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担子菌毛头鬼伞的TMV抗性蛋白y3基因的分离、鉴定和表达

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
缩略语表第7-17页
第一章 绪论第17-42页
   ·真菌资源生物活性蛋白质的研究第17-31页
     ·核糖体失活蛋白第18-20页
     ·抗真菌蛋白质第20-21页
     ·类-泛素蛋白质第21-23页
     ·免疫调节蛋白第23-25页
     ·漆酶第25-26页
     ·凝集素第26-30页
     ·抗动植物病毒蛋白第30-31页
   ·真菌具生物活性蛋白质基因的结构研究与异源表达第31-36页
     ·真菌具生物活性蛋白质基因的分离与结构研究第31-33页
     ·真菌具生物活性蛋白质基因的克隆与异源表达第33-35页
     ·真菌具有物活性蛋白质表达体系第35-36页
       ·大肠杆菌表达体系第35页
       ·植物表达体系第35-36页
       ·酵母菌表达体系第36页
       ·丝状真菌表达体系第36页
   ·毛头鬼伞的生物活性物质第36-39页
     ·毛头鬼伞的概况第36-37页
     ·毛头鬼伞的活性多糖成分第37-38页
     ·毛头鬼伞的生物活性蛋白第38-39页
     ·毛头鬼伞的其他活性第39页
   ·本研究的目的、内容和意义第39-42页
     ·本研究的目的第39-40页
     ·本研究的内容第40-41页
     ·本研究的意义第41-42页
第二章 抗性蛋白y3基因的DNA全长序列的分离第42-60页
   ·实验材料第42-44页
     ·实验用菌种第42页
     ·载体第42页
     ·生物信息软件及网络资源第42页
     ·接头和引物第42-43页
     ·试剂及试剂盒第43页
     ·主要试剂的配制第43-44页
       ·培养基第43页
       ·真菌基因组DNA提取用试剂第43页
       ·细菌质粒DNA提取用试剂第43-44页
       ·细菌感受态细胞制备用试剂第44页
     ·DNA琼脂糖凝胶电泳第44页
   ·实验方法第44-53页
     ·菌种的培养和菌丝体的准备第44页
     ·基因组DNA的提取第44-45页
     ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第45-46页
       ·菌种的活化和培养第45页
       ·感受态的制备第45-46页
     ·YADE法分离基因y3DNA全长序列的策略第46-47页
     ·用YADE法扩增基因y3 5'-末端和3'-末端第47-49页
       ·DNA的酶切第47-48页
       ·接头的制备第48页
       ·连接第48-49页
       ·PCR扩增第49页
     ·扩增产物的电泳分离第49-50页
     ·琼脂糖凝胶中核酸片段的回收第50页
     ·回收片段与T-载体连接第50页
     ·大肠杆菌DH5α感受态细胞转化第50-51页
     ·质粒DNA的提取第51-52页
     ·重组质粒DNA的双酶切和PCR鉴定第52-53页
       ·重组质粒DNA的双酶切鉴定第52页
       ·重组质粒DNA的PCR鉴定第52-53页
     ·基因分离产物的序列测定第53页
     ·抗性蛋白y3基因DNA拟是全长序列的推测与分析第53页
   ·结果与分析第53-58页
     ·基因组DNA酶切与抗性蛋白基因y3 5'-末端和3'-末端的PCR扩增结果第53-55页
     ·抗性蛋白y3基因5'-末端和3'-末端的PCR扩增产物与T-载体的连接第55-56页
     ·基因分离产物的序列测定结果第56-57页
       ·抗性蛋白y3基因的5'-末端的测序结果第56页
       ·抗性蛋白y3基因的3'-末端的测序结果第56-57页
     ·抗性蛋白y3基因的DNA拟是全长序列的推测第57-58页
   ·讨论与小结第58-60页
     ·YADE方法在TMV抗性蛋白y3基因的拟是全长DNA序列扩增中应用第58-59页
