| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-21页 |
| 1.1 柿属植物概述 | 第11-14页 |
| 1.1.1 柿属植物资源及其分布 | 第11-12页 |
| 1.1.2 柿属植物的生物学特性 | 第12页 |
| 1.1.3 柿属植物的起源与系统发育研究 | 第12-14页 |
| 1.2 叶绿体基因组概述 | 第14-18页 |
| 1.2.1 叶绿体基因组结构及功能 | 第14-15页 |
| 1.2.2 叶绿体基因组测序 | 第15-16页 |
| 1.2.3 叶绿体基因组在植物系统发育上的应用 | 第16-18页 |
| 1.3 研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 1.4 研究的主要内容 | 第19页 |
| 1.5 课题来源 | 第19-21页 |
| 第2章 柿属植物叶绿体全基因组测序 | 第21-45页 |
| 2.1 材料和方法 | 第21-23页 |
| 2.1.1 研究材料 | 第21-22页 |
| 2.1.2 叶绿体DNA提取、文库构建及测序 | 第22页 |
| 2.1.3 叶绿体基因组组装 | 第22页 |
| 2.1.4 叶绿体基因注释与全序列比对 | 第22-23页 |
| 2.1.5 系统发育分析 | 第23页 |
| 2.2 结果与分析 | 第23-42页 |
| 2.2.1 柿属植物叶绿体基因组特征 | 第23-26页 |
| 2.2.2 柿属植物叶绿体基因重复序列及微卫星位点检测 | 第26-37页 |
| 2.2.3 五个柿属植物叶绿体基因组差异分析 | 第37-38页 |
| 2.2.4 柿属植物与杜鹃花目植物叶绿体基因组全序列比对分析 | 第38-41页 |
| 2.2.5 柿属植物系统发育分析 | 第41-42页 |
| 2.3 讨论 | 第42-45页 |
| 第3章 柿属植物亲缘关系研究 | 第45-63页 |
| 3.1 材料和方法 | 第46-51页 |
| 3.1.1 基于cpDNA trnQ-rps16序列分析柿属植物亲缘关系 | 第46-47页 |
| 3.1.2 基于cpDNA高变区PCR-RFLP分析柿及其近缘种的亲缘关系 | 第47-49页 |
| 3.1.3 基于cpDNA ndhA和nrDNA ITS序列分析柿及其近缘种的亲缘关系 | 第49-51页 |
| 3.1.4 基于cpDNA测序结果分析柿及其近缘种的亲缘关系 | 第51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-61页 |
| 3.2.1 基于cpDNA trnQ-rps16序列分析柿属植物的系统进化关系 | 第52-53页 |
| 3.2.2 基于cpDNA高变区序列PCR-RFLP分析柿及其近缘种亲缘关系 | 第53-57页 |
| 3.2.3 基于cpDNA ndhA和nrDNA ITS序列分析柿及其近缘种亲缘关系 | 第57-60页 |
| 3.2.4 基于cpDNA序列分析柿及其近缘种亲缘关系 | 第60-61页 |
| 3.3 讨论 | 第61-63页 |
| 第4章 柿属植物cpDNA分子标记开发及遗传变异研究 | 第63-73页 |
| 4.1 材料和方法 | 第63-67页 |
| 4.1.1 柿属叶绿体基因组分子标记开发 | 第63-65页 |
| 4.1.2 基于ITS序列变异分析栽培柿品种间遗传变异 | 第65-67页 |
| 4.2 结果与分析 | 第67-71页 |
| 4.2.1 柿属叶绿体基因组分子标记开发 | 第67-70页 |
| 4.2.2 基于ITS序列变异位点分析栽培柿种内遗传变异 | 第70-71页 |
| 4.3 讨论 | 第71-73页 |
| 第5章 研究结论、创新点和研究展望 | 第73-77页 |
| 5.1 研究结论 | 第73-74页 |
| 5.2 创新点 | 第74-75页 |
| 5.3 研究展望 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-91页 |
| 附录 | 第91-101页 |
| 攻读博士期间发表的学术论文 | 第101-102页 |
| 致谢 | 第102页 |
