| 摘要 | 第9-13页 |
| ABSTRACT | 第13-17页 |
| 第1章 文献综述 | 第18-36页 |
| 1.1 叶色突变的分子机制 | 第18-21页 |
| 1.1.1 叶绿素生物合成途径相关基因突变 | 第18页 |
| 1.1.2 叶绿素生物降解途径相关基因突变 | 第18-20页 |
| 1.1.3 质核信号传导途径受阻 | 第20-21页 |
| 1.1.4 叶绿体的形成和发育受阻 | 第21页 |
| 1.2 叶绿体的结构特征 | 第21-23页 |
| 1.2.1 叶绿体及其结构特征 | 第21-22页 |
| 1.2.2 叶绿体基因组结构特征 | 第22页 |
| 1.2.3 叶绿体基因及其转录 | 第22-23页 |
| 1.3 叶绿体蛋白及其运输 | 第23-36页 |
| 1.3.1 叶绿体蛋白从细胞质到外被膜表层的定位 | 第24-25页 |
| 1.3.2 叶绿体外被膜蛋白的运输及Toc通道 | 第25-26页 |
| 1.3.2.1 叶绿体外被膜蛋白的运输 | 第25-26页 |
| 1.3.2.2 Toc通道 | 第26页 |
| 1.3.3 叶绿体膜间隙蛋白的运输及膜间隙通道 | 第26-27页 |
| 1.3.3.1 叶绿体膜间隙蛋白的运输 | 第26-27页 |
| 1.3.3.2 叶绿体膜间隙通道 | 第27页 |
| 1.3.4 叶绿体内被膜蛋白的运输及Tic通道 | 第27-28页 |
| 1.3.4.1 叶绿体内被膜蛋白的运输 | 第27页 |
| 1.3.4.2 Tic通道 | 第27-28页 |
| 1.3.5 Toc/Tic通道 | 第28-29页 |
| 1.3.6 叶绿体前体蛋白在叶绿体基质中的加工和运输 | 第29-30页 |
| 1.3.7 叶绿体类囊体膜和类囊体腔蛋白的运输 | 第30-36页 |
| 1.3.7.1 cp Sec途径 | 第31-32页 |
| 1.3.7.2 cp Tat途径 | 第32页 |
| 1.3.7.3 cp SRP途径 | 第32-34页 |
| 1.3.7.4 自发插入途径 | 第34-36页 |
| 第2章 水稻黄绿叶基因YGL9的克隆与功能分析 | 第36-86页 |
| 2.1 引言 | 第36页 |
| 2.2 材料 | 第36-38页 |
| 2.2.1 植物材料 | 第36页 |
| 2.2.2 主要菌株和质粒 | 第36-37页 |
| 2.2.3 主要试剂、试剂盒和仪器 | 第37页 |
| 2.2.4 主要培养基配方 | 第37-38页 |
| 2.3 方法与步骤 | 第38-55页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
| 2.3.2 大肠杆菌感受态的制备 | 第39-40页 |
| 2.3.3 质粒提取 | 第40-41页 |
| 2.3.4 YGL9候选基因的克隆与序列分析 | 第41页 |
| 2.3.5 载体设计与构建 | 第41-43页 |
| 2.3.5.1 YGL9互补载体的构建 | 第41-42页 |
| 2.3.5.2 YGL9超表达载体的构建 | 第42页 |
| 2.3.5.3 YGL9亚细胞定位载体的构建 | 第42-43页 |
| 2.3.6 亚细胞定位 | 第43-44页 |
| 2.3.6.1 水稻原生质体的制备 | 第43页 |
| 2.3.6.2 质粒DNA转化原生质体 | 第43-44页 |
| 2.3.7 光合色素含量的测定 | 第44页 |
| 2.3.8 基因表达分析 | 第44-47页 |
| 2.3.8.1 RNA的提取 | 第44-45页 |
| 2.3.8.2 c DNA第一链的合成 | 第45-46页 |
| 2.3.8.3 q RT-PCR表达分析 | 第46-47页 |
| 2.3.9 YGL9生物信息学分析 | 第47-48页 |
| 2.3.9.1 YGL9蛋白结构分析 | 第47页 |
| 2.3.9.2 YGL9系统进化树的构建 | 第47-48页 |
| 2.3.10 预测互作蛋白编码基因的克隆与生物信息学分析 | 第48-50页 |
| 2.3.10.1 互作蛋白的预测与分析 | 第48页 |
| 3.3.10.2 预测互作蛋白编码基因的克隆及其序列分析 | 第48-49页 |
| 2.3.10.3 预测互作蛋白的结构分析 | 第49页 |
| 2.3.10.4 预测互作蛋白亚细胞定位载体的构建 | 第49-50页 |
| 2.3.10.5 预测互作蛋白系统进化树的构建 | 第50页 |
| 2.3.10.6 ygl9突变体中预测互作蛋白编码基因的表达分析 | 第50页 |
| 2.3.11 酵母双杂交实验 | 第50-55页 |
| 2.3.11.1 诱饵载体与猎物载体的构建 | 第50-52页 |
| 2.3.11.2 酵母感受态细胞的制备 | 第52页 |
