摘要 | 第9-12页 |
ABSTRACT | 第12页 |
第一部分 文献综述 | 第17-43页 |
第一章 蛋白质组学研究进展 | 第17-34页 |
1 蛋白质组学与基因组学 | 第17-18页 |
2 差异蛋白质组学 | 第18-24页 |
2.1 双向凝胶电泳 | 第18-20页 |
2.1.1 样品制备 | 第18-19页 |
2.1.2 蛋白等电聚焦电泳 | 第19-20页 |
2.1.3 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第20页 |
2.1.4 蛋白质斑点的检测 | 第20页 |
2.2 荧光双向凝胶内差异电泳 | 第20-22页 |
2.3 稳定同位素代谢标记技术 | 第22页 |
2.4 同位素亲和标签技术 | 第22-23页 |
2.5 SELDI蛋白质芯片技术 | 第23-24页 |
3 功能蛋白质组学 | 第24-34页 |
3.1 质谱技术 | 第24-26页 |
3.1.1 MALDI-MS | 第24-25页 |
3.1.2 ESI-MS | 第25页 |
3.1.3 ESI-三级四极质谱仪 | 第25-26页 |
3.1.4 ESI-离子阱质谱仪 | 第26页 |
3.2 蛋白质鉴定策略 | 第26-29页 |
3.2.1 经典的蛋白质鉴定方法 | 第26-27页 |
3.2.2 以质谱为基础的蛋白质鉴定 | 第27-29页 |
3.3 蛋白质组生物信息学 | 第29-34页 |
3.3.1 蛋白质组数据库 | 第29-32页 |
3.3.2 蛋白质组信息化分析工具 | 第32-34页 |
第二章 昆虫蛋白质组学 | 第34-40页 |
1 一般昆虫蛋白质组学研究 | 第34-35页 |
2 家蚕蛋白质组学 | 第35-40页 |
2.1 家蚕蛋白质组研究样品制备 | 第36-37页 |
2.2 家蚕胚胎蛋白质组研究 | 第37-38页 |
2.3 家蚕丝腺蛋白质组研究 | 第38页 |
2.4 家蚕体壁、脂肪体蛋白质组研究 | 第38-39页 |
2.5 家蚕中肠、血液等其它组织蛋白质组研究 | 第39-40页 |
第三章 家蚕雌性附腺的研究进展 | 第40-43页 |
1 形态学研究 | 第40页 |
2 Ng(No-glue)突变体 | 第40-41页 |
3 发育过程中蛋白质和核酸的变化 | 第41页 |
4 分泌的粘液蛋白的研究 | 第41-43页 |
第二部分 研究内容 | 第43-116页 |
第一章 家蚕部分组织双向凝胶电泳方法的优化 | 第43-63页 |
1 材料和仪器 | 第43-47页 |
1.1 试剂 | 第43-44页 |
1.2 主要试剂的配制 | 第44-46页 |
1.3 主要仪器 | 第46-47页 |
1.3.1 电泳仪器及相关仪器 | 第46页 |
1.3.2 其它仪器设备 | 第46-47页 |
2 蛋白质定量 | 第47页 |
3 家蚕雌性附腺分泌部组织双向凝胶电泳 | 第47-54页 |
3.1 实验材料 | 第47页 |
3.2 蛋白质的提取 | 第47-49页 |
3.3 蛋白质的双向电泳 | 第49-50页 |
3.3.1 第一向固相pH梯度等电聚焦 | 第49页 |
3.3.2 第二向垂直SDS-PAGE | 第49-50页 |
3.4 蛋白质银染 | 第50页 |
3.5 凝胶扫描 | 第50页 |
3.6 图像分析 | 第50-52页 |
3.6.1 蛋白点检测(Spots detection) | 第50-51页 |
3.6.2 背景消减(Background subtraction) | 第51页 |
3.6.3 标准化处理(Normalization) | 第51-52页 |
3.6.4 匹配(Spot matching) | 第52页 |
3.6.5 1 D和2 D校正(1 D and 2 D Calibration) | 第52页 |
3.7 实验结果 | 第52-54页 |
3.7.1 蛋白质的提取率 | 第52-53页 |
3.7.2 性附腺分泌部组织蛋白质双向凝胶电泳图谱 | 第53页 |
3.7.3 双向电泳的分辨率 | 第53-54页 |
3.8 讨论 | 第54页 |
4 家蚕丝腺组织的双向凝胶电泳 | 第54-57页 |
4.1 材料 | 第54页 |
4.2 蛋白质样品的制备 | 第54-55页 |
4.3 第一向固相pH梯度等电聚焦 | 第55页 |
4.4 第二向垂直SDS-PAGE | 第55页 |
4.5 银染 | 第55页 |
4.6 凝胶扫描与图象分析 | 第55页 |
4.7 黄茧雌蚕和白茧雄蚕中部丝腺组织的蛋白质图谱 | 第55-57页 |
5 家蚕中肠双向凝胶电泳 | 第57-58页 |
5.1 材料 | 第57页 |
5.2 蛋白质样品的制备 | 第57页 |
