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Ubp2特异性调控Lsb1泛素链状态及其功能的定量蛋白质组学研究

缩略词表第7-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-11页
1.引言第12-17页
    1.1 泛素化系统简介第12-14页
    1.2 Lsb1功能以及泛素化研究进展第14-15页
    1.3 SILAC定量蛋白质组学与泛素链第15-16页
    1.4 课题研究内容和创新及意义第16-17页
        1.4.1 研究内容第16页
        1.4.2 课题意义第16-17页
2.实验仪器、材料和方法第17-29页
    2.1 实验材料第17-18页
    2.2 实验仪器及试剂第18-21页
    2.3 方法第21-29页
        2.3.1 PCR扩增第21-22页
        2.3.2 目的片段的回收第22页
        2.3.3 化学转化与筛选第22-23页
        2.3.4 Lsb1-HB质粒的构建第23页
        2.3.5 Lsb1位点突变质粒的构建第23-24页
        2.3.6 Lsb1-HB生长曲线测定第24页
        2.3.7 Lsb1-HB SILAC标记第24页
        2.3.8 Lsb1-HB串联纯化第24-25页
        2.3.9 银染第25页
        2.3.10 Western Blot检测样品信号第25-26页
        2.3.11 Lsb1-HB质谱样品制备第26页
        2.3.12 Stage tip分离第26页
        2.3.13 Lsb1-HB LC-MS/MS检测第26-27页
        2.3.14 SRM定向测定泛素链的变化第27页
        2.3.15 数据分析第27-28页
        2.3.16 GO功能分析第28页
        2.3.17 点板实验第28-29页
3. 实验结果与讨论第29-57页
    3.1 Ubp2参与Lsb1泛素化修饰调控第29-31页
    3.2 Lsb1敲除菌株和过表达菌株的构建第31-35页
        3.2.1 Lsb1敲除菌株的构建第31-32页
        3.2.2 Lsb1-HB及其位点突变菌株的构建第32-35页
    3.3 Lsb1的变性纯化及质谱分析第35-40页
        3.3.1 Lsb1及其突变株的变性纯化第35-37页
        3.3.2 Lsb1纯化样品的质谱鉴定第37-40页
    3.4 SILAC定量研究Lsb1泛素化水平第40-44页
    3.5 SILAC定量研究Lsb1相互作用蛋白第44-48页
        3.5.1 筛选Lsb1相互作用蛋白流程图第44-45页
        3.5.2 Lsb1相互作用蛋白的筛选和功能分析第45-47页
        3.5.3 参与Lsb1泛素化调控的去泛素化酶第47-48页
    3.6 Lsb1特定泛素化位点的泛素链结合蛋白的筛选第48-55页
        3.6.1 筛选策略第50-51页
        3.6.2 Lsb1泛素化位点上泛素链的结合蛋白筛选第51-52页
        3.6.3 Lsb1泛素链特异性底物的功能分析第52-55页
    3.7 Lsb1敲除和过表达菌株的表型第55-57页
        3.7.1 Lsb1敲除和过表达菌株生长曲线测定第55页
        3.7.2 Lsb1敲除和过表达菌株影响酵母支链氨基酸的合成第55-57页
4. 讨论第57-61页
    4.1 Lsb1新的泛素化位点的发现第57页
    4.2 突变Lsb1的主要泛素化位点影响Lsb1的含量第57-58页
    4.3 Lsb1泛素链及其DUBs的研究第58-59页
    4.4 Lsb1相互作用蛋白研究第59页
    4.5 Lsb1泛素化位点上泛素链的结合蛋白筛选和表型验证第59-61页
5. 结论第61-62页
6. 参考文献第62-66页
7. 附录第66-69页
    附录 1. SRM靶向检测泛素、泛素链以及Lsb1泛素化位点的含量第66-67页
    附录 2. 潜在的Lsb1泛素链结合蛋白第67-69页
个人简历第69-70页
科研成果和所获荣誉第70-71页
致谢第71-73页
综述第73-84页
    参考文献第82-84页

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