     ·YADE方法用于分离基因DNA序列的优点第59-60页
第三章 抗性蛋白y3基因的cDNA全长序列的克隆第60-78页
   ·实验材料第60-62页
     ·实验用菌种第60页
     ·载体第60页
     ·生物信息软件及网络资源第60页
     ·引物第60-61页
     ·试剂及试剂盒第61页
     ·主要试剂的配制第61-62页
       ·培养基第61-62页
       ·真菌总RNA提取用试剂第62页
       ·细菌质粒DNA提取用试剂第62页
       ·细菌感受态细胞制备用试剂第62页
     ·RNA琼脂糖凝胶电泳第62页
   ·实验方法第62-72页
     ·菌种的培养和菌丝体的准备第62-63页
     ·真菌菌丝体总RNA提取及残余DNA的去除第63-64页
       ·真菌菌丝体总RNA提取第63-64页
       ·真菌总RNA中残余DNA的去除第64页
     ·大肠杆菌TOP10感受态细胞的制备第64-65页
     ·用5'-RACE分离抗性蛋白y3基因5'-末端序列的策略第65页
     ·用5'-RACE分离y3基因5'-末端序列的操作第65-68页
       ·cDNA第一链的合成第66页
       ·Hybrid RNA的分解第66页
       ·单链cDNA环化或形成首尾连接物第66-67页
       ·5'-末端未知序列的PCR扩增第67-68页
     ·扩增产物的电泳分离、核酸片段的回收、T-载体连接第68页
       ·扩增产物的电泳分离第68页
       ·琼脂糖凝胶中核酸片段的回收第68页
       ·回收片段与pMD18-T载体连接第68页
     ·大肠杆菌TOP10感受态细胞转化第68-69页
     ·质粒DNA的提取第69页
     ·重组质粒DNA的双酶切和PCR鉴定第69-70页
       ·重组质粒DNA的双酶切鉴定第69页
       ·重组质粒DNA的PCR鉴定第69-70页
     ·基因克隆产物的序列测定第70页
     ·克隆抗性蛋白y3基因的cDNA全长序列用引物的设计第70页
     ·用RT-PCR扩增抗性蛋白y3基因的cDNA全长序列第70-72页
       ·cDNA第一链的合成第70-71页
       ·cDNA全长序列的PCR扩增第71-72页
     ·扩增产物的电泳分离、胶回收、T-载体连接、转化与检测第72页
       ·扩增产物的电泳分离第72页
       ·琼脂糖凝胶中核酸片段的回收第72页
       ·回收片段与pMD18-T载体连接第72页
       ·大肠杆菌TOP10感受态细胞转化第72页
       ·质粒DNA的提取第72页
       ·重组质粒DNA的双酶切和PCR检测第72页
     ·抗性蛋白y3基因拟是cDNA全长序列的测定第72页
     ·抗性蛋白y3基因拟是cDNA全长序列的分析第72页
   ·结果与分析第72-77页
     ·抗性蛋白y3基因5'-RACE的结果第72-74页
     ·抗性蛋白基因cDNA全长序列的扩增第74页
     ·本研究所得cDNA序列与抗性蛋白Y3的cDNA序列的同源性比较第74-75页
     ·出自毛头鬼伞的一条新28S rRNA序列的发现和测序第75-77页
   ·讨论与小结第77-78页
     ·核酸提取方法第77页
     ·关于5'-RACE方法的讨论第77页
     ·y3基因全长序列的同源性分析第77页
     ·012-019 片段的发现的启示第77-78页
第四章 抗性蛋白y3基因的结构分析与28S rRNA的同源性探讨第78-90页
   ·抗性蛋白y3基因的结构分析第78-81页
     ·材料与方法第78页
     ·结果与分析第78-81页
       ·抗性蛋白基因y3的DNA与cDNA的结构比较分析第78-79页
       ·由cDNA序列推导的抗性蛋白Y3的氨基酸序列第79-80页
       ·抗性蛋白y3基因的cDNA序列与氨基酸序列比较第80页
       ·由cDNA序列推导的的氨基酸序列与先前报导的抗性蛋白Y3序列的比较第80-81页
     ·讨论与小结第81页
   ·毛头鬼伞中一条新28S rRNA同源性分析第81-90页
     ·材料和方法第81-84页
