| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 目录 | 第9-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-45页 |
| 1.1 碱基 | 第14-23页 |
| 1.1.1 碱基简述 | 第14-15页 |
| 1.1.2 碱基的损害性突变 | 第15-16页 |
| 1.1.3 碱基的修饰性突变(甲基化和去甲基化) | 第16-18页 |
| 1.1.4 碱基的人为结构修饰 | 第18-23页 |
| 1.1.4.1 荧光碱基 | 第18-23页 |
| 1.1.4.2 非荧光类人为修饰碱基 | 第23页 |
| 1.2 DNA甲基化/去甲基化过程中特殊碱基的功能与检测 | 第23-41页 |
| 1.2.1 甲基胞嘧啶的功能与检测 | 第24-31页 |
| 1.2.1.1 甲基胞嘧啶的生物学功能 | 第24页 |
| 1.2.1.2 甲基胞嘧啶的检测方法进展 | 第24-31页 |
| 1.2.2 羟甲基胞嘧啶的功能与检测 | 第31-36页 |
| 1.2.2.1 羟甲基胞嘧啶的生物学功能 | 第31页 |
| 1.2.2.2 羟甲基胞嘧啶的检测进展 | 第31-36页 |
| 1.2.3 醛基胞嘧啶的功能与检测 | 第36-40页 |
| 1.2.3.1 醛基胞嘧啶的生物学功能 | 第36-37页 |
| 1.2.3.2 醛基胞嘧啶检测的进展 | 第37-40页 |
| 1.2.3.3 醛基尿嘧啶检测的进展 | 第40页 |
| 1.2.4 羧基胞嘧啶的功能与检测 | 第40-41页 |
| 1.2.4.1 羧基胞嘧啶的生物学功能 | 第40页 |
| 1.2.4.2 羧基胞嘧啶检测的进展 | 第40-41页 |
| 1.3 磷酸水解酶 | 第41-44页 |
| 1.3.1 磷酸水解酶的介绍 | 第41-42页 |
| 1.3.1.1 碱性磷酸酶 | 第41-42页 |
| 1.3.1.2 酸性磷酸酶 | 第42页 |
| 1.3.2 磷酸水解酶的荧光检测进展 | 第42-44页 |
| 1.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第二章 课题设计 | 第45-54页 |
| 2.1 化学检测DNA中醛基胞嘧啶的荧光探针的课题设计 | 第45-48页 |
| 2.1.1 引言 | 第45页 |
| 2.1.2 羟胺荧光探针的设计 | 第45-47页 |
| 2.1.3 荧光标记法检测DNA中醛基胞嘧啶实验设计 | 第47-48页 |
| 2.2 基于化学检测醛基尿嘧啶的荧光脱氧核苷课题设计 | 第48-51页 |
| 2.2.1 引言 | 第48-49页 |
| 2.2.2 与醛基尿嘧啶反应化合物的选择 | 第49页 |
| 2.2.3 邻苯二胺与醛基尿嘧啶反应产生的荧光脱氧核苷 | 第49-50页 |
| 2.2.4 荧光检测醛基脱氧尿苷实验设计 | 第50-51页 |
| 2.3 荧光检测酸性磷酸酶的课题设计 | 第51-54页 |
| 2.3.1 引言 | 第51页 |
| 2.3.2 新型“Turn off/on”策略检测酸性磷酸酶实验设计 | 第51-54页 |
| 第三章 DNA中醛基胞嘧啶的荧光检测方法 | 第54-87页 |
| 3.1 仪器与试剂 | 第54-55页 |
| 3.1.1 仪器 | 第54页 |
| 3.1.2 试剂 | 第54-55页 |
| 3.2 相关化合物合成部分 | 第55-65页 |
| 3.2.1 醛基胞嘧啶荧光探针的合成 | 第55-60页 |
| 3.2.1.1 探针1的合成 | 第56-57页 |