5.3 第一向固相pH梯度等电聚焦 | 第57页 |
5.4 第二向垂直SDS-PAGE | 第57页 |
5.5 银染 | 第57页 |
5.6 凝胶扫描与图象分析 | 第57页 |
5.7 黄茧雌蚕和白茧雄蚕中肠组织的蛋白质图谱 | 第57-58页 |
6 家蚕血液双向凝胶电泳 | 第58-59页 |
6.1 材料 | 第58页 |
6.2 样品制备 | 第58页 |
6.3 第一向固相pH梯度等电聚焦 | 第58-59页 |
6.4 第二向垂直SDS-PAGE | 第59页 |
6.5 银染 | 第59页 |
6.6 凝胶扫描与图象分析 | 第59页 |
6.7 家蚕血液蛋白的2-DE图谱 | 第59页 |
7 讨论 | 第59-63页 |
7.1 蛋白质提取率 | 第59-60页 |
7.2 蛋白质样品制备 | 第60页 |
7.3 双向电泳技术 | 第60-61页 |
7.4 凝胶显色和保存 | 第61页 |
7.5 分辨率 | 第61-62页 |
7.6 实验的重复性 | 第62-63页 |
第二章 不同发育阶段家蚕雌性附腺的蛋白质组研究 | 第63-85页 |
1 家蚕正常雌性附腺及其Ng突变体发育过程中的形态学研究 | 第63-66页 |
2 家蚕雌性附腺发育后期蛋白质双向凝胶电泳谱的建立 | 第66-70页 |
2.1 家蚕正常雌性附腺发育后期蛋白质双向凝胶电泳谱的建立 | 第66-68页 |
2.1.1 实验材料与方法 | 第66页 |
2.1.2 不同发育时期正常雌性附腺的蛋白质表达图谱分析 | 第66页 |
2.1.3 结果与分析 | 第66-68页 |
2.2 家蚕Ng突变体雌性附腺发育后期蛋白质双向凝胶电泳图谱的建立 | 第68页 |
2.2.1 实验材料与方法 | 第68页 |
2.2.2 不同发育时期Ng突变体雌性附腺的蛋白质表达图谱分析 | 第68页 |
2.2.3 结果与分析 | 第68页 |
2.3 讨论 | 第68-70页 |
3 家蚕雌性附腺发育后期的差异蛋白质及MALDI-TOF质谱鉴定 | 第70-85页 |
3.1 差异蛋白质分析 | 第70-72页 |
3.2 MALDI-TOF质谱鉴定 | 第72-74页 |
3.2.1 材料和方法 | 第72-73页 |
3.2.2 MALDI-TOF-MS测定 | 第73-74页 |
3.3 质谱数据的数据库检索 | 第74页 |
3.4 结果 | 第74-81页 |
3.5 讨论 | 第81-85页 |
3.5.1 质谱鉴定蛋白的功能分析 | 第81-83页 |
3.5.2 银染蛋白点的胶内酶解和质谱结果的检索分析 | 第83-85页 |
第三章 家蚕雌性附腺分泌部组织的DIGE分析 | 第85-102页 |
1 材料与方法 | 第85-87页 |
1.1 试剂与仪器 | 第85-86页 |
1.2 材料 | 第86页 |
1.3 样品制备和定量 | 第86页 |
1.4 Cy荧光标记 | 第86页 |
1.5 2-D凝胶电泳 | 第86-87页 |
1.6 DIGE分析 | 第87页 |
2 差异表达蛋白的质谱分析 | 第87-88页 |
2.1 胶内酶解 | 第87-88页 |
2.2 质谱分析 | 第88页 |
3 质谱图的数据库检索 | 第88页 |
4 结果 | 第88-100页 |
4.1 DIGE 2-D电泳图谱 | 第88-89页 |
4.2 差异蛋白质分析 | 第89-94页 |
4.3 差异蛋白点的质谱及生物信息学分析 | 第94-99页 |
4.4 质谱检索结果 | 第99-100页 |
5 结果和讨论 | 第100-102页 |
第四章 家蚕雌性附腺分泌物功能蛋白质组学研究 | 第102-116页 |
1 家蚕雌性附腺分泌蛋白质双向凝胶电泳分析 | 第103页 |
1.1 材料 | 第103页 |
1.2 蛋白质样品的制备 | 第103页 |
1.3 蛋白质的双向电泳 | 第103页 |
1.3.1 第一向固相pH梯度等电聚焦 | 第103页 |
1.3.2 第二向垂直SDS-PAGE | 第103页 |
1.4 蛋白质银染色 | 第103页 |
1.5 凝胶扫描与图像分析 | 第103页 |
2 蛋白质的质谱鉴定 | 第103-104页 |
2.1 蛋白质的胶内酶解 | 第103页 |
2.2 MALDI-TOF质谱分析 | 第103-104页 |
2.3 质谱结果的数据库检索 | 第104页 |
3 结果与分析 | 第104-114页 |
3.1 胶蛋白的二维电泳分离 | 第104-105页 |
3.2 质谱分析结果 | 第105-111页 |
3.3 质谱检索结果 | 第111-114页 |
4 讨论 | 第114-116页 |
参考文献 | 第116-130页 |
结论 | 第130-132页 |
附录Ⅰ | 第132-134页 |
附录Ⅱ | 第134-136页 |
致谢 | 第136页 |