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油菜主花序角果密度和籽粒着生密度全基因组关联分析

摘要第7-9页
Abstrac第9-11页
第1章 文献综述第12-28页
    1.1 油菜概述第12-13页
        1.1.1 油菜的起源第12页
        1.1.2 油菜的经济价值第12-13页
        1.1.3 油菜的生产现状第13页
    1.2 角果相关性状对油菜产量的影响第13-14页
    1.3 油菜角果密度和籽粒着生密度遗传研究进展第14-19页
        1.3.1 油菜长角果突变体的研究进展第14页
        1.3.2 油菜角果密度和籽粒着生密度及其相关性状的基础遗传分析第14-15页
        1.3.3 油菜角果密度及其相关性状QTL定位的研究进展第15-17页
        1.3.4 油菜籽粒着生密度及其相关性状QTL定位的研究进展第17-19页
    1.4 常见分子标记第19-20页
        1.4.1 常见分子标记种类及其特点第19页
        1.4.2 SNP标记第19-20页
    1.5 作物数量性状位点的解析方法第20-21页
        1.5.1 基于连锁作图的QTL定位第20-21页
        1.5.2 基于连锁不平衡的关联分析第21页
    1.6 关联分析第21-25页
        1.6.1 关联分析的理论基础一连锁不平衡第21-22页
        1.6.2 影响LD衰减的因素第22-23页
        1.6.3 关联分析的基本方法第23-25页
    1.7 关联分析在植物研究中的运用第25页
    1.8 关联分析在油菜中的应用第25-28页
第2章 引言第28-30页
    2.1 研究目的和意义第28页
    2.2 主要研究内容第28-29页
    2.3 技术路线第29-30页
第3章 材料与方法第30-34页
    3.1 材料来源第30页
    3.2 田间试验及性状调查第30页
    3.3 基因型分析第30-31页
    3.4 数据处理第31-33页
        3.4.1 表型数据分析第31页
        3.4.2 群体结构分析第31页
        3.4.3 亲缘关系分析第31-32页
        3.4.4 连锁不平衡的衰减第32页
        3.4.5 关联分析第32-33页
    3.5 候选基因预测第33-34页
第4章 结果与分析第34-56页
    4.1 油菜主花序角果密度和籽粒着生密度及其相关性状的表型分析第34-37页
        4.1.1 油菜主花序角果密度和籽粒着生密度及其相关性状的表型描述第34-37页
        4.1.2 油菜主花序角果密度和籽粒着生密度及其相关性状的相关性分析第37页
    4.2 SNP标记分析第37-38页
    4.3 群体结构第38-39页
    4.4 亲缘关系第39-40页
    4.5 连锁不平衡在A、C基因组中的衰减第40-42页
        4.5.1 连锁不平衡在A、C基因组中的衰减第40-41页
        4.5.2 连锁不平衡在A、C基因组不同染色体的衰减第41-42页
    4.6 油菜主花序角果密度及其相关性状与SNP标记的关联分析第42-46页
        4.6.1 油菜主花序角果密度及其相关性状的6种模型比较第42-44页
        4.6.2 油菜主花序角果密度及其相关性状关联的SNP标记第44-46页
    4.7 籽粒着生密度及其相关性状与SNP标记的关联分析第46-49页
        4.7.1 油菜籽粒着生密度及其相关性状的6种模型比较第46-47页
        4.7.2 油菜籽粒着生密度及其相关性状关联的SNP标记第47-49页
    4.8 主花序角果密度和籽粒着生密度及其相关性状关联SNP标记比较分析第49-50页
    4.9 候选基因预测第50-56页
        4.9.1 油菜主花序角果密度及其相关性状候选基因预测第50-54页
        4.9.2 油菜籽粒着生密度及其相关性状候选基因预测第54-56页
第5章 讨论与结论第56-64页
    5.1 讨论第56-61页
        5.1.1 油菜主花序角果密度和籽粒着生密度及其相关性状的表型分析第56页
        5.1.2 关联分析最优模型的选择第56-57页
        5.1.3 性状与标记关联结果第57-58页
        5.1.4 候选基因分析第58-61页
    5.2 结论第61-64页
参考文献第64-76页
附录第76-80页
致谢第80页

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