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基因表达谱的数据挖掘方法研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
1 绪论第11-27页
    1.1 研究背景及意义第11-17页
        1.1.1 生物信息学第11-12页
        1.1.2 DNA微阵列第12-14页
        1.1.3 基因表达谱数据挖掘第14-16页
        1.1.4 研究意义第16-17页
    1.2 研究现状第17-22页
        1.2.1 特征基因选择第17-20页
        1.2.2 基因表达谱样本分类第20-22页
    1.3 研究内容第22-23页
    1.4 结构安排第23-27页
        1.4.1 论文结构第23页
        1.4.2 章节逻辑关系第23-27页
2 基因表达谱数据挖掘基础理论第27-43页
    2.1 引言第27页
    2.2 特征基因选择第27-33页
        2.2.1 特征基因选择的概念与意义第27-28页
        2.2.2 特征基因的选择过程第28页
        2.2.3 常用特征基因选择方法第28-33页
    2.3 组织样本分类第33-42页
        2.3.1 分类的概念第33-34页
        2.3.2 分类方法第34-37页
        2.3.3 集成分类方法第37-42页
    2.4 小结第42-43页
3 基于优化的邻域互信息的特征基因选择第43-65页
    3.1 引言第43-44页
    3.2 Relief算法和Relief F算法第44-45页
    3.3 邻域互信息模型第45-49页
        3.3.1 互信息第45-46页
        3.3.2 邻域互信息第46-48页
        3.3.3 基于前向贪心搜索策略的邻域互信息的特征基因选择第48-49页
    3.4 优化邻域互信息半径的差分进化算法第49-52页
        3.4.1 差分进化算法第49-50页
        3.4.2 基于差分进化算法优化邻域互信息半径第50-52页
    3.5 本章提出的特征基因选择方法第52-53页
    3.6 仿真实验第53-63页
        3.6.1 实验数据第53-54页
        3.6.2 实验方法与参数设置第54页
        3.6.3 试验结果及分析第54-63页
    3.7 小结第63-65页
4 基于改进的和声搜索算法的特征基因选择第65-85页
    4.1 引言第65-66页
    4.2 Kruskal-Wallis算法第66-67页
    4.3 和声搜索算法的改进第67-70页
        4.3.1 经典和声搜索算法(HS)第67-68页
        4.3.2 改进的和声搜索算法第68-70页
    4.4 本章提出的特征基因选择方法第70-73页
    4.5 仿真实验第73-83页
        4.5.1 实验数据第73-74页
        4.5.2 实验方法与参数设置第74页
        4.5.3 试验结果及分析第74-83页
    4.6 小结第83-85页
5 基于改进的旋转森林算法的集成分类第85-111页
    5.1 引言第85-86页
    5.2 改进的分类信息指数法第86-87页
    5.3 旋转森林第87-89页
        5.3.1 标准旋转森林算法的基本思想第87-88页
        5.3.2 标准旋转森林算法的基本步骤第88-89页
    5.4 极限学习机第89-91页
    5.5 本章提出的基因表达谱分类方法第91-94页
        5.5.1 改进的旋转森林算法第91-93页
        5.5.2 基于改进的旋转森林算法的基因表达谱分类第93-94页
    5.6 仿真实验第94-109页
        5.6.1 实验数据第94-95页
        5.6.2 实验方法与参数设置第95页
        5.6.3 试验结果及分析第95-109页
    5.7 小结第109-111页
6 基于改进的教与学优化算法的选择性集成分类第111-133页
    6.1 引言第111-112页
    6.2 邻域互信息模型第112-113页
    6.3 基于改进的教与学优化算法的基分类器选择第113-120页
        6.3.1 标准教与学优化算法第113-114页
        6.3.2 改进的教与学优化算法(GATLBO)第114-118页
        6.3.3 基于GATLBO的基分类器选择性集成第118-120页
    6.4 本章提出的基因表达谱分类方法第120-122页
    6.5 仿真实验第122-131页
        6.5.1 实验数据第122-123页
        6.5.2 实验方法与参数设置第123-124页
        6.5.3 试验结果及分析第124-131页
    6.6 小结第131-133页
7 总结与展望第133-135页
    7.1 本文工作小结第133-134页
    7.2 进一步研究的问题第134-135页
参考文献第135-149页
致谢第149-151页
攻读博士学位期间发表的学术论文和参加科研情况第151-153页

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