       ·生物学分析软件及聚类分析第81-82页
       ·聚类分析中参考的真菌核酸序列第82-84页
         ·来源于鬼伞属真菌的核酸序列第82-83页
         ·来源于非鬼伞属真菌的核酸序列第83-84页
     ·结果与分析第84-88页
       ·012-019片段在NCBI中的BLAST结果第84页
       ·聚类分析结果第84-88页
       ·不同基因之间同源序列区域与PCR扩增出现非目的片段之间的关系分析第88页
     ·讨论与小结第88-90页
       ·关于片段012-019的同源性确定第88-89页
       ·关于鬼伞属核糖体RNA(rRNA)的结构探讨第89页
       ·关于PCR扩增过程中出现非目的条带的讨论第89-90页
第五章 抗性蛋白y3基因的植物表达质粒构建及烟草转化第90-108页
   ·实验材料第90-93页
     ·实验用菌种和植物第90页
     ·载体第90页
     ·生物信息软件及网络资源第90页
     ·引物第90-91页
     ·试剂及试剂盒第91页
     ·主要试剂的配制第91-93页
       ·培养基第91页
       ·DNA和RNA提取用试剂第91-92页
       ·细菌质粒DNA提取实验所用试剂第92页
       ·细菌感受态细胞制备所用试剂第92页
       ·琼脂糖凝胶电泳第92页
       ·Northern blot及核酸杂交用试剂第92页
       ·常用抗生素第92-93页
   ·实验方法第93-102页
     ·真菌、植物培养及实验准备第93页
       ·真菌培养第93页
       ·植物培养第93页
     ·感受态细胞的制备第93页
       ·大肠杆菌TOP10感受态细胞的制备第93页
       ·农杆菌LBA4404感受态细胞的制备第93页
     ·真菌菌丝体总RNA提取及残余DNA的去除第93页
     ·用于植物表达质粒构建的y3基因全长cDNA序列的扩增第93-94页
     ·扩增产物的电泳分离、胶回收、T-载体连接、转化与检测、序列测定等第94页
     ·抗性蛋白y3基因的植物表达质粒的构建第94-97页
       ·y3基因植物表达质粒构建的策略第94页
       ·y3基因与植物表达载体pBI121的重组第94页
       ·pBI121-y3与植物双元表达载体pCAMBIA1301的重组第94-95页
       ·重组质粒的鉴定第95-97页
     ·用于农杆菌转化的pCAMBIA1301-y3质粒DNA的制备第97页
     ·农杆菌感受态细胞冻融法转化第97-98页
       ·pCAMBIA1301-y3质粒冻融法转化农杆菌感受态细胞第97-98页
       ·由农杆菌细胞中提取重组质粒DNA第98页
       ·农杆菌重组质粒DNA的PCR及酶切鉴定第98页
     ·抗性蛋白y3基因的植物表达质粒叶盘法转化烟草第98页
     ·转基因阳性植株的筛选第98-99页
       ·转基因阳性植株的PCR筛选第98-99页
       ·转基因阳性植株的RT-PCR筛选第99页
     ·转基因阳性植株的鉴定第99-102页
       ·用Northern Blot鉴定y3基因在转基因烟草中的表达第99-101页
       ·用接种TMV的方法鉴定y3基因产物在转基因烟草中的抗病毒活性第101-102页
   ·结果与分析第102-108页
     ·毛头鬼伞y3基因的克隆及植物表达质粒构建第102-103页
     ·毛头鬼伞y3基因转化烟草第103页
     ·转基因烟草的筛选第103-104页
     ·抗性蛋白y3基因在植物体中表达的的鉴定第104-106页
       ·用Northern Blot鉴定y3基因在烟草中的表达第104-105页
       ·y3基因表达产物在转基因烟草中的抗病毒活性第105-106页
     ·讨论与小结第106-108页
结论第108-109页
创新点第109-111页
参考文献第111-121页
攻读博士学位期间取得的科研成果第121-122页
致谢第122-123页

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