| 2.3.11.3 目标质粒转化酵母感受态细胞 | 第52-53页 |
| 2.3.11.4 诱饵蛋白毒性及其自身转录激活活性检测 | 第53-54页 |
| 2.3.11.5 酵母融合及互作蛋白的检测 | 第54页 |
| 2.3.11.6 质粒共转鉴定蛋白的互作 | 第54-55页 |
| 2.4 结果与分析 | 第55-79页 |
| 2.4.1 YGL9候选基因的克隆与序列分析 | 第55-57页 |
| 2.4.2 YGL9基因功能互补验证 | 第57-59页 |
| 2.4.3 YGL9基因器官特异表达分析 | 第59页 |
| 2.4.4 光合色素代谢以及叶绿体发育和光合相关基因的表达分析 | 第59-62页 |
| 2.4.5 YGL9基因超表达分析 | 第62-63页 |
| 2.4.6 YGL9蛋白结构分析 | 第63-64页 |
| 2.4.7 YGL9系统进化分析 | 第64-65页 |
| 2.4.8 YGL9互作蛋白编码基因的克隆及其序列分析 | 第65-73页 |
| 2.4.8.1 YGL9互作蛋白的预测 | 第65-66页 |
| 2.4.8.2 预测的水稻cp SRP54和cp Fts Y的克隆及其序列分析 | 第66-67页 |
| 2.4.8.3 预测的水稻cp SRP54和cp Fts Y的结构分析 | 第67-69页 |
| 2.4.8.4 预测的水稻cp SRP54和cp Fts Y的亚细胞定位 | 第69-71页 |
| 2.4.8.5 预测的水稻cp SRP54和cp Ftsy的系统进化分析 | 第71-72页 |
| 2.4.8.6 ygl9突变体中预测的水稻cp SRP54和cp Ftsy的表达分析 | 第72-73页 |
| 2.4.9 预测的cp SRP54与YGL9以及cp Ftsy的酵母双杂交分析 | 第73-79页 |
| 2.4.9.1 诱饵蛋白自身转录激活活性及毒性检测 | 第73-75页 |
| 2.4.9.2 YGL9与LHCP的L18结构域互作 | 第75-76页 |
| 2.4.9.3 YGL9的Ank1-4 结构域与LHCP的L18结构域互作 | 第76-77页 |
| 2.4.9.4 预测的cp SRP54与YGL9和可能的cp Ftsy均不互作 | 第77-78页 |
| 2.4.9.5 YGL9与LOC_Os11g05552的M-domain互作 | 第78-79页 |
| 2.4.9.6 YGL9的CD2结构域与LOC_Os11g05552的M-domain互作 | 第79页 |
| 2.5 讨论 | 第79-84页 |
| 2.5.1 YGL9影响水稻光合色素代谢以及叶绿体发育和光合相关基因的表达 | 第79-80页 |
| 2.5.2 水稻cp SRP54的鉴定和cp Fts Y的初步鉴定 | 第80-82页 |
| 2.5.3 cp SRP途径所涉及的蛋白具有其他方面的功能 | 第82-83页 |
| 2.5.4 叶绿体基质中可能存在其他的LHCP运输途径 | 第83-84页 |
| 2.6 结论 | 第84-86页 |
| 第3章 水稻黄绿叶基因YGL8的克隆与功能分析 | 第86-100页 |
| 3.1 引言 | 第86页 |
| 3.2 材料 | 第86页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第86页 |
| 3.3 方法与步骤 | 第86-88页 |
| 3.3.1 载体设计与构建 | 第87-88页 |
| 3.3.1.1 YGL8互补载体的构建 | 第87页 |
| 3.3.1.2 YGL8干涉载体的构建 | 第87页 |
| 3.3.1.3 YGL8亚细胞定位载体的构建 | 第87-88页 |
| 3.4 结果与分析 | 第88-95页 |
| 3.4.1 YGL8候选基因的克隆及其序列分析 | 第88-90页 |
| 3.4.2 YGL8基因功能互补验证 | 第90-91页 |
| 3.4.3 YGL8基因的RNA干涉分析 | 第91页 |
| 3.4.5 YGL8基因器官特异表达分析 | 第91-92页 |
| 3.4.6 光合色素代谢以及叶绿体发育和光合相关基因的表达分析 | 第92-93页 |
| 3.4.7 YGL8蛋白结构及其系统进化分析 | 第93-95页 |
| 3.5 讨论 | 第95-97页 |
| 3.5.1 UMP激酶对生物细胞的正常生长和发育起重要作用 | 第95-97页 |
| 3.5.2 YGL8影响水稻光合色素代谢以及叶绿体发育和光合相关基因的表达 | 第97页 |
| 3.6 结论 | 第97-100页 |
| 附件 | 第100-108页 |
| 参考文献 | 第108-120页 |
| 致谢 | 第120-122页 |
| 发表论文及参加课题一览表 | 第122页 |