| 3.2.1.2 探针2的合成 | 第57-58页 |
| 3.2.1.3 探针3的合成 | 第58-60页 |
| 3.2.2 相关脱氧核苷衍生物的合成 | 第60-62页 |
| 3.2.2.1 5-醛基-2'-脱氧胞苷(化合物22)的合成 | 第60-61页 |
| 3.2.2.2 探针1与5-醛基-2'-脱氧胞苷(化合物22)的反应得化合物23 | 第61-62页 |
| 3.2.2.3 探针3与5-醛基-2'-脱氧胞苷(化合物22)的反应 | 第62页 |
| 3.2.3 合成部分结果与讨论 | 第62-65页 |
| 3.2.3.1 化合物1的合成 | 第62-63页 |
| 3.2.3.2 化合物2的合成 | 第63-64页 |
| 3.2.3.3 化合物3的合成 | 第64页 |
| 3.2.3.4 化合物22的合成 | 第64页 |
| 3.2.3.5 化合物23的合成 | 第64页 |
| 3.2.3.6 化合物24的合成 | 第64-65页 |
| 3.3 羟胺类荧光探针标记检测DNA中的醛基胞嘧啶 | 第65-85页 |
| 3.3.1 利用HPLC和MALDI-TOF研究羟胺探针标记DNA中醛基胞嘧啶的实验 | 第65-70页 |
| 3.3.1.1 探针与DNA反应和处理的过程 | 第66页 |
| 3.3.1.2 HPLC分析探针标记寡聚核苷酸链中醛基胞嘧啶的结果 | 第66-68页 |
| 3.3.1.3 MALDI-TOF分析探针标记醛基胞嘧啶的结果 | 第68-70页 |
| 3.3.2 运用聚丙烯酰胺凝胶电泳实验验证荧光探针标记DNA中的醛基胞嘧啶 | 第70-76页 |
| 3.3.2.1 变性凝胶电泳 | 第70页 |
| 3.3.2.2 运用变性凝胶电泳实验验证标记反应可行性 | 第70-73页 |
| 3.3.2.3 运用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳实验监测DNA浓度对反应的影响 | 第73-74页 |
| 3.3.2.4 运用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳实验对荧光探针的选择性进行分析 | 第74-76页 |
| 3.3.3 荧光检测法检测DNA中的醛基胞嘧啶 | 第76-79页 |
| 3.3.3.1 探针3与醛基脱氧胞苷反应产物的荧光最大激发和最大发射波长 | 第76-77页 |
| 3.3.3.2 通过荧光检测的方法验证探针3的选择性和应用于定量检测 | 第77-79页 |
| 3.3.3.3 探针与含有醛基胞嘧啶的DNA链反应产物的可视化表现 | 第79页 |
| 3.3.4 小鼠胚胎干细胞基因组DNA中醛基胞嘧啶的检测 | 第79-84页 |
| 3.3.4.1 LC-MS、酶解和基因组提取的实验手段和方法 | 第79-80页 |
| 3.3.4.2 已知序列DNA链与探针反应后经过酶解并并借助LC-MS确认反应脱氧核苷的保留时间 | 第80-83页 |
| 3.3.4.3 通过LC-MS验证探针和基因组中醛基胞嘧啶的反应 | 第83-84页 |
| 3.3.5 结果与讨论 | 第84-85页 |
| 3.3.5.1 HPLC和MALDI-TOF分析荧光探针检测醛基胞嘧啶 | 第84-85页 |
| 3.3.5.2 变性PAGE胶分析检测醛基胞嘧啶的实验 | 第85页 |
| 3.3.5.3 荧光法分析探针检测DNA中醛基胞嘧啶 | 第85页 |
| 3.3.5.4 检测基因组中醛基胞嘧啶的实验结果和讨论 | 第85页 |
| 3.4 本章小结 | 第85-87页 |
