 | 第12-14页 |
| 1.2 胡杨的研究基础 | 第14-15页 |
| 1.2.1 胡杨基因组研究 | 第14-15页 |
| 1.2.2 胡杨耐盐机制研究进展 | 第15页 |
| 1.3 基于二代测序的转录组分析 | 第15-19页 |
| 1.3.1 二代转录组测序和分析的流程 | 第16-18页 |
| 1.3.2 比较转录组学研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3.3 植物转录组学研究进展 | 第19页 |
| 1.4 研究意义和科学问题 | 第19-21页 |
| 第二章 材料与方法 | 第21-25页 |
| 2.1 样品采集与RNA测序 | 第21页 |
| 2.2 原始序列的处理与比对 | 第21-22页 |
| 2.3 鉴定差异表达基因 | 第22页 |
| 2.4 差异表达基因的K-means聚类分析 | 第22页 |
| 2.5 差异表达基因的功能富集 | 第22-23页 |
| 2.5.1 GO富集 | 第22-23页 |
| 2.5.2 KEGG富集 | 第23页 |
| 2.6 差异表达基因的层级聚类分析 | 第23页 |
| 2.7 差异表达基因GO富集的网络分析 | 第23页 |
| 2.8 实时定量PCR检测 | 第23-25页 |
| 第三章 研究结果与讨论 | 第25-42页 |
| 3.1 测序数据评估并比对到参考基因组 | 第25-27页 |
| 3.1.1 测序结果 | 第25页 |
| 3.1.2 比对结果 | 第25-27页 |
| 3.1.3 样品间相关性 | 第27页 |
| 3.2 不同盐浓度下胡杨差异表达基因的鉴定 | 第27-30页 |
| 3.2.1 差异表达基因的鉴定 | 第27-29页 |
| 3.2.2 两种浓度盐处理下差异表达基因数量的变化 | 第29页 |
| 3.2.3 差异表达基因的功能富集 | 第29-30页 |
| 3.3 不同组织中差异表达基因功能的相似性 | 第30-32页 |
| 3.3.1 差异表达基因的K-means聚类 | 第30-31页 |
| 3.3.2 在四个组织中具有相似表达模式的差异表达基因的功能富集 | 第31-32页 |
| 3.4 胡杨中组织特异的差异表达基因的探究 | 第32-37页 |
| 3.4.1 组织特异的差异表达基因的GO富集 | 第32-34页 |
| 3.4.2 胡杨耐盐相关基因的组织特异性 | 第34-36页 |
| 3.4.3 ROS调节基因在胡杨抗盐过程中起到的作用 | 第36-37页 |
| 3.5 在胡杨四个组织中共同差异表达的基因的特征 | 第37-39页 |
| 3.6 盐胁迫下胡杨中转录因子的作用 | 第39-41页 |
| 3.7 实时定量PCR验证 | 第41-42页 |
| 第四章 总结与展望 | 第42-44页 |
| 4.1 总结 | 第42页 |
| 4.2 展望 | 第42-44页 |
| 附录 | 第44-47页 |
| 参考文献 | 第47-56页 |
| 在学期间研究成果 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
