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应用焦磷酸测序技术对不同人群肠道微生物群落结构的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一章 绪论第10-19页
   ·人肠道菌群的结构与功能第10-14页
     ·人肠道菌群的结构组成第10页
     ·人肠道菌群的功能第10-12页
     ·影响健康人肠道菌群结构的因素第12-14页
   ·研究人肠道菌群的微生物分子生态学技术及多元统计分析方法第14-17页
     ·微生物分子生态学技术第14-16页
     ·多元统计分析方法第16-17页
   ·人肠道核心菌群的研究第17-18页
   ·本论文研究的背景和研究内容第18-19页
     ·本论文研究的背景第18页
     ·本论文研究的内容第18-19页
第二章 年龄因素对肠道菌群群落结构影响的研究第19-33页
   ·前言第19页
   ·材料与设备第19页
     ·主要试剂第19页
     ·主要仪器和设备第19页
   ·实验方法第19-22页
     ·志愿者招募及样品采集第19-20页
     ·DNA 样品的提取第20-21页
     ·PCR V5-V6 区扩增第21页
     ·样品平衡及测序第21页
     ·高质量序列的提取第21-22页
     ·高质量序列的生物信息学处理第22页
     ·数据的统计分析及图表绘制第22页
     ·核酸登录号第22页
   ·结果和讨论第22-32页
     ·序列丰度和多样性分析第22-25页
     ·基于多元统计方法的婴儿、青年及中年人肠道菌群群落结构的比较分析第25-28页
     ·基于门属水平的不同年龄段居民肠道微生物构成的研究第28-32页
   ·本章小结第32-33页
第三章 城市和藏区居民肠道菌群群落结构研究第33-49页
   ·前言第33-34页
   ·材料与设备第34页
     ·主要试剂第34页
     ·主要仪器和设备第34页
   ·实验方法第34-36页
     ·志愿者招募及样品采集第34页
     ·DNA 样品的提取第34页
     ·454 焦磷酸高通量测序第34页
     ·乳杆菌属和双歧杆菌属类群特异性 PCR 扩增及 DGGE 分析第34-35页
     ·实时荧光定量 PCR(q-PCR)第35-36页
     ·数据的统计分析及图表绘制第36页
     ·核酸登录号第36页
   ·结果和讨论第36-48页
     ·序列丰度和多样性分析第36-39页
     ·基于门属水平的藏族居民肠道微生物构成的研究第39-40页
     ·基于多元统计方法的藏族城市居民和藏区牧民肠道菌群群落结构的比较分析第40-45页
     ·乳杆菌属和双歧杆菌属类群定性分析结果第45-47页
     ·q-PCR 结果第47-48页
   ·本章小结第48-49页
第四章 不同种族居民肠道菌群群落结构研究第49-60页
   ·前言第49页
   ·材料与设备第49页
     ·主要试剂第49页
     ·主要仪器和设备第49页
   ·实验方法第49-50页
     ·志愿者招募及样品采集第49-50页
     ·DNA 样品的提取第50页
     ·454 焦磷酸高通量测序第50页
     ·乳杆菌属和双歧杆菌属类群特异性 PCR 扩增及 DGGE 分析第50页
     ·数据的统计分析及图表绘制第50页
     ·核酸登录号第50页
   ·结果和讨论第50-59页
     ·序列丰度和多样性分析第50-52页
     ·基于门属水平的维吾尔族和哈萨克族居民肠道微生物构成的研究第52-54页
     ·基于多元统计方法的哈萨克族和维吾尔族居民肠道菌群群落结构的比较分析第54-58页
     ·乳杆菌属和双歧杆菌属类群定性分析结果第58-59页
   ·本章小结第59-60页
第五章 92例志愿者肠道核心及关键菌群的分析第60-68页
   ·前言第60页
   ·材料与设备第60页
     ·主要试剂第60页
     ·主要仪器和设备第60页
   ·实验方法第60页
   ·结果和讨论第60-65页
     ·不同民族健康居民肠道菌群中产短链脂肪酸细菌的分析第60-62页
     ·基于多元统计方法的各民族居民肠道菌群群落结构的比较分析第62-65页
     ·各民族居民肠道菌群关键 OTUs 的分析第65页
   ·本章小结第65-68页
第六章 益生菌和菊粉血脂调节功能的荟萃分析第68-83页
   ·前言第68-69页
   ·试验方法第69-70页
     ·文献检索第69页
     ·文献纳入标准第69页
     ·数据提取第69页
     ·数据分析第69-70页
   ·结果和讨论第70-82页
     ·益生菌血脂调节作用的荟萃分析第70-76页
     ·菊粉血脂调节作用的荟萃分析第76-82页
     ·益生菌和菊粉血脂调节作用荟萃分析的不足第82页
   ·本章小结第82-83页
主要结论与展望第83-85页
 主要结论第83页
 展望第83-85页
创新点第85-86页
致谢第86-88页
参考文献第88-100页
附录:作者在攻读博士学位期间发表的论文第100页

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