| 第四章 基于化学检测醛基尿嘧啶的荧光脱氧核苷的合成和荧光性质的研究 | 第87-110页 |
| 4.1 仪器与试剂 | 第87-88页 |
| 4.1.1 仪器 | 第87页 |
| 4.1.2 试剂 | 第87-88页 |
| 4.2 相关化合物合成部分 | 第88-95页 |
| 4.2.1 醛基脱氧尿苷(化合物12)的合成 | 第88-89页 |
| 4.2.2 基于邻苯二胺和醛基脱氧尿苷的荧光碱基类化合物dUbmz的合成 | 第89-94页 |
| 4.2.3 合成部分的结果与讨论 | 第94-95页 |
| 4.2.3.1 醛基脱氧尿苷的合成 | 第94-95页 |
| 4.2.3.2 化合物dUbmz类的合成 | 第95页 |
| 4.3 基于醛基脱氧尿苷的核苷类似物dUbmz的光学性质和潜在应用 | 第95-109页 |
| 4.3.1 化合物dUbmz的紫外和荧光性质 | 第95-105页 |
| 4.3.1.1 量子荧光产率及其计算 | 第95-96页 |
| 4.3.1.2 苯并咪唑环上取代基对化合物dUbmz荧光的影响 | 第96-97页 |
| 4.3.1.3 化合物dUbmz在不同pH环境下的紫外荧光表现 | 第97-101页 |
| 4.3.1.4 化合物13的荧光性质 | 第101-102页 |
| 4.3.1.5 化合物dUbmz在不同溶剂中的紫外荧光性质 | 第102-105页 |
| 4.3.2 基于尿嘧啶类似物dUbmz的醛基尿嘧啶检测方法的探索 | 第105-108页 |
| 4.3.3 结果与讨论 | 第108-109页 |
| 4.3.3.1 化合物dUbmz的光学性质测算 | 第108页 |
| 4.3.3.2 化合物dUbmz应用性的讨论 | 第108-109页 |
| 4.4 本章小结 | 第109-110页 |
| 第五章 新型“Turn off/on”策略检测酸性磷酸酶活性的荧光方法 | 第110-124页 |
| 5.1 引言 | 第110页 |
| 5.2 仪器与试剂 | 第110-111页 |
| 5.2.1 仪器 | 第110页 |
| 5.2.2 试剂 | 第110-111页 |
| 5.3 利用荧光探针检测酸性磷酸水解酶的活性实验 | 第111-123页 |
| 5.3.1 利用多聚磷酸盐类化合物淬灭探针荧光滴定实验 | 第111-114页 |
| 5.3.2 酸性磷酸酶水解六偏磷酸钠恢复探针荧光实验 | 第114-116页 |
| 5.3.3 酸性磷酸酶水解六偏磷酸钠释放荧光的效率研究 | 第116-117页 |
| 5.3.4 酸性磷酸酶对比其他蛋白质的选择性实验 | 第117-118页 |
| 5.3.5 钼酸钾抑制酸性磷酸酶活性实验 | 第118-119页 |
| 5.3.6 无机盐离子对检测酸性磷酸酶影响的探讨 | 第119-122页 |
| 5.3.7 结果与讨论 | 第122-123页 |
| 5.3.7.1 荧光淬灭实验 | 第122页 |
| 5.3.7.2 荧光恢复实验 | 第122页 |
| 5.3.7.3 酶水解效率的研究实验 | 第122页 |
| 5.3.7.4 选择性实验 | 第122-123页 |
| 5.3.7.5 抑制剂实验 | 第123页 |
| 5.3.7.6 离子干扰实验 | 第123页 |
| 5.4 本章小结 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-146页 |
| 全文总结 | 第146-147页 |
| 发表文章和专利 | 第147-149页 |
| 致谢 | 第149-150页 |
| 缩写词中英文对照 | 第150-152页 |
| 相关化合物的核磁表征 | 第152-170页 |
